263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3503 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3503  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 166 aa  343  4e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.248398 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5738  ferric uptake regulator, Fur family  49.69 
 
 		 161 aa  158  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5385  ferric uptake regulator family protein  46.21 
 
 		 173 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5586  ferric uptake regulator, Fur family  45.83 
 
 		 176 aa  136  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0827067  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3128  ferric uptake regulator family protein  44.85 
 
 		 161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0975  putative ferric uptake regulator, Fur family  42.36 
 
 		 184 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1045  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  36.7 
 
 		 197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.806261  normal  0.0331742 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1172  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  42.07 
 
 		 197 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.842565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0489  ferric uptake regulator family protein  41.73 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.574052  normal  0.122535 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1888  ferric uptake regulator family protein  41.73 
 
 		 175 aa  117  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0469325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0493  ferric-uptake regulator  40.94 
 
 		 177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.592412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7635  ferric uptake regulator family protein  39.01 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0618  ferric uptake regulator family protein  42.28 
 
 		 163 aa  112  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3010  ferric uptake regulator family protein  41.09 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.184065 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0518  ferric uptake regulator, Fur family  39.84 
 
 		 165 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0319  zinc uptake regulator ZUR  39.84 
 
 		 162 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0812  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  38.76 
 
 		 167 aa  103  8e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.139641 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0524  ferric uptake regulator family protein  39.02 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.912553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1729  ferric uptake regulator family protein  38.1 
 
 		 164 aa  99  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3182  ferric uptake regulator family protein  34.94 
 
 		 164 aa  99  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.346814  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0766  ferric uptake regulator family protein  36.43 
 
 		 160 aa  96.7  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.885762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3775  ferric uptake regulator family protein  36.31 
 
 		 163 aa  93.6  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0734  zinc uptake transcriptional repressor  34.72 
 
 		 171 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.660786  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5109  ferric uptake regulator family protein  38.57 
 
 		 161 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.143994 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0313  ferric uptake regulator family protein  37.5 
 
 		 172 aa  92.8  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3054  ferric uptake regulator, Fur family  35.71 
 
 		 157 aa  92  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72560  transcriptional regulator np20  36.55 
 
 		 167 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0516  zinc uptake transcriptional repressor  34.72 
 
 		 171 aa  91.3  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0136  ferric uptake regulator family protein  37.86 
 
 		 161 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4496  ferric uptake regulator family protein  37.41 
 
 		 161 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6300  transcriptional regulator np20  36.55 
 
 		 167 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4003  ferric uptake regulator family protein  41.03 
 
 		 144 aa  90.1  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162019  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0134  ferric uptake regulator family protein  38.57 
 
 		 161 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74995  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0119  FUR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 135 aa  89  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.723813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0247  ferric uptake regulator family protein  37.96 
 
 		 143 aa  89  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5267  zinc uptake regulation protein, putative  36.71 
 
 		 160 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3397  zinc uptake transcriptional repressor  32.39 
 
 		 169 aa  87.8  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2647  ferric uptake regulator family protein  34.29 
 
 		 153 aa  87.8  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3523  zinc uptake transcriptional repressor  32.39 
 
 		 169 aa  86.7  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2424  ferric-uptake regulator  36.36 
 
 		 163 aa  86.7  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.688654  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0698  ferric uptake regulator family protein  33.57 
 
 		 186 aa  87  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.470229 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2515  ferric uptake regulator family protein  34.29 
 
 		 218 aa  87  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432858 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0488  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 163 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00616714  hitchhiker  0.00143129 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0276  zinc uptake regulation protein, putative  36.71 
 
 		 160 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0060  zinc uptake regulation protein, putative  35.97 
 
 		 160 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5930  ferric uptake regulator family protein  32.87 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04819  transcriptional regulator, Fur family  34.93 
 
 		 168 aa  86.3  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2336  ferric uptake regulator family protein  33.99 
 
 		 173 aa  86.7  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1951  ferric uptake regulator family protein  33.09 
 
 		 169 aa  85.1  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2623  ferric uptake regulator family protein  32.87 
 
 		 153 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.195295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2029  FUR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 169 aa  85.1  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.653891  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00840  zinc uptake transcriptional regulator, Fur family  34.78 
 
 		 161 aa  85.9  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1989  ferric uptake regulator family protein  32.87 
 
 		 153 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2599  ferric uptake regulator family protein  32.87 
 
 		 153 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0059  zinc uptake regulation protein, putative  33.81 
 
 		 162 aa  84.7  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1882  ferric uptake regulator family protein  34.75 
 
 		 149 aa  84.3  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161499  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0412  zinc uptake regulation protein  31.25 
 
 		 146 aa  84.3  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.338359  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3152  ABC-type uncharacterized transport systems ATPase components-like protein  39.01 
 
 		 163 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.459101 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2033  FUR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.728485  normal  0.0108698 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1210  ferric uptake regulator, Fur family  32.39 
 
 		 163 aa  83.6  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.427545  decreased coverage  0.00910774 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0302  hypothetical protein  33.1 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0285  hypothetical protein  33.1 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4457  zinc uptake transcriptional repressor  33.57 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0554  ferric uptake regulator, Fur family  32.67 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.028923  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1301  zinc uptake transcriptional repressor  31.21 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0867  FUR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3859  zinc uptake transcriptional repressor  31.21 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1959  putative ferric uptake regulator, Fur family  35.77 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1195  ferric uptake regulator family protein  35 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal  0.113542 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3769  zinc uptake transcriptional repressor  31.21 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.352583  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1030  transcriptional regulator np20  32.14 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468809  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0691  transcriptional regulator, putative  32.14 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0718  ferric uptake regulator  32.87 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00407056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3615  ferric uptake regulator family protein  37.01 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0123339 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0075  FUR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4139  ferric uptake regulator family protein  35.37 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0983423 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0871  FUR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0627  FUR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2461  FUR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0329  transcriptional regulator, putative  32.14 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0816853  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1694  ferric uptake regulator family protein  36.22 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.924713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2188  transcriptional regulator Fur family  40.37 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0800466  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0292  ferric uptake regulator family protein  34.03 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0252498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3179  ferric uptake regulator, Fur family protein  29.08 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3648  ferric uptake regulator family protein  35.77 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0129314  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4583  zinc uptake transcriptional repressor  30.5 
 
 		 171 aa  77.4  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1974  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase, subtype 1  29.61 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4584  zinc uptake transcriptional repressor  30.5 
 
 		 171 aa  77.4  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.735671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4635  zinc uptake transcriptional repressor  30.5 
 
 		 171 aa  77.4  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4433  zinc uptake transcriptional repressor  30.5 
 
 		 171 aa  77.4  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000291933 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4498  zinc uptake transcriptional repressor  30.5 
 
 		 171 aa  77.4  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06414  hypothetical protein  32.65 
 
 		 152 aa  77  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002343  zinc uptake regulation protein ZUR  29.5 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2788  putative zinc uptake regulation protein  35.16 
 
 		 155 aa  77  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0250  zinc uptake transcriptional repressor  31.21 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.463823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00010  zinc uptake regulation protein  29.5 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2381  putative ferric uptake regulator, Fur family  36.22 
 
 		 132 aa  77  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.972498  normal  0.534577 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1087  putative transcriptional regulator  31.62 
 
 		 128 aa  77  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.751494  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2322  transctiptional regulator, putative  31.03 
 
 		 340 aa  76.3  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.559268  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2715  zinc uptake transcriptional regulator protein, Fur family  36.22 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>