More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2515 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2515  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 218 aa  446  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432858 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2647  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 153 aa  317  9e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2623  ferric uptake regulator family protein  95.42 
 
 		 153 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.195295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1989  ferric uptake regulator family protein  95.42 
 
 		 153 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2599  ferric uptake regulator family protein  95.42 
 
 		 153 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5930  ferric uptake regulator family protein  94.77 
 
 		 153 aa  300  9e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0698  ferric uptake regulator family protein  89.38 
 
 		 186 aa  297  7e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.470229 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2461  FUR family transcriptional regulator  74.74 
 
 		 251 aa  275  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1030  transcriptional regulator np20  74.21 
 
 		 266 aa  275  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468809  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0329  transcriptional regulator, putative  80.95 
 
 		 174 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0816853  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0075  FUR family transcriptional regulator  85.53 
 
 		 154 aa  269  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0871  FUR family transcriptional regulator  85.53 
 
 		 154 aa  269  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0627  FUR family transcriptional regulator  85.53 
 
 		 154 aa  269  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0691  transcriptional regulator, putative  85.53 
 
 		 216 aa  268  4e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0867  FUR family transcriptional regulator  84.87 
 
 		 154 aa  266  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0488  ferric uptake regulator family protein  76.09 
 
 		 163 aa  227  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00616714  hitchhiker  0.00143129 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0718  ferric uptake regulator  75.18 
 
 		 159 aa  222  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00407056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3248  transcriptional regulator, TrmB  76 
 
 		 164 aa  208  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0836778  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7635  ferric uptake regulator family protein  46.81 
 
 		 163 aa  128  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0060  zinc uptake regulation protein, putative  47.55 
 
 		 160 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72560  transcriptional regulator np20  45.58 
 
 		 167 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0136  ferric uptake regulator family protein  46.15 
 
 		 161 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0134  ferric uptake regulator family protein  46.85 
 
 		 161 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74995  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6300  transcriptional regulator np20  45.58 
 
 		 167 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5109  ferric uptake regulator family protein  45.45 
 
 		 161 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.143994 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002343  zinc uptake regulation protein ZUR  40.97 
 
 		 154 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00840  zinc uptake transcriptional regulator, Fur family  45.52 
 
 		 161 aa  126  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0618  ferric uptake regulator family protein  45.39 
 
 		 163 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0247  ferric uptake regulator family protein  43.66 
 
 		 143 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0493  ferric-uptake regulator  45.07 
 
 		 177 aa  124  9e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.592412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0292  ferric uptake regulator family protein  42.76 
 
 		 174 aa  124  9e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0252498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0524  ferric uptake regulator family protein  45.07 
 
 		 162 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.912553  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0119  FUR family transcriptional regulator  49.22 
 
 		 135 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.723813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3054  ferric uptake regulator, Fur family  41.06 
 
 		 157 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0766  ferric uptake regulator family protein  45 
 
 		 160 aa  123  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.885762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00010  zinc uptake regulation protein  42.14 
 
 		 161 aa  123  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4496  ferric uptake regulator family protein  47.14 
 
 		 161 aa  123  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0319  zinc uptake regulator ZUR  43.36 
 
 		 162 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0518  ferric uptake regulator, Fur family  43.88 
 
 		 165 aa  121  8e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0276  zinc uptake regulation protein, putative  44.76 
 
 		 160 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2788  putative zinc uptake regulation protein  39.31 
 
 		 155 aa  119  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0489  ferric uptake regulator family protein  44.29 
 
 		 167 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.574052  normal  0.122535 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1195  ferric uptake regulator family protein  42.75 
 
 		 162 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal  0.113542 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2322  transctiptional regulator, putative  43.36 
 
 		 340 aa  116  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.559268  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0184  ferric uptake regulator family protein  40.13 
 
 		 192 aa  116  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0654518  hitchhiker  0.00635481 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5267  zinc uptake regulation protein, putative  42.66 
 
 		 160 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0412  zinc uptake regulation protein  41.55 
 
 		 146 aa  115  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.338359  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0554  ferric uptake regulator, Fur family  42.95 
 
 		 153 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.028923  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0059  zinc uptake regulation protein, putative  39.72 
 
 		 162 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3775  ferric uptake regulator family protein  41.01 
 
 		 163 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3128  ferric uptake regulator family protein  44.2 
 
