275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5738 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5738  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 		 161 aa  321  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3503  ferric uptake regulator family protein  49.69 
 
 		 166 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.248398 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5586  ferric uptake regulator, Fur family  46.5 
 
 		 176 aa  149  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0827067  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5385  ferric uptake regulator family protein  50 
 
 		 173 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3128  ferric uptake regulator family protein  47.48 
 
 		 161 aa  137  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0975  putative ferric uptake regulator, Fur family  44.44 
 
 		 184 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1172  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  44.37 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.842565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1045  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  43.66 
 
 		 197 aa  128  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.806261  normal  0.0331742 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7635  ferric uptake regulator family protein  42.95 
 
 		 163 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1888  ferric uptake regulator family protein  41.4 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0469325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0493  ferric-uptake regulator  40.79 
 
 		 177 aa  121  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.592412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0489  ferric uptake regulator family protein  40.26 
 
 		 167 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.574052  normal  0.122535 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0618  ferric uptake regulator family protein  40.4 
 
 		 163 aa  117  7e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0812  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  45.04 
 
 		 167 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.139641 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0518  ferric uptake regulator, Fur family  42.54 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0524  ferric uptake regulator family protein  40.27 
 
 		 162 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.912553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0319  zinc uptake regulator ZUR  39.86 
 
 		 162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04819  transcriptional regulator, Fur family  37.2 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2515  ferric uptake regulator family protein  40.13 
 
 		 218 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432858 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1210  ferric uptake regulator, Fur family  39.31 
 
 		 163 aa  103  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.427545  decreased coverage  0.00910774 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2647  ferric uptake regulator family protein  40.14 
 
 		 153 aa  104  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2029  FUR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.653891  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1951  ferric uptake regulator family protein  36.55 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1989  ferric uptake regulator family protein  39.86 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3010  ferric uptake regulator family protein  41.27 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.184065 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2599  ferric uptake regulator family protein  39.86 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2623  ferric uptake regulator family protein  39.86 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.195295  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0329  transcriptional regulator, putative  38 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0816853  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4457  zinc uptake transcriptional repressor  36.96 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0734  zinc uptake transcriptional repressor  35.25 
 
 		 171 aa  102  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.660786  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1030  transcriptional regulator np20  38.67 
 
 		 266 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468809  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0691  transcriptional regulator, putative  39.33 
 
 		 216 aa  102  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2461  FUR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 251 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3182  ferric uptake regulator family protein  37.06 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.346814  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0516  zinc uptake transcriptional repressor  35.25 
 
 		 171 aa  101  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5930  ferric uptake regulator family protein  39.44 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0075  FUR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0871  FUR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0627  FUR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03918  DNA-binding transcriptional repressor, Zn(II)-binding  35.51 
 
 		 171 aa  100  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3947  ferric uptake regulator, Fur family  35.51 
 
 		 171 aa  100  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0250  zinc uptake transcriptional repressor  34.06 
 
 		 186 aa  100  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.463823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3982  zinc uptake transcriptional repressor  35.51 
 
 		 171 aa  100  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.224982 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4599  zinc uptake transcriptional repressor  35.51 
 
 		 171 aa  100  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03878  hypothetical protein  35.51 
 
 		 171 aa  100  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4286  zinc uptake transcriptional repressor  35.51 
 
 		 171 aa  100  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4508  zinc uptake transcriptional repressor  35.51 
 
 		 171 aa  100  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3397  zinc uptake transcriptional repressor  35 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5527  zinc uptake transcriptional repressor  34.78 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.508187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0698  ferric uptake regulator family protein  39.16 
 
 		 186 aa  99.4  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.470229 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00010  zinc uptake regulation protein  35.97 
 
 		 161 aa  99.4  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3523  zinc uptake transcriptional repressor  34.29 
 
 		 169 aa  98.6  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0867  FUR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 154 aa  98.2  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2336  ferric uptake regulator family protein  33.13 
 
 		 173 aa  98.2  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002343  zinc uptake regulation protein ZUR  35.97 
 
