More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0292 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0292  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 
174 aa  360  6e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0252498  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5109  ferric uptake regulator family protein  51.66 
 
 
161 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.143994 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5267  zinc uptake regulation protein, putative  54.05 
 
 
160 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00840  zinc uptake transcriptional regulator, Fur family  52.03 
 
 
161 aa  176  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4496  ferric uptake regulator family protein  51.66 
 
 
161 aa  176  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0060  zinc uptake regulation protein, putative  51.35 
 
 
160 aa  175  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72560  transcriptional regulator np20  50 
 
 
167 aa  175  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640017  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0276  zinc uptake regulation protein, putative  52.7 
 
 
160 aa  174  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6300  transcriptional regulator np20  49.33 
 
 
167 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0134  ferric uptake regulator family protein  49.01 
 
 
161 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74995  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0136  ferric uptake regulator family protein  49.01 
 
 
161 aa  170  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3775  ferric uptake regulator family protein  49.66 
 
 
163 aa  165  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1195  ferric uptake regulator family protein  52.29 
 
 
162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal  0.113542 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2424  ferric-uptake regulator  50.68 
 
 
163 aa  162  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.688654  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0119  FUR family transcriptional regulator  50.37 
 
 
135 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.723813  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0766  ferric uptake regulator family protein  45.39 
 
 
160 aa  155  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.885762  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1729  ferric uptake regulator family protein  47.95 
 
 
164 aa  153  9e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0059  zinc uptake regulation protein, putative  46.36 
 
 
162 aa  147  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4139  ferric uptake regulator family protein  44.94 
 
 
164 aa  144  6e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0983423 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3054  ferric uptake regulator, Fur family  44.9 
 
 
157 aa  143  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3615  ferric uptake regulator family protein  41.94 
 
 
156 aa  143  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0123339 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3152  ABC-type uncharacterized transport systems ATPase components-like protein  44.67 
 
 
163 aa  142  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.459101 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1959  putative ferric uptake regulator, Fur family  46.1 
 
 
161 aa  138  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2322  transctiptional regulator, putative  45.64 
 
 
340 aa  136  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.559268  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0493  ferric-uptake regulator  38.55 
 
 
177 aa  136  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.592412  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7635  ferric uptake regulator family protein  44.37 
 
 
163 aa  136  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0554  ferric uptake regulator, Fur family  44.22 
 
 
153 aa  135  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.028923  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0313  ferric uptake regulator family protein  42 
 
 
172 aa  134  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0489  ferric uptake regulator family protein  44.9 
 
 
167 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.574052  normal  0.122535 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0524  ferric uptake regulator family protein  42.57 
 
 
162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.912553  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3569  Zinc-uptake regulator, Zur  46.05 
 
 
167 aa  131  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0618  ferric uptake regulator family protein  41.22 
 
 
163 aa  131  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1776  ferric uptake regulator family protein  44 
 
 
188 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000166629 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3252  ferric uptake regulator family protein  45.39 
 
 
163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0890854 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0518  ferric uptake regulator, Fur family  43.62 
 
 
165 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4894  ferric uptake regulator, Fur family  43.62 
 
 
190 aa  129  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.164543 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04819  transcriptional regulator, Fur family  44.3 
 
 
168 aa  127  7.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0319  zinc uptake regulator ZUR  40.67 
 
 
162 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1888  ferric uptake regulator family protein  41.72 
 
 
175 aa  125  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0469325  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0867  FUR family transcriptional regulator  42.55 
 
 
154 aa  124  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2029  FUR family transcriptional regulator  45 
 
 
169 aa  124  6e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.653891  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2647  ferric uptake regulator family protein  42.76 
 
 
153 aa  124  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1951  ferric uptake regulator family protein  45 
 
 
169 aa  124  6e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2515  ferric uptake regulator family protein  42.76 
 
 
218 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.432858 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2623  ferric uptake regulator family protein  42.07 
 
 
153 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.195295  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0691  transcriptional regulator, putative  42.55 
 
 
216 aa  123  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0488  ferric uptake regulator family protein  43.8 
 
 
163 aa  123  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00616714  hitchhiker  0.00143129 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1989  ferric uptake regulator family protein  42.07 
 
 
153 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2599  ferric uptake regulator family protein  42.07 
 
 
153 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0593  ferric uptake regulator family protein  42.76 
 
