More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5385 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5385  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 173 aa  338  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5586  ferric uptake regulator, Fur family  91.82 
 
 		 176 aa  283  5.999999999999999e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0827067  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3128  ferric uptake regulator family protein  68.92 
 
 		 161 aa  205  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0975  putative ferric uptake regulator, Fur family  67.57 
 
 		 184 aa  202  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1045  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  68.35 
 
 		 197 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.806261  normal  0.0331742 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1172  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  69.06 
 
 		 197 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.842565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5738  ferric uptake regulator, Fur family  50 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7635  ferric uptake regulator family protein  48.67 
 
 		 163 aa  144  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1888  ferric uptake regulator family protein  47.68 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0469325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3503  ferric uptake regulator family protein  46.21 
 
 		 166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.248398 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0493  ferric-uptake regulator  47.1 
 
 		 177 aa  136  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.592412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0618  ferric uptake regulator family protein  47.45 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0489  ferric uptake regulator family protein  47.76 
 
 		 167 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.574052  normal  0.122535 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0518  ferric uptake regulator, Fur family  48.15 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0524  ferric uptake regulator family protein  45.93 
 
 		 162 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.912553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3010  ferric uptake regulator family protein  49.22 
 
 		 159 aa  127  6e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.184065 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0319  zinc uptake regulator ZUR  45.19 
 
 		 162 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0812  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  46.21 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.139641 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4496  ferric uptake regulator family protein  50.72 
 
 		 161 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3775  ferric uptake regulator family protein  46.72 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6300  transcriptional regulator np20  48.57 
 
 		 167 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0134  ferric uptake regulator family protein  48.2 
 
 		 161 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74995  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3054  ferric uptake regulator, Fur family  45.26 
 
 		 157 aa  121  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5109  ferric uptake regulator family protein  50 
 
 		 161 aa  121  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.143994 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72560  transcriptional regulator np20  47.86 
 
 		 167 aa  121  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640017  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5267  zinc uptake regulation protein, putative  50 
 
 		 160 aa  120  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0136  ferric uptake regulator family protein  47.83 
 
 		 161 aa  120  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0060  zinc uptake regulation protein, putative  47.89 
 
 		 160 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0119  FUR family transcriptional regulator  48.12 
 
 		 135 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.723813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0276  zinc uptake regulation protein, putative  49.28 
 
 		 160 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1729  ferric uptake regulator family protein  42.57 
 
 		 164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1882  ferric uptake regulator family protein  45.14 
 
 		 149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161499  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00840  zinc uptake transcriptional regulator, Fur family  47.86 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3182  ferric uptake regulator family protein  39.87 
 
 		 164 aa  110  7.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.346814  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0766  ferric uptake regulator family protein  42.03 
 
 		 160 aa  110  8.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.885762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0698  ferric uptake regulator family protein  42.07 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.470229 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0292  ferric uptake regulator family protein  41.01 
 
 		 174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0252498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1210  ferric uptake regulator, Fur family  41.01 
 
 		 163 aa  107  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.427545  decreased coverage  0.00910774 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0075  FUR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 154 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0871  FUR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 154 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0627  FUR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 154 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2647  ferric uptake regulator family protein  40 
 
 		 153 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3523  zinc uptake transcriptional repressor  37.86 
 
 		 169 aa  107  9.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2515  ferric uptake regulator family protein  40 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432858 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0329  transcriptional regulator, putative  39.73 
 
 		 174 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0816853  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1030  transcriptional regulator np20  39.73 
 
 		 266 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468809  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2623  ferric uptake regulator family protein  40 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.195295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1989  ferric uptake regulator family protein  40 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2461  FUR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 251 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2599  ferric uptake regulator family protein  40 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3397  zinc uptake transcriptional repressor  37.86 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5930  ferric uptake regulator family protein  39.31 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0867  FUR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0516  zinc uptake transcriptional repressor  37.14 
 
 		 171 aa  105  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0734  zinc uptake transcriptional repressor  37.86 
 
 		 171 aa  106  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.660786  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0691  transcriptional regulator, putative  39.04 
 
