More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0516 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0516  zinc uptake transcriptional repressor  100 
 
 		 171 aa  352  2e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0734  zinc uptake transcriptional repressor  97.08 
 
 		 171 aa  344  3e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.660786  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3523  zinc uptake transcriptional repressor  83.43 
 
 		 169 aa  294  5e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3397  zinc uptake transcriptional repressor  82.25 
 
 		 169 aa  291  3e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4457  zinc uptake transcriptional repressor  78.82 
 
 		 170 aa  275  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1301  zinc uptake transcriptional repressor  76.33 
 
 		 172 aa  267  4e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3859  zinc uptake transcriptional repressor  76.33 
 
 		 170 aa  267  7e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3769  zinc uptake transcriptional repressor  76.33 
 
 		 170 aa  267  7e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.352583  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4551  zinc uptake transcriptional repressor  68.05 
 
 		 171 aa  248  3e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4508  zinc uptake transcriptional repressor  68.05 
 
 		 171 aa  248  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03918  DNA-binding transcriptional repressor, Zn(II)-binding  68.05 
 
 		 171 aa  247  6e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3947  ferric uptake regulator, Fur family  68.05 
 
 		 171 aa  247  6e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3982  zinc uptake transcriptional repressor  68.05 
 
 		 171 aa  247  6e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.224982 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4599  zinc uptake transcriptional repressor  68.05 
 
 		 171 aa  247  6e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4286  zinc uptake transcriptional repressor  68.05 
 
 		 171 aa  247  6e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03878  hypothetical protein  68.05 
 
 		 171 aa  247  6e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0250  zinc uptake transcriptional repressor  67.46 
 
 		 186 aa  246  9e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.463823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5527  zinc uptake transcriptional repressor  67.46 
 
 		 171 aa  245  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.508187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4584  zinc uptake transcriptional repressor  65.68 
 
 		 171 aa  241  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.735671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4635  zinc uptake transcriptional repressor  65.68 
 
 		 171 aa  239  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4433  zinc uptake transcriptional repressor  65.68 
 
 		 171 aa  239  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000291933 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4583  zinc uptake transcriptional repressor  65.68 
 
 		 171 aa  239  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4498  zinc uptake transcriptional repressor  65.68 
 
 		 171 aa  239  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0488  zinc uptake regulation protein  63.95 
 
 		 147 aa  207  5e-53  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.695603  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2788  putative zinc uptake regulation protein  53.57 
 
 		 155 aa  154  5.0000000000000005e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00010  zinc uptake regulation protein  54.35 
 
 		 161 aa  152  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0387  zinc uptake regulation protein  52.74 
 
 		 149 aa  152  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.183946  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002343  zinc uptake regulation protein ZUR  52.9 
 
 		 154 aa  149  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0412  zinc uptake regulation protein  45.45 
 
 		 146 aa  146  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.338359  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3179  ferric uptake regulator, Fur family protein  47.97 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0247  ferric uptake regulator family protein  50 
 
 		 143 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1959  putative ferric uptake regulator, Fur family  45.1 
 
 		 161 aa  135  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2322  transctiptional regulator, putative  47.86 
 
 		 340 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.559268  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0554  ferric uptake regulator, Fur family  46.81 
 
 		 153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.028923  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3054  ferric uptake regulator, Fur family  48.94 
 
 		 157 aa  130  9e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1882  ferric uptake regulator family protein  46.85 
 
 		 149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161499  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0593  ferric uptake regulator family protein  46 
 
 		 145 aa  127  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.687838  hitchhiker  0.00515693 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2432  ferric uptake regulator, Fur family  46.53 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00932127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3128  ferric uptake regulator family protein  40.71 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04819  transcriptional regulator, Fur family  42.75 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0524  ferric uptake regulator family protein  42.96 
 
 		 162 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.912553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0618  ferric uptake regulator family protein  41.13 
 
 		 163 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7635  ferric uptake regulator family protein  39.72 
 
 		 163 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0319  zinc uptake regulator ZUR  42.96 
 
 		 162 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2029  FUR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.653891  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3615  ferric uptake regulator family protein  41.73 
 
 		 156 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0123339 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0518  ferric uptake regulator, Fur family  42.03 
 
 		 165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3152  ABC-type uncharacterized transport systems ATPase components-like protein  40.56 
 
