296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1694 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1694  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 132 aa  273  8e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.924713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2715  zinc uptake transcriptional regulator protein, Fur family  68.7 
 
 		 132 aa  191  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2381  putative ferric uptake regulator, Fur family  67.94 
 
 		 132 aa  189  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.972498  normal  0.534577 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2188  transcriptional regulator Fur family  65.15 
 
 		 133 aa  178  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0800466  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4003  ferric uptake regulator family protein  63.28 
 
 		 144 aa  169  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162019  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1125  FUR family transcriptional regulator  62.02 
 
 		 145 aa  166  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.858412  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1030  FUR family transcriptional regulator  62.02 
 
 		 145 aa  166  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.718199  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4179  ferric uptake regulator family protein  60.77 
 
 		 138 aa  164  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.458354  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1087  putative transcriptional regulator  48.44 
 
 		 128 aa  130  6e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.751494  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3648  ferric uptake regulator family protein  48 
 
 		 133 aa  124  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0129314  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0489  ferric uptake regulator family protein  44.53 
 
 		 167 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.574052  normal  0.122535 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2029  FUR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 169 aa  99.4  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.653891  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1951  ferric uptake regulator family protein  39.23 
 
 		 169 aa  99.4  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1882  ferric uptake regulator family protein  44.88 
 
 		 149 aa  99.4  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161499  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0319  zinc uptake regulator ZUR  43.31 
 
 		 162 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3775  ferric uptake regulator family protein  44.88 
 
 		 163 aa  96.7  9e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7635  ferric uptake regulator family protein  46.22 
 
 		 163 aa  95.1  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0524  ferric uptake regulator family protein  44.09 
 
 		 162 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.912553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0518  ferric uptake regulator, Fur family  42.31 
 
 		 165 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0618  ferric uptake regulator family protein  40.94 
 
 		 163 aa  92  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1888  ferric uptake regulator family protein  40.94 
 
 		 175 aa  92  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0469325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0247  ferric uptake regulator family protein  43.44 
 
 		 143 aa  92  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04819  transcriptional regulator, Fur family  38.93 
 
 		 168 aa  92.4  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0493  ferric-uptake regulator  41.73 
 
 		 177 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.592412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1959  putative ferric uptake regulator, Fur family  42.22 
 
 		 161 aa  91.7  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3397  zinc uptake transcriptional repressor  42.52 
 
 		 169 aa  91.7  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5109  ferric uptake regulator family protein  43.75 
 
 		 161 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.143994 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0136  ferric uptake regulator family protein  42.97 
 
 		 161 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3615  ferric uptake regulator family protein  40.94 
 
 		 156 aa  90.1  9e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0123339 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0812  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  39.06 
 
 		 167 aa  89.7  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.139641 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0516  zinc uptake transcriptional repressor  41.73 
 
 		 171 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0313  ferric uptake regulator family protein  42.52 
 
 		 172 aa  89.7  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2360  ferric uptake regulator family protein  41.09 
 
 		 156 aa  89  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.930624  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0119  FUR family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 135 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.723813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3523  zinc uptake transcriptional repressor  41.73 
 
 		 169 aa  89.4  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0718  ferric uptake regulator  40 
 
 		 159 aa  89  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00407056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0734  zinc uptake transcriptional repressor  41.73 
 
 		 171 aa  88.6  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.660786  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0134  ferric uptake regulator family protein  42.97 
 
 		 161 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74995  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3248  transcriptional regulator, TrmB  40.31 
 
 		 164 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0836778  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4496  ferric uptake regulator family protein  42.97 
 
 		 161 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1210  ferric uptake regulator, Fur family  38.46 
 
 		 163 aa  87.4  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.427545  decreased coverage  0.00910774 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0060  zinc uptake regulation protein, putative  42.19 
 
 		 160 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2432  ferric uptake regulator, Fur family  39.84 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00932127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00840  zinc uptake transcriptional regulator, Fur family  42.97 
 