 		 154 aa  98.6  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4551  zinc uptake transcriptional repressor  34.78 
 
 		 171 aa  97.8  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2033  FUR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 171 aa  96.3  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.728485  normal  0.0108698 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3615  ferric uptake regulator family protein  38.12 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0123339 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0247  ferric uptake regulator family protein  36.23 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1195  ferric uptake regulator family protein  39.57 
 
 		 162 aa  96.7  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal  0.113542 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4584  zinc uptake transcriptional repressor  32.61 
 
 		 171 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.735671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4433  zinc uptake transcriptional repressor  32.61 
 
 		 171 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000291933 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4498  zinc uptake transcriptional repressor  32.61 
 
 		 171 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1729  ferric uptake regulator family protein  37.13 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4635  zinc uptake transcriptional repressor  32.61 
 
 		 171 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4583  zinc uptake transcriptional repressor  32.61 
 
 		 171 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3054  ferric uptake regulator, Fur family  35.03 
 
 		 157 aa  95.5  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1882  ferric uptake regulator family protein  39.31 
 
 		 149 aa  95.1  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161499  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3648  ferric uptake regulator family protein  37.1 
 
 		 133 aa  95.1  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0129314  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3859  zinc uptake transcriptional repressor  34.72 
 
 		 170 aa  94.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1301  zinc uptake transcriptional repressor  34.72 
 
 		 172 aa  94.7  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4003  ferric uptake regulator family protein  39.66 
 
 		 144 aa  95.1  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162019  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3769  zinc uptake transcriptional repressor  34.72 
 
 		 170 aa  94.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.352583  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0593  ferric uptake regulator family protein  38.46 
 
 		 145 aa  94.4  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.687838  hitchhiker  0.00515693 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0766  ferric uptake regulator family protein  34.75 
 
 		 160 aa  94.4  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.885762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1959  putative ferric uptake regulator, Fur family  36.55 
 
 		 161 aa  94.4  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0488  zinc uptake regulation protein  30.94 
 
 		 147 aa  94.4  6e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.695603  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0488  ferric uptake regulator family protein  39.86 
 
 		 163 aa  94.4  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00616714  hitchhiker  0.00143129 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4496  ferric uptake regulator family protein  37.74 
 
 		 161 aa  94  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0554  ferric uptake regulator, Fur family  33.8 
 
 		 153 aa  94  7e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.028923  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3179  ferric uptake regulator, Fur family protein  35 
 
 		 149 aa  92  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2424  ferric-uptake regulator  35.4 
 
 		 163 aa  91.3  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.688654  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0718  ferric uptake regulator  38.13 
 
 		 159 aa  90.9  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00407056  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5267  zinc uptake regulation protein, putative  38 
 
 		 160 aa  90.9  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0276  zinc uptake regulation protein, putative  38 
 
 		 160 aa  90.5  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0184  ferric uptake regulator family protein  34.03 
 
 		 192 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0654518  hitchhiker  0.00635481 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72560  transcriptional regulator np20  37.09 
 
 		 167 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3775  ferric uptake regulator family protein  35.76 
 
 		 163 aa  90.1  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00840  zinc uptake transcriptional regulator, Fur family  36 
 
 		 161 aa  89  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2432  ferric uptake regulator, Fur family  32.89 
 
 		 156 aa  88.6  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00932127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3248  transcriptional regulator, TrmB  39.68 
 
 		 164 aa  88.6  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0836778  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6300  transcriptional regulator np20  38.16 
 
 		 167 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0059  zinc uptake regulation protein, putative  31.85 
 
 		 162 aa  87.4  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1974  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase, subtype 1  31.76 
 
 		 155 aa  87.4  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3152  ABC-type uncharacterized transport systems ATPase components-like protein  37.89 
 
 		 163 aa  87.4  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.459101 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0412  zinc uptake regulation protein  30.5 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.338359  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1125  FUR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 145 aa  86.7  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.858412  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0376  ferric uptake regulator family protein  36.15 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.872531 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4139  ferric uptake regulator family protein  36.94 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0983423 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1030  FUR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 145 aa  86.7  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.718199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>