More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002343 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002343  zinc uptake regulation protein ZUR  100 
 
 		 154 aa  315  2e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00010  zinc uptake regulation protein  95.36 
 
 		 161 aa  297  4e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2788  putative zinc uptake regulation protein  68.63 
 
 		 155 aa  227  4e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0387  zinc uptake regulation protein  53.52 
 
 		 149 aa  163  9e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.183946  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3397  zinc uptake transcriptional repressor  51.37 
 
 		 169 aa  152  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0488  zinc uptake regulation protein  49.32 
 
 		 147 aa  152  1e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.695603  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4508  zinc uptake transcriptional repressor  52.74 
 
 		 171 aa  152  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4551  zinc uptake transcriptional repressor  52.74 
 
 		 171 aa  153  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03918  DNA-binding transcriptional repressor, Zn(II)-binding  52.74 
 
 		 171 aa  152  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3947  ferric uptake regulator, Fur family  52.74 
 
 		 171 aa  152  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4599  zinc uptake transcriptional repressor  52.74 
 
 		 171 aa  152  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4286  zinc uptake transcriptional repressor  52.74 
 
 		 171 aa  152  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03878  hypothetical protein  52.74 
 
 		 171 aa  152  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3982  zinc uptake transcriptional repressor  52.74 
 
 		 171 aa  152  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.224982 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0250  zinc uptake transcriptional repressor  51.37 
 
 		 186 aa  152  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.463823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5527  zinc uptake transcriptional repressor  52.05 
 
 		 171 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.508187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3523  zinc uptake transcriptional repressor  52.82 
 
 		 169 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4498  zinc uptake transcriptional repressor  51.37 
 
 		 171 aa  151  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4584  zinc uptake transcriptional repressor  51.37 
 
 		 171 aa  151  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.735671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4583  zinc uptake transcriptional repressor  51.37 
 
 		 171 aa  151  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4433  zinc uptake transcriptional repressor  51.37 
 
 		 171 aa  151  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000291933 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4635  zinc uptake transcriptional repressor  51.37 
 
 		 171 aa  151  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0516  zinc uptake transcriptional repressor  52.9 
 
 		 171 aa  149  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0734  zinc uptake transcriptional repressor  52.17 
 
 		 171 aa  147  6e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.660786  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4457  zinc uptake transcriptional repressor  52.17 
 
 		 170 aa  146  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1301  zinc uptake transcriptional repressor  50.34 
 
 		 172 aa  144  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3859  zinc uptake transcriptional repressor  50.34 
 
 		 170 aa  144  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3769  zinc uptake transcriptional repressor  50.34 
 
 		 170 aa  144  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.352583  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3179  ferric uptake regulator, Fur family protein  44.67 
 
 		 149 aa  144  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0247  ferric uptake regulator family protein  49.64 
 
 		 143 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0412  zinc uptake regulation protein  42.55 
 
 		 146 aa  135  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.338359  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2029  FUR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 169 aa  134  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.653891  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1951  ferric uptake regulator family protein  44.83 
 
 		 169 aa  134  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2322  transctiptional regulator, putative  50.36 
 
 		 340 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.559268  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3054  ferric uptake regulator, Fur family  45.07 
 
 		 157 aa  130  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04819  transcriptional regulator, Fur family  43.26 
 
 		 168 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2424  ferric-uptake regulator  44.12 
 
 		 163 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.688654  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2647  ferric uptake regulator family protein  40.97 
 
 		 153 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1729  ferric uptake regulator family protein  45.71 
 
 		 164 aa  127  8.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2515  ferric uptake regulator family protein  40.97 
 
 		 218 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432858 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0554  ferric uptake regulator, Fur family  45.99 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.028923  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2623  ferric uptake regulator family protein  40.97 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.195295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1989  ferric uptake regulator family protein  40.97 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0698  ferric uptake regulator family protein  40.97 
 
 		 186 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.470229 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2599  ferric uptake regulator family protein  40.97 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5930  ferric uptake regulator family protein  40.97 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0691  transcriptional regulator, putative  41.43 
 
 		 216 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0718  ferric uptake regulator  43.51 
 
