More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0518 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_0518  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 
165 aa  338  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0524  ferric uptake regulator family protein  86.96 
 
 
162 aa  296  1e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.912553  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0319  zinc uptake regulator ZUR  83.23 
 
 
162 aa  287  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0618  ferric uptake regulator family protein  79.01 
 
 
163 aa  273  8e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0493  ferric-uptake regulator  77.16 
 
 
177 aa  266  7e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.592412  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7635  ferric uptake regulator family protein  74.07 
 
 
163 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0489  ferric uptake regulator family protein  72.22 
 
 
167 aa  244  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.574052  normal  0.122535 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1888  ferric uptake regulator family protein  50.68 
 
 
175 aa  150  7e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0469325  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0975  putative ferric uptake regulator, Fur family  45.33 
 
 
184 aa  142  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3182  ferric uptake regulator family protein  46.75 
 
 
164 aa  138  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.346814  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1172  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  45.65 
 
 
197 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.842565  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5586  ferric uptake regulator, Fur family  47.3 
 
 
176 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0827067  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1045  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  45.32 
 
 
197 aa  137  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.806261  normal  0.0331742 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0812  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  44.24 
 
 
167 aa  134  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.139641 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3128  ferric uptake regulator family protein  46.31 
 
 
161 aa  134  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289928  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3152  ABC-type uncharacterized transport systems ATPase components-like protein  49.33 
 
 
163 aa  134  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.459101 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5385  ferric uptake regulator family protein  48.15 
 
 
173 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3775  ferric uptake regulator family protein  44.44 
 
 
163 aa  133  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2424  ferric-uptake regulator  44.08 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.688654  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3615  ferric uptake regulator family protein  47.3 
 
 
156 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0123339 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1729  ferric uptake regulator family protein  42.68 
 
 
164 aa  129  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3054  ferric uptake regulator, Fur family  42.57 
 
 
157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0059  zinc uptake regulation protein, putative  38.65 
 
 
162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4496  ferric uptake regulator family protein  42.67 
 
 
161 aa  124  7e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3010  ferric uptake regulator family protein  45.8 
 
 
159 aa  123  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.184065 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00840  zinc uptake transcriptional regulator, Fur family  43.05 
 
 
161 aa  123  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0134  ferric uptake regulator family protein  42.76 
 
 
161 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74995  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0292  ferric uptake regulator family protein  43.36 
 
 
174 aa  122  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0252498  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0136  ferric uptake regulator family protein  42.11 
 
 
161 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5109  ferric uptake regulator family protein  42.76 
 
 
161 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.143994 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2647  ferric uptake regulator family protein  43.88 
 
 
153 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2515  ferric uptake regulator family protein  43.88 
 
 
218 aa  121  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.432858 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1959  putative ferric uptake regulator, Fur family  44.3 
 
 
161 aa  121  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0698  ferric uptake regulator family protein  43.48 
 
 
186 aa  120  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.470229 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1195  ferric uptake regulator family protein  42.86 
 
 
162 aa  120  9e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal  0.113542 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5267  zinc uptake regulation protein, putative  44.81 
 
 
160 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0276  zinc uptake regulation protein, putative  44.37 
 
 
160 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0313  ferric uptake regulator family protein  44.9 
 
 
172 aa  120  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0766  ferric uptake regulator family protein  42.18 
 
 
160 aa  120  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.885762  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5930  ferric uptake regulator family protein  42.75 
 
 
153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1989  ferric uptake regulator family protein  42.75 
 
 
153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2599  ferric uptake regulator family protein  42.75 
 
 
153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2623  ferric uptake regulator family protein  42.75 
 
 
153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.195295  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6300  transcriptional regulator np20  42.11 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0060  zinc uptake regulation protein, putative  41.45 
 
 
160 aa  118  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1951  ferric uptake regulator family protein  39.74 
 
 
169 aa  119  3e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2029  FUR family transcriptional regulator  39.74 
 
 
169 aa  119  3e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.653891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72560  transcriptional regulator np20  41.45 
 
 
167 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640017  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0075  FUR family transcriptional regulator  42.75 
 
 
154 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3569  Zinc-uptake regulator, Zur  50 
 
 
167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0871  FUR family transcriptional regulator  42.75 
 
 
154 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0627  FUR family transcriptional regulator  42.75 
 