 
145 aa  122  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.687838  hitchhiker  0.00515693 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5930  ferric uptake regulator family protein  41.38 
 
 
153 aa  122  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002343  zinc uptake regulation protein ZUR  43.36 
 
 
154 aa  122  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1882  ferric uptake regulator family protein  43.26 
 
 
149 aa  121  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161499  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1210  ferric uptake regulator, Fur family  42.38 
 
 
163 aa  120  7e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.427545  decreased coverage  0.00910774 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1030  transcriptional regulator np20  41.13 
 
 
266 aa  120  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468809  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2461  FUR family transcriptional regulator  41.13 
 
 
251 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0075  FUR family transcriptional regulator  41.13 
 
 
154 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0871  FUR family transcriptional regulator  41.13 
 
 
154 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0627  FUR family transcriptional regulator  41.13 
 
 
154 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0329  transcriptional regulator, putative  41.13 
 
 
174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0816853  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1703  putative zinc uptake regulation protein  45.33 
 
 
165 aa  119  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0261954  normal  0.0208783 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0698  ferric uptake regulator family protein  37.28 
 
 
186 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.470229 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2432  ferric uptake regulator, Fur family  40.91 
 
 
156 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00932127  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1911  ferric uptake regulator family protein  39.35 
 
 
177 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00010  zinc uptake regulation protein  42.86 
 
 
161 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0184  ferric uptake regulator family protein  38.61 
 
 
192 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0654518  hitchhiker  0.00635481 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3354  ferric uptake regulator family protein  44.8 
 
 
197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000170522 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0718  ferric uptake regulator  41.91 
 
 
159 aa  114  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00407056  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0812  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  43.8 
 
 
167 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.139641 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0247  ferric uptake regulator family protein  41.13 
 
 
143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0255  ferric uptake regulator family protein  46.4 
 
 
161 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.127404 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3179  ferric uptake regulator, Fur family protein  37.5 
 
 
149 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2788  putative zinc uptake regulation protein  43.8 
 
 
155 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3248  transcriptional regulator, TrmB  43.2 
 
 
164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0836778  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3128  ferric uptake regulator family protein  36.54 
 
 
161 aa  108  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289928  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5385  ferric uptake regulator family protein  41.01 
 
 
173 aa  108  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0516  zinc uptake transcriptional repressor  40 
 
 
171 aa  106  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3523  zinc uptake transcriptional repressor  40.14 
 
 
169 aa  105  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5586  ferric uptake regulator, Fur family  40 
 
 
176 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0827067  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0734  zinc uptake transcriptional repressor  40 
 
 
171 aa  105  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.660786  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2336  ferric uptake regulator family protein  37.16 
 
 
173 aa  104  5e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3010  ferric uptake regulator family protein  42.74 
 
 
159 aa  103  8e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.184065 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3397  zinc uptake transcriptional repressor  38.73 
 
 
169 aa  103  9e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2033  FUR family transcriptional regulator  35.33 
 
 
171 aa  103  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.728485  normal  0.0108698 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1301  zinc uptake transcriptional repressor  42.34 
 
 
172 aa  103  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4457  zinc uptake transcriptional repressor  41.55 
 
 
170 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1045  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  33.33 
 
 
197 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.806261  normal  0.0331742 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0975  putative ferric uptake regulator, Fur family  36.05 
 
 
184 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3769  zinc uptake transcriptional repressor  42.34 
 
 
170 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.352583  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3859  zinc uptake transcriptional repressor  42.34 
 
 
170 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0488  zinc uptake regulation protein  36.96 
 
 
147 aa  102  2e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.695603  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1172  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  33.33 
 
 
197 aa  102  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.842565  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0302  hypothetical protein  36.03 
 
 
148 aa  101  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0285  hypothetical protein  36.03 
 
 
148 aa  101  5e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4551  zinc uptake transcriptional repressor  42.96 
 
 
171 aa  101  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4508  zinc uptake transcriptional repressor  42.96 
 
 
171 aa  100  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3947  ferric uptake regulator, Fur family  42.96 
 
 
171 aa  100  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4286  zinc uptake transcriptional repressor  42.96 
 
 
171 aa  100  8e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3982  zinc uptake transcriptional repressor  42.96 
 
 
171 aa  100  8e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.224982 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4599  zinc uptake transcriptional repressor  42.96 
 
 
171 aa  100  8e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>