282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1210 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1210  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 
163 aa  335  9.999999999999999e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.427545  decreased coverage  0.00910774 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04819  transcriptional regulator, Fur family  85.16 
 
 
168 aa  276  1e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2029  FUR family transcriptional regulator  75 
 
 
169 aa  256  1e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.653891  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1951  ferric uptake regulator family protein  75 
 
 
169 aa  256  1e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0060  zinc uptake regulation protein, putative  46.05 
 
 
160 aa  135  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00840  zinc uptake transcriptional regulator, Fur family  46 
 
 
161 aa  134  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5109  ferric uptake regulator family protein  45.39 
 
 
161 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.143994 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4496  ferric uptake regulator family protein  48.03 
 
 
161 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0134  ferric uptake regulator family protein  45.33 
 
 
161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74995  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0136  ferric uptake regulator family protein  44.67 
 
 
161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72560  transcriptional regulator np20  44.3 
 
 
167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640017  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5267  zinc uptake regulation protein, putative  44.67 
 
 
160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6300  transcriptional regulator np20  44.3 
 
 
167 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2424  ferric-uptake regulator  43.71 
 
 
163 aa  127  8.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.688654  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0276  zinc uptake regulation protein, putative  44 
 
 
160 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1195  ferric uptake regulator family protein  45.03 
 
 
162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal  0.113542 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1729  ferric uptake regulator family protein  43.33 
 
 
164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0119  FUR family transcriptional regulator  48.84 
 
 
135 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.723813  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1959  putative ferric uptake regulator, Fur family  43.66 
 
 
161 aa  121  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002343  zinc uptake regulation protein ZUR  40.43 
 
 
154 aa  120  8e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0292  ferric uptake regulator family protein  43.17 
 
 
174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0252498  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0489  ferric uptake regulator family protein  41.61 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.574052  normal  0.122535 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0493  ferric-uptake regulator  40 
 
 
177 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.592412  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0518  ferric uptake regulator, Fur family  40.94 
 
 
165 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3523  zinc uptake transcriptional repressor  40 
 
 
169 aa  117  7e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0618  ferric uptake regulator family protein  40.62 
 
 
163 aa  117  7e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7635  ferric uptake regulator family protein  42.95 
 
 
163 aa  117  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1888  ferric uptake regulator family protein  42.67 
 
 
175 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0469325  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4457  zinc uptake transcriptional repressor  40.71 
 
 
170 aa  116  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1882  ferric uptake regulator family protein  44.44 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161499  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00010  zinc uptake regulation protein  40.58 
 
 
161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3179  ferric uptake regulator, Fur family protein  42.11 
 
 
149 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3775  ferric uptake regulator family protein  43.42 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0524  ferric uptake regulator family protein  39.6 
 
 
162 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.912553  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0766  ferric uptake regulator family protein  38.89 
 
 
160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.885762  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3615  ferric uptake regulator family protein  38.93 
 
 
156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0123339 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0734  zinc uptake transcriptional repressor  37.86 
 
 
171 aa  114  7.999999999999999e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.660786  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0516  zinc uptake transcriptional repressor  37.86 
 
 
171 aa  113  8.999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3128  ferric uptake regulator family protein  42.86 
 
 
161 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289928  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0319  zinc uptake regulator ZUR  39.6 
 
 
162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0387  zinc uptake regulation protein  41.18 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.183946  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4894  ferric uptake regulator, Fur family  38.27 
 
 
190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.164543 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3397  zinc uptake transcriptional repressor  37.86 
 
 
169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5586  ferric uptake regulator, Fur family  38.27 
 
 
176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0827067  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2336  ferric uptake regulator family protein  35.39 
 
 
173 aa  111  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3054  ferric uptake regulator, Fur family  38.41 
 
 
157 aa  112  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0313  ferric uptake regulator family protein  40.94 
 
 
172 aa  111  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0488  zinc uptake regulation protein  36.88 
 
 
147 aa  110  6e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.695603  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3859  zinc uptake transcriptional repressor  37.93 
 
 
170 aa  110  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1301  zinc uptake transcriptional repressor  37.93 
 
 
172 aa  110  7.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3769  zinc uptake transcriptional repressor  37.93 
 
