219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3648 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3648  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 133 aa  275  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0129314  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4003  ferric uptake regulator family protein  52.71 
 
 		 144 aa  142  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162019  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2381  putative ferric uptake regulator, Fur family  54.4 
 
 		 132 aa  140  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.972498  normal  0.534577 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2715  zinc uptake transcriptional regulator protein, Fur family  53.6 
 
 		 132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1125  FUR family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.858412  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4179  ferric uptake regulator family protein  51.22 
 
 		 138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.458354  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1030  FUR family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 145 aa  131  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.718199  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2188  transcriptional regulator Fur family  52 
 
 		 133 aa  127  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0800466  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1694  ferric uptake regulator family protein  48 
 
 		 132 aa  124  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.924713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1087  putative transcriptional regulator  40.16 
 
 		 128 aa  113  8.999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.751494  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3397  zinc uptake transcriptional repressor  45.97 
 
 		 169 aa  99.8  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3523  zinc uptake transcriptional repressor  45.97 
 
 		 169 aa  99.8  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0516  zinc uptake transcriptional repressor  45.16 
 
 		 171 aa  98.2  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4457  zinc uptake transcriptional repressor  43.55 
 
 		 170 aa  95.5  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0734  zinc uptake transcriptional repressor  44.35 
 
 		 171 aa  95.9  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.660786  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5738  ferric uptake regulator, Fur family  37.1 
 
 		 161 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0554  ferric uptake regulator, Fur family  40.32 
 
 		 153 aa  94.4  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.028923  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2432  ferric uptake regulator, Fur family  41.09 
 
 		 156 aa  94.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00932127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0489  ferric uptake regulator family protein  40.6 
 
 		 167 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.574052  normal  0.122535 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3769  zinc uptake transcriptional repressor  43.55 
 
 		 170 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.352583  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3859  zinc uptake transcriptional repressor  43.55 
 
 		 170 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1301  zinc uptake transcriptional repressor  43.55 
 
 		 172 aa  91.3  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1959  putative ferric uptake regulator, Fur family  42.31 
 
 		 161 aa  90.9  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0250  zinc uptake transcriptional repressor  44.35 
 
 		 186 aa  90.9  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.463823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002343  zinc uptake regulation protein ZUR  40.32 
 
 		 154 aa  90.1  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1882  ferric uptake regulator family protein  42.74 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161499  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4551  zinc uptake transcriptional repressor  43.55 
 
 		 171 aa  89.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3054  ferric uptake regulator, Fur family  40.62 
 
 		 157 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03918  DNA-binding transcriptional repressor, Zn(II)-binding  43.55 
 
 		 171 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3947  ferric uptake regulator, Fur family  43.55 
 
 		 171 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4635  zinc uptake transcriptional repressor  42.74 
 
 		 171 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4508  zinc uptake transcriptional repressor  43.55 
 
 		 171 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4599  zinc uptake transcriptional repressor  43.55 
 
 		 171 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00010  zinc uptake regulation protein  40.32 
 
 		 161 aa  88.6  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5527  zinc uptake transcriptional repressor  43.55 
 
 		 171 aa  89  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.508187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4583  zinc uptake transcriptional repressor  42.74 
 
 		 171 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0313  ferric uptake regulator family protein  41.94 
 
 		 172 aa  89  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03878  hypothetical protein  43.55 
 
 		 171 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4498  zinc uptake transcriptional repressor  42.74 
 
 		 171 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3982  zinc uptake transcriptional repressor  43.55 
 
 		 171 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.224982 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4584  zinc uptake transcriptional repressor  42.74 
 
 		 171 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.735671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4433  zinc uptake transcriptional repressor  42.74 
 
 		 171 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000291933 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4286  zinc uptake transcriptional repressor  43.55 
 
 		 171 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0059  zinc uptake regulation protein, putative  36.51 
 
 		 162 aa  88.2  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3615  ferric uptake regulator family protein  41.13 
 
