More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1989 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2623  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 
153 aa  315  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.195295  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1989  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 
153 aa  315  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2599  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 
153 aa  315  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5930  ferric uptake regulator family protein  98.69 
 
 
153 aa  311  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0698  ferric uptake regulator family protein  95.42 
 
 
186 aa  306  6.999999999999999e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.470229 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2515  ferric uptake regulator family protein  95.42 
 
 
218 aa  301  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.432858 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2647  ferric uptake regulator family protein  95.42 
 
 
153 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0329  transcriptional regulator, putative  86.84 
 
 
174 aa  274  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0816853  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1030  transcriptional regulator np20  87.92 
 
 
266 aa  274  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468809  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2461  FUR family transcriptional regulator  86.84 
 
 
251 aa  273  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0075  FUR family transcriptional regulator  86.84 
 
 
154 aa  273  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0871  FUR family transcriptional regulator  86.84 
 
 
154 aa  273  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0627  FUR family transcriptional regulator  86.84 
 
 
154 aa  273  5e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0691  transcriptional regulator, putative  86.84 
 
 
216 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0867  FUR family transcriptional regulator  86.75 
 
 
154 aa  270  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0488  ferric uptake regulator family protein  75.36 
 
 
163 aa  225  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00616714  hitchhiker  0.00143129 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0718  ferric uptake regulator  74.82 
 
 
159 aa  223  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00407056  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3248  transcriptional regulator, TrmB  71.62 
 
 
164 aa  208  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0836778  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7635  ferric uptake regulator family protein  45.77 
 
 
163 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72560  transcriptional regulator np20  45.52 
 
 
167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640017  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6300  transcriptional regulator np20  46 
 
 
167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002343  zinc uptake regulation protein ZUR  40.97 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0136  ferric uptake regulator family protein  44.83 
 
 
161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0134  ferric uptake regulator family protein  45.52 
 
 
161 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74995  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0060  zinc uptake regulation protein, putative  46.21 
 
 
160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0618  ferric uptake regulator family protein  44.68 
 
 
163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5109  ferric uptake regulator family protein  44.14 
 
 
161 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.143994 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0292  ferric uptake regulator family protein  42.07 
 
 
174 aa  124  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0252498  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0493  ferric-uptake regulator  44.68 
 
 
177 aa  122  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.592412  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00840  zinc uptake transcriptional regulator, Fur family  43.92 
 
 
161 aa  123  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0247  ferric uptake regulator family protein  43.66 
 
 
143 aa  122  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0524  ferric uptake regulator family protein  44.68 
 
 
162 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.912553  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0766  ferric uptake regulator family protein  45 
 
 
160 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.885762  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00010  zinc uptake regulation protein  43.07 
 
 
161 aa  121  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0319  zinc uptake regulator ZUR  43.26 
 
 
162 aa  120  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0119  FUR family transcriptional regulator  47.66 
 
 
135 aa  120  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.723813  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3054  ferric uptake regulator, Fur family  41.67 
 
 
157 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4496  ferric uptake regulator family protein  44.22 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0276  zinc uptake regulation protein, putative  44.14 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0489  ferric uptake regulator family protein  44.29 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.574052  normal  0.122535 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0518  ferric uptake regulator, Fur family  42.75 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2788  putative zinc uptake regulation protein  37.58 
 
 
155 aa  117  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0184  ferric uptake regulator family protein  40.13 
 
 
192 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0654518  hitchhiker  0.00635481 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1195  ferric uptake regulator family protein  42.03 
 
 
162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal  0.113542 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5267  zinc uptake regulation protein, putative  42.07 
 
 
160 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2322  transctiptional regulator, putative  43.57 
 
 
340 aa  114  6e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.559268  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0554  ferric uptake regulator, Fur family  43.48 
 
 
153 aa  114  6e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.028923  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0412  zinc uptake regulation protein  40.85 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.338359  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3128  ferric uptake regulator family protein  43.57 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289928  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3775  ferric uptake regulator family protein  40.15 
 
 
163 aa  110  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1729  ferric uptake regulator family protein  40.58 
 
 
164 aa  110  7.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1959  putative ferric uptake regulator, Fur family  43.45 
 
 
161 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2033  FUR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.728485  normal  0.0108698 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0059  zinc uptake regulation protein, putative  37.16 
 
