257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0048 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0048  putative transcription regulator protein  100 
 
 		 172 aa  344  3e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3379  ferric uptake regulator, Fur family  83.43 
 
 		 175 aa  287  4e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3702  ferric uptake regulator, Fur family  82.29 
 
 		 175 aa  282  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0128  ferric uptake regulator family protein  57.14 
 
 		 169 aa  179  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1335 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0164  putative transcription regulator protein  58.71 
 
 		 172 aa  177  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3496  ferric uptake regulator, Fur family  47.06 
 
 		 152 aa  115  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1233  ferric uptake regulator family protein  41.38 
 
 		 147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1183  ferric uptake regulator, Fur family  42 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.837957 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1467  transcriptional regulator, Fur family  42 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2512  ferric uptake regulator family protein  32.5 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.450617  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1604  putative transcription regulator protein  33.8 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000436344  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4566  Fur family transcriptional regulator protein  35.77 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1930  ferric uptake regulator, Fur family  31.45 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0533  ferric uptake regulator, Fur family  31.03 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0621  putative ferric uptake regulator, Fur family  34.03 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.776664  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0025  ferric uptake regulator family protein  35.29 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344249  normal  0.157034 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3018  ferric uptake regulator, Fur family  36.5 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0481144  normal  0.294593 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2685  ferric uptake regulator family protein  32.65 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0992523 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0931  ferric uptake regulator family protein  30 
 
 		 130 aa  73.6  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2211  ferric uptake regulator family protein  37.14 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.395667  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0116  ferric uptake regulator, Fur family  37.23 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.241411 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3640  hypothetical protein  35.22 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5541  ferric uptake regulator, Fur family  32.09 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.713771 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1728  ferric uptake regulator family protein  33.57 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.597021 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0747  ferric-uptake regulator  30.87 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11678  putative transcription regulator  30 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1411  ferric uptake regulator family protein  25 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2813  ferric uptake regulator family protein  35.85 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.162605  normal  0.605747 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  31.21 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0438  ferric uptake regulation protein  34.27 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0414  ferric uptake regulation protein  34.27 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0519  ferric uptake regulator family protein  34.59 
 
 		 135 aa  57.4  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.639512  normal  0.494415 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1991  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0734  ferric uptake regulator family protein  22.67 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000194517  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1905  ferric uptake regulator family protein  33.55 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0132  ferric-uptake regulator  27.84 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0515  ferric uptake regulator, Fur family  23.24 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1453  ferric uptake regulator, Fur family  29.61 
 
 		 151 aa  53.9  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.023883  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2141  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13391  hypothetical protein  29.11 
 
 		 186 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1389  ferric uptake regulation protein  29.61 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000498211  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1481  ferric uptake regulator family protein  34.27 
 
 		 140 aa  53.1  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.268678  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1451  ferric uptake regulation protein  29.61 
 
 		 155 aa  52.8  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000060196  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01070  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  35.21 
 
 		 142 aa  52.4  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24980  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  30.77 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1194  ferric-uptake regulator  34.69 
 
 		 159 aa  52.4  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2623  ferric uptake regulation protein  28.87 
 
 		 143 aa  52  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.376677  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  25 
 
 		 152 aa  52  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0170  ferric uptake regulator, Fur family  29.58 
 
 		 139 aa  52  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1469  ferric uptake regulator, Fur family  29.1 
 
 		 130 aa  51.2  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0185274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1144  ferric uptake regulator family protein  30 
 
 		 137 aa  50.8  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0593  ferric uptake regulator family protein  34.04 
 
 		 145 aa  50.8  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.687838  hitchhiker  0.00515693 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3951  ferric uptake regulator family protein  30.92 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.781008  normal  0.0311151 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06414  hypothetical protein  28.66 
 
 		 152 aa  50.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0768  iron ABC transporter  26.57 
 
 		 145 aa  50.8  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000612083  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2432  ferric uptake regulator, Fur family  29.32 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00932127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5109  ferric uptake regulator family protein  29.94 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.143994 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0247  ferric uptake transcriptional (FUR)-like transcription regulator protein  30.52 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.406535  normal  0.140515 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2730  ferric uptake regulator family protein  35 
 
 		 150 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3240  ferric uptake regulator family protein  31.01 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000230922  hitchhiker  0.00191408 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07451  ferric uptake regulator family protein  29.85 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0979772 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2124  ferric uptake regulator, Fur family  30.56 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.506102  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  28.36 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_19  transcriptional regulator, Fur family  28.57 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.677591  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  23.24 
 
 		 152 aa  49.3  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1648  ferric uptake regulator family protein  28.86 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.499744 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3503  ferric uptake regulator family protein  30 
 
 		 166 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.248398 
 
 
-
 
NC_002936  DET0020  FUR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 142 aa  48.1  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  28.57 
 
 		 146 aa  48.1  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  29.93 
 
 		 144 aa  48.1  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3965  ferric uptake regulator, Fur family  34.72 
 
 		 138 aa  48.1  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11938  ferric uptake regulation protein furA (fur)  32.53 
 
 		 150 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3775  ferric uptake regulator family protein  30.28 
 
 		 163 aa  47.8  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0967  ferric uptake regulator, Fur family  30.61 
 
 		 142 aa  47.8  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.924679  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3564  ferric uptake regulator family protein  32.56 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.201475 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  29.25 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00840  zinc uptake transcriptional regulator, Fur family  29.93 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3452  ferric uptake regulator family protein  32.39 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0489  ferric uptake regulator family protein  32.85 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.574052  normal  0.122535 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6300  transcriptional regulator np20  29.93 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3292  FUR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 121 aa  46.6  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000231053  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2725  ferric uptake regulator, Fur family  32.1 
 
 		 152 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122956  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36340  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  30.5 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1775  ferric uptake regulator family protein  29.03 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.103697  normal  0.0302993 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2054  ferric uptake regulator family protein  32.38 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0059  zinc uptake regulation protein, putative  25.55 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1211  ferric uptake regulation protein  28.57 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0179394  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3239  ferric uptake regulator, Fur family  31.29 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0517924 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2050  ferric uptake regulator, Fur family  32.19 
 
 		 141 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3209  ferric uptake regulator family protein  31.65 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.829925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07031  ferric uptake regulator family protein  26.67 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0821588  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1460  ferric uptake regulator, Fur family  29.45 
 
 		 161 aa  46.6  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1429  ferric uptake regulator family protein  29.25 
 
 		 143 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.533787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0077  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  27.27 
 
 		 154 aa  45.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2712  ferric uptake regulator family protein  30.92 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.673301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2681  ferric uptake regulator family protein  30.92 
 
 		 195 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.445944  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2543  ferric-uptake regulator  33.57 
 
 		 187 aa  45.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37741  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4555  ferric uptake regulator family protein  25.49 
 
 		 145 aa  45.8  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1145  ferric uptake regulator family protein  31.58 
 
 		 168 aa  45.8  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>