 		 161 aa  85.5  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4457  zinc uptake transcriptional repressor  40.94 
 
 		 170 aa  85.9  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3010  ferric uptake regulator family protein  39.84 
 
 		 159 aa  85.1  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.184065 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1703  putative zinc uptake regulation protein  43.31 
 
 		 165 aa  84.3  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0261954  normal  0.0208783 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0276  zinc uptake regulation protein, putative  42.64 
 
 		 160 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0059  zinc uptake regulation protein, putative  34.88 
 
 		 162 aa  84  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2424  ferric-uptake regulator  38.28 
 
 		 163 aa  84  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.688654  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5738  ferric uptake regulator, Fur family  35.94 
 
 		 161 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5385  ferric uptake regulator family protein  48.18 
 
 		 173 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1045  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  37.5 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.806261  normal  0.0331742 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1172  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  37.5 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.842565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3054  ferric uptake regulator, Fur family  38.28 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5267  zinc uptake regulation protein, putative  41.86 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0766  ferric uptake regulator family protein  37.69 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.885762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6300  transcriptional regulator np20  41.41 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1195  ferric uptake regulator family protein  39.37 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal  0.113542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72560  transcriptional regulator np20  41.41 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1729  ferric uptake regulator family protein  36.72 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0554  ferric uptake regulator, Fur family  40.57 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.028923  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5586  ferric uptake regulator, Fur family  47.27 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0827067  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3859  zinc uptake transcriptional repressor  38.76 
 
 		 170 aa  80.9  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5527  zinc uptake transcriptional repressor  39.37 
 
 		 171 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.508187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1301  zinc uptake transcriptional repressor  38.76 
 
 		 172 aa  80.9  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4551  zinc uptake transcriptional repressor  39.37 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4139  ferric uptake regulator family protein  37.5 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0983423 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3769  zinc uptake transcriptional repressor  38.76 
 
 		 170 aa  80.9  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.352583  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03918  DNA-binding transcriptional repressor, Zn(II)-binding  39.37 
 
 		 171 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3947  ferric uptake regulator, Fur family  39.37 
 
 		 171 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0387  zinc uptake regulation protein  35.43 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.183946  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3982  zinc uptake transcriptional repressor  39.37 
 
 		 171 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.224982 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03878  hypothetical protein  39.37 
 
 		 171 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3128  ferric uptake regulator family protein  42.19 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0292  ferric uptake regulator family protein  39.37 
 
 		 174 aa  80.9  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0252498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4286  zinc uptake transcriptional repressor  39.37 
 
 		 171 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4508  zinc uptake transcriptional repressor  39.37 
 
 		 171 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4599  zinc uptake transcriptional repressor  39.37 
 
 		 171 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0488  zinc uptake regulation protein  35.43 
 
 		 147 aa  80.1  0.000000000000009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.695603  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0975  putative ferric uptake regulator, Fur family  36.22 
 
 		 184 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002343  zinc uptake regulation protein ZUR  35.94 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00010  zinc uptake regulation protein  35.94 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2647  ferric uptake regulator family protein  39.29 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3152  ABC-type uncharacterized transport systems ATPase components-like protein  42.59 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.459101 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2515  ferric uptake regulator family protein  39.29 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432858 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3503  ferric uptake regulator family protein  36.22 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.248398 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0488  ferric uptake regulator family protein  36.51 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00616714  hitchhiker  0.00143129 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0871  FUR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2461  FUR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 251 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0329  transcriptional regulator, putative  38.39 
 
 		 174 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0816853  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1030  transcriptional regulator np20  38.39 
 
 		 266 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468809  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0075  FUR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0627  FUR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1911  ferric uptake regulator family protein  40 
 
 		 177 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4584  zinc uptake transcriptional repressor  37.8 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.735671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4498  zinc uptake transcriptional repressor  37.8 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4433  zinc uptake transcriptional repressor  37.8 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000291933 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4635  zinc uptake transcriptional repressor  37.8 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4583  zinc uptake transcriptional repressor  37.8 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>