295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0319 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0319  zinc uptake regulator ZUR  100 
 
 		 162 aa  331  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0524  ferric uptake regulator family protein  93.17 
 
 		 162 aa  309  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.912553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0518  ferric uptake regulator, Fur family  83.23 
 
 		 165 aa  287  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0618  ferric uptake regulator family protein  79.5 
 
 		 163 aa  272  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0493  ferric-uptake regulator  77.64 
 
 		 177 aa  266  8e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.592412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7635  ferric uptake regulator family protein  72.05 
 
 		 163 aa  252  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0489  ferric uptake regulator family protein  74.53 
 
 		 167 aa  250  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.574052  normal  0.122535 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1888  ferric uptake regulator family protein  48.32 
 
 		 175 aa  154  5.0000000000000005e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0469325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0975  putative ferric uptake regulator, Fur family  44.76 
 
 		 184 aa  141  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3182  ferric uptake regulator family protein  43.56 
 
 		 164 aa  137  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.346814  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1172  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  44.68 
 
 		 197 aa  136  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.842565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1045  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  44.68 
 
 		 197 aa  136  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.806261  normal  0.0331742 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3775  ferric uptake regulator family protein  43.59 
 
 		 163 aa  135  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0812  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  42.17 
 
 		 167 aa  133  8e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.139641 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4496  ferric uptake regulator family protein  45.64 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5586  ferric uptake regulator, Fur family  46.67 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0827067  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3615  ferric uptake regulator family protein  45.33 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0123339 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2424  ferric-uptake regulator  40.65 
 
 		 163 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.688654  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00840  zinc uptake transcriptional regulator, Fur family  44 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5385  ferric uptake regulator family protein  45.19 
 
 		 173 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3128  ferric uptake regulator family protein  42.76 
 
 		 161 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0134  ferric uptake regulator family protein  42 
 
 		 161 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74995  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0136  ferric uptake regulator family protein  40.67 
 
 		 161 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0766  ferric uptake regulator family protein  42.07 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.885762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3152  ABC-type uncharacterized transport systems ATPase components-like protein  46.62 
 
 		 163 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.459101 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5267  zinc uptake regulation protein, putative  44 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5109  ferric uptake regulator family protein  42.28 
 
 		 161 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.143994 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1729  ferric uptake regulator family protein  40.76 
 
 		 164 aa  124  5e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0276  zinc uptake regulation protein, putative  44 
 
 		 160 aa  124  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0329  transcriptional regulator, putative  39.39 
 
 		 174 aa  123  9e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0816853  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0059  zinc uptake regulation protein, putative  38.67 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3054  ferric uptake regulator, Fur family  40.67 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0871  FUR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 154 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0075  FUR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 154 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0627  FUR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 154 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1030  transcriptional regulator np20  39.39 
 
 		 266 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468809  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2515  ferric uptake regulator family protein  43.36 
 
 		 218 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432858 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2461  FUR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 251 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2647  ferric uptake regulator family protein  43.97 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0867  FUR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0292  ferric uptake regulator family protein  41.26 
 
 		 174 aa  122  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0252498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0698  ferric uptake regulator family protein  43.26 
 
 		 186 aa  121  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.470229 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1959  putative ferric uptake regulator, Fur family  43.45 
 
 		 161 aa  120  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5930  ferric uptake regulator family protein  43.26 
 
 		 153 aa  120  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2623  ferric uptake regulator family protein  43.26 
 
 		 153 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.195295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1989  ferric uptake regulator family protein  43.26 
 
 		 153 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2599  ferric uptake regulator family protein  43.26 
 
 		 153 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0691  transcriptional regulator, putative  42.66 
 
 		 216 aa  120  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6300  transcriptional regulator np20  40.94 
 
 		 167 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0734  zinc uptake transcriptional repressor  42.96 
 
 		 171 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.660786  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72560  transcriptional regulator np20  40.27 
 
 		 167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0488  zinc uptake regulation protein  39.86 
 