 		 216 aa  104  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0184  ferric uptake regulator family protein  35.81 
 
 		 192 aa  102  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0654518  hitchhiker  0.00635481 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3152  ABC-type uncharacterized transport systems ATPase components-like protein  42.25 
 
 		 163 aa  101  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.459101 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2424  ferric-uptake regulator  43.48 
 
 		 163 aa  101  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.688654  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04819  transcriptional regulator, Fur family  37.33 
 
 		 168 aa  101  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3615  ferric uptake regulator family protein  41.48 
 
 		 156 aa  100  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0123339 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002343  zinc uptake regulation protein ZUR  35.21 
 
 		 154 aa  100  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0488  ferric uptake regulator family protein  41.3 
 
 		 163 aa  100  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00616714  hitchhiker  0.00143129 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3179  ferric uptake regulator, Fur family protein  33.56 
 
 		 149 aa  100  9e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0059  zinc uptake regulation protein, putative  35.51 
 
 		 162 aa  100  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2336  ferric uptake regulator family protein  37.76 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1195  ferric uptake regulator family protein  41.33 
 
 		 162 aa  100  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal  0.113542 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4457  zinc uptake transcriptional repressor  35.71 
 
 		 170 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2033  FUR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 171 aa  99.8  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.728485  normal  0.0108698 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0554  ferric uptake regulator, Fur family  36.96 
 
 		 153 aa  99.8  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.028923  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0247  ferric uptake regulator family protein  38.41 
 
 		 143 aa  99.4  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00010  zinc uptake regulation protein  36.3 
 
 		 161 aa  99.4  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4139  ferric uptake regulator family protein  39.47 
 
 		 164 aa  99.4  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0983423 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1951  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 169 aa  98.6  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0412  zinc uptake regulation protein  37.93 
 
 		 146 aa  99  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.338359  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2029  FUR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 169 aa  98.6  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.653891  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0593  ferric uptake regulator family protein  42.03 
 
 		 145 aa  98.2  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.687838  hitchhiker  0.00515693 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1959  putative ferric uptake regulator, Fur family  39.58 
 
 		 161 aa  97.8  7e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2322  transctiptional regulator, putative  39.57 
 
 		 340 aa  95.9  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.559268  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0488  zinc uptake regulation protein  33.33 
 
 		 147 aa  95.9  2e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.695603  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1776  ferric uptake regulator family protein  35.86 
 
 		 188 aa  95.5  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000166629 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0250  zinc uptake transcriptional repressor  34.29 
 
 		 186 aa  94.7  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.463823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0313  ferric uptake regulator family protein  42.64 
 
 		 172 aa  94.4  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4003  ferric uptake regulator family protein  48.6 
 
 		 144 aa  94.4  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162019  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1911  ferric uptake regulator family protein  43.95 
 
 		 177 aa  93.2  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3769  zinc uptake transcriptional repressor  34.51 
 
 		 170 aa  93.2  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.352583  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3569  Zinc-uptake regulator, Zur  45.24 
 
 		 167 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4894  ferric uptake regulator, Fur family  35.76 
 
 		 190 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.164543 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3859  zinc uptake transcriptional repressor  34.51 
 
 		 170 aa  93.2  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4551  zinc uptake transcriptional repressor  34.46 
 
 		 171 aa  92.8  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1301  zinc uptake transcriptional repressor  34.51 
 
 		 172 aa  93.2  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0387  zinc uptake regulation protein  34.75 
 
 		 149 aa  93.2  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.183946  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03918  DNA-binding transcriptional repressor, Zn(II)-binding  34.46 
 
 		 171 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3982  zinc uptake transcriptional repressor  34.46 
 
 		 171 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.224982 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3947  ferric uptake regulator, Fur family  34.46 
 
 		 171 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03878  hypothetical protein  34.46 
 
 		 171 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4286  zinc uptake transcriptional repressor  34.46 
 
 		 171 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4599  zinc uptake transcriptional repressor  34.46 
 
 		 171 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4508  zinc uptake transcriptional repressor  34.46 
 
 		 171 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4498  zinc uptake transcriptional repressor  34 
 
 		 171 aa  91.7  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>