 
170 aa  110  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.352583  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2033  FUR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
171 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.728485  normal  0.0108698 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0718  ferric uptake regulator  46.51 
 
 
159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00407056  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1776  ferric uptake regulator family protein  38.78 
 
 
188 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000166629 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3152  ABC-type uncharacterized transport systems ATPase components-like protein  38.27 
 
 
163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.459101 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5385  ferric uptake regulator family protein  41.01 
 
 
173 aa  107  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3248  transcriptional regulator, TrmB  45.31 
 
 
164 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0836778  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2788  putative zinc uptake regulation protein  38.97 
 
 
155 aa  106  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4139  ferric uptake regulator family protein  38.93 
 
 
164 aa  106  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0983423 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4551  zinc uptake transcriptional repressor  37.32 
 
 
171 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03918  DNA-binding transcriptional repressor, Zn(II)-binding  37.32 
 
 
171 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3947  ferric uptake regulator, Fur family  37.32 
 
 
171 aa  105  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4286  zinc uptake transcriptional repressor  37.32 
 
 
171 aa  105  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0247  ferric uptake regulator family protein  42.31 
 
 
143 aa  105  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03878  hypothetical protein  37.32 
 
 
171 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0593  ferric uptake regulator family protein  42.86 
 
 
145 aa  105  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.687838  hitchhiker  0.00515693 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4599  zinc uptake transcriptional repressor  37.32 
 
 
171 aa  105  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4508  zinc uptake transcriptional repressor  37.32 
 
 
171 aa  105  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0488  ferric uptake regulator family protein  42.14 
 
 
163 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00616714  hitchhiker  0.00143129 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3982  zinc uptake transcriptional repressor  37.32 
 
 
171 aa  105  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.224982 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2322  transctiptional regulator, putative  37.58 
 
 
340 aa  105  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.559268  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0812  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  39.55 
 
 
167 aa  104  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.139641 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0975  putative ferric uptake regulator, Fur family  39.19 
 
 
184 aa  104  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5527  zinc uptake transcriptional repressor  36.62 
 
 
171 aa  104  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.508187  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0554  ferric uptake regulator, Fur family  40.54 
 
 
153 aa  103  7e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.028923  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5738  ferric uptake regulator, Fur family  39.31 
 
 
161 aa  103  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0250  zinc uptake transcriptional repressor  35.66 
 
 
186 aa  103  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0412  zinc uptake regulation protein  37.76 
 
 
146 aa  102  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.338359  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0184  ferric uptake regulator family protein  32.93 
 
 
192 aa  102  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0654518  hitchhiker  0.00635481 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4433  zinc uptake transcriptional repressor  36.36 
 
 
171 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000291933 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4583  zinc uptake transcriptional repressor  36.36 
 
 
171 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4584  zinc uptake transcriptional repressor  36.36 
 
 
171 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.735671  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4635  zinc uptake transcriptional repressor  36.36 
 
 
171 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2647  ferric uptake regulator family protein  41.67 
 
 
153 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4498  zinc uptake transcriptional repressor  36.36 
 
 
171 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2515  ferric uptake regulator family protein  41.67 
 
 
218 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.432858 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2432  ferric uptake regulator, Fur family  38.56 
 
 
156 aa  101  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00932127  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3010  ferric uptake regulator family protein  38.46 
 
 
159 aa  101  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.184065 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0059  zinc uptake regulation protein, putative  37.12 
 
 
162 aa  100  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3354  ferric uptake regulator family protein  40.94 
 
 
197 aa  100  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000170522 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1030  transcriptional regulator np20  36.31 
 
 
266 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468809  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1172  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  37.33 
 
 
197 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.842565  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1045  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  37.11 
 
 
197 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.806261  normal  0.0331742 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2461  FUR family transcriptional regulator  36.31 
 
 
251 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0867  FUR family transcriptional regulator  40 
 
 
154 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0255  ferric uptake regulator family protein  44.09 
 
 
161 aa  98.6  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.127404 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0329  transcriptional regulator, putative  36.31 
 
 
174 aa  99  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0816853  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0871  FUR family transcriptional regulator  40 
 
 
154 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0075  FUR family transcriptional regulator  40 
 
 
154 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0627  FUR family transcriptional regulator  40 
 
 
154 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>