 
154 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0734  zinc uptake transcriptional repressor  42.03 
 
 
171 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.660786  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1210  ferric uptake regulator, Fur family  40.94 
 
 
163 aa  117  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.427545  decreased coverage  0.00910774 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1030  transcriptional regulator np20  42.75 
 
 
266 aa  117  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468809  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0488  zinc uptake regulation protein  41.73 
 
 
147 aa  117  6e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.695603  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0329  transcriptional regulator, putative  39.38 
 
 
174 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0816853  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2461  FUR family transcriptional regulator  42.75 
 
 
251 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0867  FUR family transcriptional regulator  42.75 
 
 
154 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3252  ferric uptake regulator family protein  49.33 
 
 
163 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0890854 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0691  transcriptional regulator, putative  42.75 
 
 
216 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0516  zinc uptake transcriptional repressor  42.03 
 
 
171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0718  ferric uptake regulator  43.8 
 
 
159 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00407056  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04819  transcriptional regulator, Fur family  42.48 
 
 
168 aa  115  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4139  ferric uptake regulator family protein  42.68 
 
 
164 aa  115  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0983423 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3248  transcriptional regulator, TrmB  45.53 
 
 
164 aa  114  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0836778  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4894  ferric uptake regulator, Fur family  41.78 
 
 
190 aa  114  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.164543 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2322  transctiptional regulator, putative  40.52 
 
 
340 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.559268  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0119  FUR family transcriptional regulator  43.38 
 
 
135 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.723813  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3523  zinc uptake transcriptional repressor  40.74 
 
 
169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1776  ferric uptake regulator family protein  41.78 
 
 
188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000166629 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5738  ferric uptake regulator, Fur family  42.54 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3397  zinc uptake transcriptional repressor  40.74 
 
 
169 aa  112  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1911  ferric uptake regulator family protein  42.6 
 
 
177 aa  111  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1882  ferric uptake regulator family protein  42.66 
 
 
149 aa  110  7.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161499  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0554  ferric uptake regulator, Fur family  38.78 
 
 
153 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.028923  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0488  ferric uptake regulator family protein  40.43 
 
 
163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00616714  hitchhiker  0.00143129 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002343  zinc uptake regulation protein ZUR  38.85 
 
 
154 aa  108  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3769  zinc uptake transcriptional repressor  40.15 
 
 
170 aa  107  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.352583  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3859  zinc uptake transcriptional repressor  40.15 
 
 
170 aa  107  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1301  zinc uptake transcriptional repressor  40.15 
 
 
172 aa  107  6e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00010  zinc uptake regulation protein  38.85 
 
 
161 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4457  zinc uptake transcriptional repressor  38.69 
 
 
170 aa  106  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3503  ferric uptake regulator family protein  39.84 
 
 
166 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.248398 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2788  putative zinc uptake regulation protein  39.1 
 
 
155 aa  103  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4551  zinc uptake transcriptional repressor  37.59 
 
 
171 aa  102  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0250  zinc uptake transcriptional repressor  37.59 
 
 
186 aa  101  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0593  ferric uptake regulator family protein  40.85 
 
 
145 aa  101  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.687838  hitchhiker  0.00515693 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03918  DNA-binding transcriptional repressor, Zn(II)-binding  37.59 
 
 
171 aa  100  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3947  ferric uptake regulator, Fur family  37.59 
 
 
171 aa  100  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4599  zinc uptake transcriptional repressor  37.59 
 
 
171 aa  100  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4508  zinc uptake transcriptional repressor  37.59 
 
 
171 aa  100  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3982  zinc uptake transcriptional repressor  37.59 
 
 
171 aa  100  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.224982 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03878  hypothetical protein  37.59 
 
 
171 aa  100  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4286  zinc uptake transcriptional repressor  37.59 
 
 
171 aa  100  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0247  ferric uptake regulator family protein  37.68 
 
 
143 aa  100  9e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0412  zinc uptake regulation protein  38.03 
 
 
146 aa  99.8  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.338359  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5527  zinc uptake transcriptional repressor  36.88 
 
 
171 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.508187  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3179  ferric uptake regulator, Fur family protein  35.71 
 
 
149 aa  99  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0184  ferric uptake regulator family protein  37.32 
 
 
192 aa  99  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0654518  hitchhiker  0.00635481 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>