More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1713 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1713  FUR family transcriptional regulator  100 
 
 		 136 aa  274  4e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0366911  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1445  FUR family transcriptional regulator  97.79 
 
 		 136 aa  268  2e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0423256  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3007  ferric uptake regulator, Fur family  39.69 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0515  ferric uptake regulator, Fur family  35.07 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0546  ferric uptake regulator family protein  32.06 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  35.56 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  32.14 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  32.14 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  32.14 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  33.83 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1892  Fur family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  35.07 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  35.07 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  35.07 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  33.58 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  32.84 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2790  ferric uptake regulator family protein  35.46 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000512773  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  34.33 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  34.33 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  34.33 
 
 		 142 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  34.33 
 
 		 142 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  33.58 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2189  ferric uptake regulator, Fur family  35.07 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000532241  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  33.58 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2612  ferric uptake regulator, Fur family  28.68 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0365  ferric uptake regulator, Fur family  33.58 
 
 		 150 aa  70.1  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4224  transcriptional regulator, Fur family  34.04 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00546613  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4160  FUR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4001  FUR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000832394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3832  FUR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3848  FUR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000844204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4115  transcriptional regulator, Fur family  34.04 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5116299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4313  FUR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1799  FUR family manganese uptake regulator  28.69 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  35.07 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1036  transcriptional regulator, Fur family  34.04 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0163253  normal  0.210334 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3922  ferric uptake regulator family protein  34.04 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000572819  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  28.47 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4201  transcriptional regulator, Fur family  34.04 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0217905  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  31.78 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  31.01 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  31.01 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  32.85 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  32.85 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4185  ferric uptake regulator, Fur family  28.36 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.421488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  32.8 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  31.39 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2058  ferric uptake regulator, Fur family  30.53 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0928  FUR family manganese uptake regulator  28.23 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  31.39 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  31.2 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1006  ferric uptake regulator, Fur family  32.88 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000144475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0918  ferric uptake regulator  32.09 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2171  ferric uptake regulator, Fur family  27.42 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00854605  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  30.95 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0940  ferric uptake regulator, Fur family  30.99 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2066  ferric uptake regulator family protein  26.23 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.779744  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1373  ferric uptake regulator, Fur family  35.16 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000536701  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  29.85 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  29.1 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  33.1 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1806  ferric uptake regulator family protein  28 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.696064  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2442  ferric uptake regulator, Fur family  29.69 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168746 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2142  putative ferric uptake regulation protein  28.1 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  30.16 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0939  ferric uptake regulator family protein  27.82 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1772  ferric uptake regulator, Fur family  27.64 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.431388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  28.57 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0020  FUR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147149  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6836  ferric uptake regulator, Fur family  28.15 
 
 		 144 aa  62  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0375  ferric uptake regulator family protein  26.62 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2340  ferric uptake regulator family protein  27.97 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1147  ferric uptake regulator family protein  32.8 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1140  ferric uptake regulator family protein  32 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0967  ferric uptake regulator, Fur family  32.87 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.924679  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0768  iron ABC transporter  28.12 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000612083  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2259  ferric uptake regulator, Fur family  34.78 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1646  ferric-uptake regulator  31.54 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1612  ferric uptake regulator family protein  31.54 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.339502  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5708  ferric uptake regulator, Fur family  28.36 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  34.07 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4742  ferric uptake regulator, Fur family  30.83 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0984  ferric uptake regulator family protein  26.23 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0045  ferric uptake regulator, Fur family  34.38 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.4921e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1472  ferric uptake regulator, Fur family  30.77 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000290418  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  28.57 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_19  transcriptional regulator, Fur family  30.95 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.677591  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0406  ferric uptake regulator, Fur family  26.87 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  27.97 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0577  ferric-uptake regulator  31.88 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0825  ferric uptake regulator family protein  31.09 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0802  ferric uptake regulator family protein  31.09 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1451  ferric uptake regulation protein  31.62 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000060196  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  29.13 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>