 
162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2336  ferric uptake regulator family protein  37.18 
 
 
173 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1888  ferric uptake regulator family protein  41.84 
 
 
175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0469325  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5586  ferric uptake regulator, Fur family  41.43 
 
 
176 aa  108  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0827067  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3179  ferric uptake regulator, Fur family protein  35.71 
 
 
149 aa  108  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5385  ferric uptake regulator family protein  40 
 
 
173 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2029  FUR family transcriptional regulator  43.51 
 
 
169 aa  106  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.653891  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1951  ferric uptake regulator family protein  43.51 
 
 
169 aa  106  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2424  ferric-uptake regulator  39.71 
 
 
163 aa  105  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.688654  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3615  ferric uptake regulator family protein  39.58 
 
 
156 aa  105  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0123339 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0313  ferric uptake regulator family protein  41.73 
 
 
172 aa  104  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2432  ferric uptake regulator, Fur family  40.28 
 
 
156 aa  104  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00932127  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1882  ferric uptake regulator family protein  40.58 
 
 
149 aa  104  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161499  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5738  ferric uptake regulator, Fur family  39.86 
 
 
161 aa  103  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3152  ABC-type uncharacterized transport systems ATPase components-like protein  42.34 
 
 
163 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.459101 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04819  transcriptional regulator, Fur family  42.75 
 
 
168 aa  99.8  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0593  ferric uptake regulator family protein  41.5 
 
 
145 aa  100  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.687838  hitchhiker  0.00515693 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0516  zinc uptake transcriptional repressor  39.73 
 
 
171 aa  99  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0488  zinc uptake regulation protein  36.23 
 
 
147 aa  99  2e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.695603  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0812  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  40 
 
 
167 aa  98.2  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.139641 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0387  zinc uptake regulation protein  35.21 
 
 
149 aa  98.6  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.183946  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0734  zinc uptake transcriptional repressor  39.73 
 
 
171 aa  98.2  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.660786  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4457  zinc uptake transcriptional repressor  39.46 
 
 
170 aa  97.8  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1172  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  37.76 
 
 
197 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.842565  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3523  zinc uptake transcriptional repressor  37.84 
 
 
169 aa  97.4  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0975  putative ferric uptake regulator, Fur family  39.72 
 
 
184 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4894  ferric uptake regulator, Fur family  38.41 
 
 
190 aa  97.4  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.164543 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1210  ferric uptake regulator, Fur family  40.77 
 
 
163 aa  97.1  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.427545  decreased coverage  0.00910774 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3859  zinc uptake transcriptional repressor  38.26 
 
 
170 aa  96.3  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0376  ferric uptake regulator family protein  37.01 
 
 
154 aa  96.3  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.872531 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4139  ferric uptake regulator family protein  39.13 
 
 
164 aa  96.7  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0983423 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3769  zinc uptake transcriptional repressor  38.26 
 
 
170 aa  96.3  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.352583  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1301  zinc uptake transcriptional repressor  38.26 
 
 
172 aa  96.3  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1776  ferric uptake regulator family protein  37.06 
 
 
188 aa  95.5  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000166629 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1045  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  37.06 
 
 
197 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.806261  normal  0.0331742 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0255  ferric uptake regulator family protein  43.9 
 
 
161 aa  95.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.127404 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0250  zinc uptake transcriptional repressor  36.5 
 
 
186 aa  94  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3397  zinc uptake transcriptional repressor  35.21 
 
 
169 aa  91.7  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5527  zinc uptake transcriptional repressor  36.5 
 
 
171 aa  91.3  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.508187  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4583  zinc uptake transcriptional repressor  34.03 
 
 
171 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4635  zinc uptake transcriptional repressor  34.03 
 
 
171 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4433  zinc uptake transcriptional repressor  34.03 
 
 
171 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000291933 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4584  zinc uptake transcriptional repressor  34.03 
 
 
171 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.735671  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4498  zinc uptake transcriptional repressor  34.03 
 
 
171 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3569  Zinc-uptake regulator, Zur  41.46 
 
 
167 aa  90.5  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3252  ferric uptake regulator family protein  41.46 
 
 
163 aa  90.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0890854 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3947  ferric uptake regulator, Fur family  34.03 
 
 
171 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>