 		 147 aa  117  6e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.695603  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3010  ferric uptake regulator family protein  44.62 
 
 		 159 aa  117  6e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.184065 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0119  FUR family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 135 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.723813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0060  zinc uptake regulation protein, putative  39.6 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0516  zinc uptake transcriptional repressor  42.96 
 
 		 171 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0313  ferric uptake regulator family protein  43.71 
 
 		 172 aa  117  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0718  ferric uptake regulator  48.41 
 
 		 159 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00407056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1195  ferric uptake regulator family protein  40.13 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal  0.113542 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3248  transcriptional regulator, TrmB  47.62 
 
 		 164 aa  114  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0836778  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2029  FUR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.653891  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1951  ferric uptake regulator family protein  38.26 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1210  ferric uptake regulator, Fur family  39.6 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.427545  decreased coverage  0.00910774 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04819  transcriptional regulator, Fur family  41.45 
 
 		 168 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4139  ferric uptake regulator family protein  40.37 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0983423 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3397  zinc uptake transcriptional repressor  39.71 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3523  zinc uptake transcriptional repressor  38.13 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0554  ferric uptake regulator, Fur family  38.78 
 
 		 153 aa  112  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.028923  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002343  zinc uptake regulation protein ZUR  38.57 
 
 		 154 aa  110  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5738  ferric uptake regulator, Fur family  39.86 
 
 		 161 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0488  ferric uptake regulator family protein  40.97 
 
 		 163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00616714  hitchhiker  0.00143129 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00010  zinc uptake regulation protein  37.86 
 
 		 161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1911  ferric uptake regulator family protein  42.77 
 
 		 177 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2322  transctiptional regulator, putative  37.01 
 
 		 340 aa  108  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.559268  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3569  Zinc-uptake regulator, Zur  46.31 
 
 		 167 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4894  ferric uptake regulator, Fur family  40.41 
 
 		 190 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.164543 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1776  ferric uptake regulator family protein  39.73 
 
 		 188 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000166629 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3252  ferric uptake regulator family protein  45.64 
 
 		 163 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0890854 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1301  zinc uptake transcriptional repressor  39.55 
 
 		 172 aa  107  7.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3769  zinc uptake transcriptional repressor  39.55 
 
 		 170 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.352583  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3859  zinc uptake transcriptional repressor  39.55 
 
 		 170 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1882  ferric uptake regulator family protein  40.29 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161499  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0255  ferric uptake regulator family protein  44.88 
 
 		 161 aa  104  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.127404 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3503  ferric uptake regulator family protein  39.84 
 
 		 166 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.248398 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4457  zinc uptake transcriptional repressor  38.81 
 
 		 170 aa  104  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0593  ferric uptake regulator family protein  41.91 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.687838  hitchhiker  0.00515693 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0250  zinc uptake transcriptional repressor  38.06 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.463823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2788  putative zinc uptake regulation protein  40 
 
 		 155 aa  101  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0247  ferric uptake regulator family protein  38.85 
 
 		 143 aa  101  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4551  zinc uptake transcriptional repressor  37.96 
 
 		 171 aa  99.8  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03918  DNA-binding transcriptional repressor, Zn(II)-binding  37.96 
 
 		 171 aa  99  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3947  ferric uptake regulator, Fur family  37.96 
 
 		 171 aa  99  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4508  zinc uptake transcriptional repressor  37.96 
 
 		 171 aa  99  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4286  zinc uptake transcriptional repressor  37.96 
 
 		 171 aa  99  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4599  zinc uptake transcriptional repressor  37.96 
 
 		 171 aa  99  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03878  hypothetical protein  37.96 
 
 		 171 aa  99  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3982  zinc uptake transcriptional repressor  37.96 
 
 		 171 aa  99  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.224982 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2188  transcriptional regulator Fur family  43.31 
 
 		 133 aa  99  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0800466  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1694  ferric uptake regulator family protein  43.31 
 
 		 132 aa  98.6  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.924713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4583  zinc uptake transcriptional repressor  36.5 
 
 		 171 aa  97.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>