232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1467 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1467  transcriptional regulator, Fur family  100 
 
 		 158 aa  326  8e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1183  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 		 158 aa  326  8e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.837957 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3496  ferric uptake regulator, Fur family  47.59 
 
 		 152 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0128  ferric uptake regulator family protein  45.65 
 
 		 169 aa  120  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1335 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0164  putative transcription regulator protein  42.96 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2512  ferric uptake regulator family protein  41.04 
 
 		 201 aa  107  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.450617  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0048  putative transcription regulator protein  41.83 
 
 		 172 aa  106  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1233  ferric uptake regulator family protein  40 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3702  ferric uptake regulator, Fur family  39.74 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3379  ferric uptake regulator, Fur family  39.87 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3018  ferric uptake regulator, Fur family  40.6 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0481144  normal  0.294593 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1930  ferric uptake regulator, Fur family  31.34 
 
 		 144 aa  80.1  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1604  putative transcription regulator protein  35.51 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000436344  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5541  ferric uptake regulator, Fur family  34.04 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.713771 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0747  ferric-uptake regulator  32.84 
 
 		 152 aa  77  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2685  ferric uptake regulator family protein  27.86 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0992523 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1728  ferric uptake regulator family protein  32.86 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.597021 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3640  hypothetical protein  37.68 
 
 		 155 aa  73.6  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0025  ferric uptake regulator family protein  30.66 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344249  normal  0.157034 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4566  Fur family transcriptional regulator protein  31.62 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0621  putative ferric uptake regulator, Fur family  28.87 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.776664  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0533  ferric uptake regulator, Fur family  29.41 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2211  ferric uptake regulator family protein  33.1 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.395667  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0931  ferric uptake regulator family protein  28.68 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1453  ferric uptake regulator, Fur family  32.43 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.023883  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0132  ferric-uptake regulator  24 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11678  putative transcription regulator  25.9 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0519  ferric uptake regulator family protein  31.54 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.639512  normal  0.494415 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1991  ferric uptake regulator family protein  30.77 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  27.01 
 
 		 166 aa  57  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0184  ferric uptake regulator, Fur family  28.89 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.567959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0931  ferric uptake regulator family protein  28.89 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0116  ferric uptake regulator, Fur family  31.72 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.241411 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1411  ferric uptake regulator family protein  23.85 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1144  ferric uptake regulator family protein  28.91 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0734  ferric uptake regulator family protein  24 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000194517  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  29.58 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0396  ferric uptake regulator, Fur family  31.88 
 
 		 175 aa  53.9  0.0000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  26.24 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0584  ferric uptake regulator family protein  27.94 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.274905  normal  0.220198 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1145  ferric uptake regulator family protein  29.58 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1879  ferric uptake regulator, Fur family  32.86 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00751157  normal  0.013308 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2647  ferric uptake regulator family protein  29.63 
 
 		 153 aa  51.6  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0489  ferric uptake regulator family protein  30 
 
 		 167 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.574052  normal  0.122535 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3209  ferric uptake regulator family protein  29.17 
 
 		 147 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.829925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2515  ferric uptake regulator family protein  29.63 
 
 		 218 aa  50.8  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432858 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  27.01 
 
 		 149 aa  50.4  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07031  ferric uptake regulator family protein  29.1 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0821588  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  27.01 
 
 		 149 aa  50.4  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7635  ferric uptake regulator family protein  31.47 
 
 		 163 aa  50.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0365  ferric uptake regulator, Fur family  24.11 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  25.53 
 
 		 152 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2705  ferric uptake regulator, Fur family  30.07 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.344666 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2259  ferric uptake regulator, Fur family  24.63 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  25.35 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1966  ferric uptake regulator family protein  27.92 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2477  ferric uptake regulator family protein  26.81 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0153326  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1216  ferric uptake regulator, Fur family  27.94 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21120  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  29.79 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  25.35 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 144 aa  48.5  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  25.35 
 
 		 144 aa  48.5  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  25.35 
 
 		 144 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 144 aa  48.5  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  25.35 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0164  ferric uptake regulator, Fur family  26.88 
 
 		 112 aa  48.5  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112785  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2198  ferric uptake regulator, Fur family  23.36 
 
 		 169 aa  48.5  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0844  ferric uptake regulator, Fur family  27.66 
 
 		 150 aa  48.5  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000126283  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0630  FUR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 143 aa  48.1  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  25.35 
 
 		 142 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1469  ferric uptake regulator, Fur family  30.23 
 
 		 130 aa  48.1  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0185274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3240  ferric uptake regulator family protein  26.28 
 
 		 148 aa  48.1  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000230922  hitchhiker  0.00191408 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  30.43 
 
 		 146 aa  48.1  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  25.35 
 
 		 142 aa  48.1  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0294  ferric uptake regulator, Fur family  32.61 
 
 		 170 aa  48.1  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.774382  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  25.35 
 
 		 142 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0237  Fur family ferric uptake regulator  31.03 
 
 		 161 aa  48.1  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1279  transcriptional regulator, Fur family  27.27 
 
 		 141 aa  47.8  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000471651  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3278  ferric uptake regulator, Fur family  30.28 
 
 		 149 aa  47.8  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.351465 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0145  fur family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 140 aa  47.4  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51439  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2002  ferric uptake regulator family protein  22.31 
 
 		 159 aa  47.4  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0758566  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0488  ferric uptake regulator family protein  28.76 
 
 		 163 aa  47.4  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00616714  hitchhiker  0.00143129 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4538  ferric uptake regulator family protein  30.53 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148082  normal  0.344615 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06641  ferric uptake regulator family protein  26.87 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2623  ferric uptake regulation protein  26.35 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.376677  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0194  ferric uptake regulator, Fur family  24.81 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.207086  normal  0.440649 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2189  ferric uptake regulator, Fur family  22.46 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000532241  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1989  ferric uptake regulator family protein  27.27 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4458  ferric uptake regulator family protein  27.07 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.342841  hitchhiker  0.00667855 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0939  ferric uptake regulator family protein  30.66 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2599  ferric uptake regulator family protein  27.27 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2668  ferric uptake regulator family protein  25.53 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0698  ferric uptake regulator family protein  25.29 
 
 		 186 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.470229 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06931  ferric uptake regulator family protein  26.87 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.247961  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2623  ferric uptake regulator family protein  27.27 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.195295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  26.92 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  23.36 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5930  ferric uptake regulator family protein  27.27 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>