 		 163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.459101 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1951  ferric uptake regulator family protein  38.3 
 
 		 169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0313  ferric uptake regulator family protein  41.01 
 
 		 172 aa  115  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0493  ferric-uptake regulator  39.72 
 
 		 177 aa  114  6e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.592412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1210  ferric uptake regulator, Fur family  37.86 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.427545  decreased coverage  0.00910774 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0489  ferric uptake regulator family protein  40.74 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.574052  normal  0.122535 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4894  ferric uptake regulator, Fur family  41.3 
 
 		 190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.164543 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1729  ferric uptake regulator family protein  43.97 
 
 		 164 aa  111  5e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00840  zinc uptake transcriptional regulator, Fur family  42.45 
 
 		 161 aa  110  9e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1776  ferric uptake regulator family protein  40.58 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000166629 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0255  ferric uptake regulator family protein  44.8 
 
 		 161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.127404 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0059  zinc uptake regulation protein, putative  39.44 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3182  ferric uptake regulator family protein  40.14 
 
 		 164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.346814  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0766  ferric uptake regulator family protein  40.43 
 
 		 160 aa  107  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.885762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4496  ferric uptake regulator family protein  41.01 
 
 		 161 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5109  ferric uptake regulator family protein  39.44 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.143994 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0136  ferric uptake regulator family protein  40.14 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0134  ferric uptake regulator family protein  40.14 
 
 		 161 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74995  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5385  ferric uptake regulator family protein  37.14 
 
 		 173 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0292  ferric uptake regulator family protein  40.85 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0252498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72560  transcriptional regulator np20  40 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6300  transcriptional regulator np20  40 
 
 		 167 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2424  ferric-uptake regulator  43.07 
 
 		 163 aa  105  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.688654  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5586  ferric uptake regulator, Fur family  36.69 
 
 		 176 aa  104  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0827067  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0184  ferric uptake regulator family protein  39.6 
 
 		 192 aa  104  6e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0654518  hitchhiker  0.00635481 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1888  ferric uptake regulator family protein  35.25 
 
 		 175 aa  104  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0469325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3775  ferric uptake regulator family protein  40.58 
 
 		 163 aa  103  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0060  zinc uptake regulation protein, putative  39.57 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2647  ferric uptake regulator family protein  40.41 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0119  FUR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.723813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2515  ferric uptake regulator family protein  40.41 
 
 		 218 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432858 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5267  zinc uptake regulation protein, putative  39.57 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0488  ferric uptake regulator family protein  37.68 
 
 		 163 aa  101  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00616714  hitchhiker  0.00143129 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3354  ferric uptake regulator family protein  40.48 
 
 		 197 aa  101  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000170522 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5738  ferric uptake regulator, Fur family  35.25 
 
 		 161 aa  101  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0812  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  36.36 
 
 		 167 aa  100  8e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.139641 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1703  putative zinc uptake regulation protein  43.08 
 
 		 165 aa  100  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0261954  normal  0.0208783 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0276  zinc uptake regulation protein, putative  38.13 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2033  FUR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.728485  normal  0.0108698 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3569  Zinc-uptake regulator, Zur  41.41 
 
 		 167 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1195  ferric uptake regulator family protein  38.3 
 
 		 162 aa  99.8  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal  0.113542 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4139  ferric uptake regulator family protein  38.03 
 
 		 164 aa  98.6  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0983423 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5930  ferric uptake regulator family protein  39.73 
 
 		 153 aa  99  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2623  ferric uptake regulator family protein  39.73 
 
 		 153 aa  99  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.195295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1172  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  34.75 
 
 		 197 aa  99  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.842565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1989  ferric uptake regulator family protein  39.73 
 
 		 153 aa  99  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0975  putative ferric uptake regulator, Fur family  36.17 
 
 		 184 aa  99  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2599  ferric uptake regulator family protein  39.73 
 
 		 153 aa  99  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3648  ferric uptake regulator family protein  45.16 
 
 		 133 aa  98.2  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0129314  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2336  ferric uptake regulator family protein  37.11 
 
 		 173 aa  98.2  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3252  ferric uptake regulator family protein  40.62 
 
 		 163 aa  97.8  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0890854 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0698  ferric uptake regulator family protein  41.01 
 
 		 186 aa  97.8  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.470229 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0718  ferric uptake regulator  39.01 
 
 		 159 aa  97.1  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00407056  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>