 		 159 aa  123  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00407056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0488  ferric uptake regulator family protein  41.61 
 
 		 163 aa  123  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00616714  hitchhiker  0.00143129 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3248  transcriptional regulator, TrmB  46.03 
 
 		 164 aa  123  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0836778  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1195  ferric uptake regulator family protein  43.36 
 
 		 162 aa  123  9e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal  0.113542 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1030  transcriptional regulator np20  41.43 
 
 		 266 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468809  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1882  ferric uptake regulator family protein  43.17 
 
 		 149 aa  122  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161499  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2461  FUR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 251 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0075  FUR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0329  transcriptional regulator, putative  41.43 
 
 		 174 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0816853  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4894  ferric uptake regulator, Fur family  44.62 
 
 		 190 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.164543 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0292  ferric uptake regulator family protein  43.36 
 
 		 174 aa  122  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0252498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0867  FUR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0871  FUR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0627  FUR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1959  putative ferric uptake regulator, Fur family  40.41 
 
 		 161 aa  122  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1776  ferric uptake regulator family protein  44.62 
 
 		 188 aa  121  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000166629 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1210  ferric uptake regulator, Fur family  40.43 
 
 		 163 aa  120  7e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.427545  decreased coverage  0.00910774 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2432  ferric uptake regulator, Fur family  41.78 
 
 		 156 aa  117  7e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00932127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3354  ferric uptake regulator family protein  44 
 
 		 197 aa  117  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000170522 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4496  ferric uptake regulator family protein  40.14 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0060  zinc uptake regulation protein, putative  40 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00840  zinc uptake transcriptional regulator, Fur family  40.71 
 
 		 161 aa  114  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0493  ferric-uptake regulator  38.3 
 
 		 177 aa  113  7.999999999999999e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.592412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0489  ferric uptake regulator family protein  39.57 
 
 		 167 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.574052  normal  0.122535 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5267  zinc uptake regulation protein, putative  39.44 
 
 		 160 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0276  zinc uptake regulation protein, putative  38.73 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0524  ferric uptake regulator family protein  40.29 
 
 		 162 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.912553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0618  ferric uptake regulator family protein  38.85 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3128  ferric uptake regulator family protein  37.68 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3152  ABC-type uncharacterized transport systems ATPase components-like protein  41.73 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.459101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0134  ferric uptake regulator family protein  40.14 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74995  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7635  ferric uptake regulator family protein  38.69 
 
 		 163 aa  111  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5109  ferric uptake regulator family protein  40.71 
 
 		 161 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.143994 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0319  zinc uptake regulator ZUR  38.57 
 
 		 162 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72560  transcriptional regulator np20  39.16 
 
 		 167 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0812  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  37.96 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.139641 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0766  ferric uptake regulator family protein  38.06 
 
 		 160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.885762  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0119  FUR family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 135 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.723813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6300  transcriptional regulator np20  40 
 
 		 167 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3615  ferric uptake regulator family protein  37.96 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0123339 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0255  ferric uptake regulator family protein  44.44 
 
 		 161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.127404 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0313  ferric uptake regulator family protein  40.48 
 
 		 172 aa  108  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0518  ferric uptake regulator, Fur family  38.85 
 
 		 165 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0136  ferric uptake regulator family protein  39.44 
 
 		 161 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0593  ferric uptake regulator family protein  41.3 
 
 		 145 aa  107  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.687838  hitchhiker  0.00515693 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0059  zinc uptake regulation protein, putative  36.62 
 
 		 162 aa  104  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3775  ferric uptake regulator family protein  37.86 
 
 		 163 aa  103  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0975  putative ferric uptake regulator, Fur family  34.06 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1888  ferric uptake regulator family protein  35.77 
 
 		 175 aa  101  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0469325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5385  ferric uptake regulator family protein  35.21 
 
 		 173 aa  100  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3182  ferric uptake regulator family protein  35.66 
 
 		 164 aa  99.8  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.346814  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4139  ferric uptake regulator family protein  38.57 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0983423 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1172  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  34.06 
 
 		 197 aa  99  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.842565  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>