 		 156 aa  88.6  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0123339 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0412  zinc uptake regulation protein  37.1 
 
 		 146 aa  87.8  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.338359  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2029  FUR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 169 aa  88.2  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.653891  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1951  ferric uptake regulator family protein  38.89 
 
 		 169 aa  88.2  4e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1210  ferric uptake regulator, Fur family  39.68 
 
 		 163 aa  87  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.427545  decreased coverage  0.00910774 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0488  zinc uptake regulation protein  37.9 
 
 		 147 aa  87  7e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.695603  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3775  ferric uptake regulator family protein  41.94 
 
 		 163 aa  87.4  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1195  ferric uptake regulator family protein  41.13 
 
 		 162 aa  86.7  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal  0.113542 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0319  zinc uptake regulator ZUR  40.16 
 
 		 162 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04819  transcriptional regulator, Fur family  40.48 
 
 		 168 aa  86.7  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0292  ferric uptake regulator family protein  39.52 
 
 		 174 aa  85.5  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0252498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0255  ferric uptake regulator family protein  42.74 
 
 		 161 aa  85.9  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.127404 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2788  putative zinc uptake regulation protein  39.52 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4496  ferric uptake regulator family protein  40 
 
 		 161 aa  84  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0812  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  38.89 
 
 		 167 aa  84  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.139641 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3128  ferric uptake regulator family protein  39.37 
 
 		 161 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5109  ferric uptake regulator family protein  38.4 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.143994 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0518  ferric uptake regulator, Fur family  38.58 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1729  ferric uptake regulator family protein  39.52 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3152  ABC-type uncharacterized transport systems ATPase components-like protein  39.52 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.459101 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0766  ferric uptake regulator family protein  36.51 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.885762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0524  ferric uptake regulator family protein  38.58 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.912553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1776  ferric uptake regulator family protein  38.21 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000166629 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4894  ferric uptake regulator, Fur family  38.02 
 
 		 190 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.164543 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2424  ferric-uptake regulator  37.1 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.688654  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0618  ferric uptake regulator family protein  35.38 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0488  ferric uptake regulator family protein  38.4 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00616714  hitchhiker  0.00143129 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0119  FUR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.723813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2515  ferric uptake regulator family protein  38.89 
 
 		 218 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432858 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0136  ferric uptake regulator family protein  39.06 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2336  ferric uptake regulator family protein  34.81 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2647  ferric uptake regulator family protein  38.89 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3179  ferric uptake regulator, Fur family protein  37.7 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0247  ferric uptake regulator family protein  39.52 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0276  zinc uptake regulation protein, putative  39.06 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0134  ferric uptake regulator family protein  39.06 
 
 		 161 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74995  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0593  ferric uptake regulator family protein  37.6 
 
 		 145 aa  80.1  0.000000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.687838  hitchhiker  0.00515693 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5267  zinc uptake regulation protein, putative  39.2 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1888  ferric uptake regulator family protein  34.68 
 
 		 175 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0469325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72560  transcriptional regulator np20  40 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7635  ferric uptake regulator family protein  36.51 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0329  transcriptional regulator, putative  36.72 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0816853  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2033  FUR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.728485  normal  0.0108698 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1030  transcriptional regulator np20  36.72 
 
 		 266 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468809  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2461  FUR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0493  ferric-uptake regulator  35.66 
 
 		 177 aa  78.2  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.592412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3569  Zinc-uptake regulator, Zur  38.71 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0627  FUR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0867  FUR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0871  FUR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0075  FUR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1703  putative zinc uptake regulation protein  40.32 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0261954  normal  0.0208783 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3503  ferric uptake regulator family protein  35.77 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.248398 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0698  ferric uptake regulator family protein  38.1 
 
 		 186 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.470229 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5385  ferric uptake regulator family protein  38.4 
 
 		 173 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1989  ferric uptake regulator family protein  38.1 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>