 		 161 aa  112  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5586  ferric uptake regulator, Fur family  41.55 
 
 		 176 aa  112  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0827067  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3179  ferric uptake regulator, Fur family protein  36.43 
 
 		 149 aa  112  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1959  putative ferric uptake regulator, Fur family  42.76 
 
 		 161 aa  111  9e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1888  ferric uptake regulator family protein  42.55 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0469325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1729  ferric uptake regulator family protein  41.18 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2424  ferric-uptake regulator  40.58 
 
 		 163 aa  109  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.688654  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1951  ferric uptake regulator family protein  43.28 
 
 		 169 aa  108  6e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2029  FUR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 169 aa  108  6e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.653891  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2432  ferric uptake regulator, Fur family  40.69 
 
 		 156 aa  108  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00932127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3615  ferric uptake regulator family protein  41.13 
 
 		 156 aa  107  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0123339 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5385  ferric uptake regulator family protein  40 
 
 		 173 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2033  FUR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 171 aa  106  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.728485  normal  0.0108698 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1882  ferric uptake regulator family protein  41.3 
 
 		 149 aa  106  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161499  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0313  ferric uptake regulator family protein  42.45 
 
 		 172 aa  105  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2336  ferric uptake regulator family protein  35.9 
 
 		 173 aa  105  6e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5738  ferric uptake regulator, Fur family  40.13 
 
 		 161 aa  105  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3152  ABC-type uncharacterized transport systems ATPase components-like protein  43.07 
 
 		 163 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.459101 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04819  transcriptional regulator, Fur family  43.51 
 
 		 168 aa  102  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0516  zinc uptake transcriptional repressor  40.41 
 
 		 171 aa  102  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0734  zinc uptake transcriptional repressor  40.41 
 
 		 171 aa  102  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.660786  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0488  zinc uptake regulation protein  36.96 
 
 		 147 aa  101  7e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.695603  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1210  ferric uptake regulator, Fur family  41.67 
 
 		 163 aa  101  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.427545  decreased coverage  0.00910774 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4457  zinc uptake transcriptional repressor  40.14 
 
 		 170 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3523  zinc uptake transcriptional repressor  38.67 
 
 		 169 aa  101  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0975  putative ferric uptake regulator, Fur family  39.86 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1301  zinc uptake transcriptional repressor  39.74 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0812  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  41.35 
 
 		 167 aa  101  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.139641 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1172  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  37.18 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.842565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0387  zinc uptake regulation protein  35.25 
 
 		 149 aa  99.8  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.183946  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0593  ferric uptake regulator family protein  40.14 
 
 		 145 aa  99.8  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.687838  hitchhiker  0.00515693 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3769  zinc uptake transcriptional repressor  40.14 
 
 		 170 aa  99.4  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.352583  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3859  zinc uptake transcriptional repressor  40.14 
 
 		 170 aa  99.4  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1045  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  36.54 
 
 		 197 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.806261  normal  0.0331742 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0376  ferric uptake regulator family protein  37.8 
 
 		 154 aa  99  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.872531 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4139  ferric uptake regulator family protein  39.86 
 
 		 164 aa  98.6  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0983423 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0255  ferric uptake regulator family protein  44.72 
 
 		 161 aa  97.8  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.127404 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4894  ferric uptake regulator, Fur family  39.42 
 
 		 190 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.164543 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0250  zinc uptake transcriptional repressor  37.23 
 
 		 186 aa  97.1  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.463823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3397  zinc uptake transcriptional repressor  37.58 
 
 		 169 aa  95.9  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1776  ferric uptake regulator family protein  37.23 
 
 		 188 aa  95.1  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000166629 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5527  zinc uptake transcriptional repressor  37.23 
 
 		 171 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.508187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4498  zinc uptake transcriptional repressor  36.5 
 
 		 171 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4584  zinc uptake transcriptional repressor  36.5 
 
 		 171 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.735671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4433  zinc uptake transcriptional repressor  36.5 
 
 		 171 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000291933 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4635  zinc uptake transcriptional repressor  36.5 
 
 		 171 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4583  zinc uptake transcriptional repressor  36.5 
 
 		 171 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4508  zinc uptake transcriptional repressor  36.5 
 
 		 171 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3947  ferric uptake regulator, Fur family  36.5 
 
 		 171 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4599  zinc uptake transcriptional repressor  36.5 
 
 		 171 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>