More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A0627 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1030  transcriptional regulator np20  100 
 
 
266 aa  317  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468809  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0329  transcriptional regulator, putative  100 
 
 
174 aa  317  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0816853  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2461  FUR family transcriptional regulator  100 
 
 
251 aa  317  5e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0075  FUR family transcriptional regulator  100 
 
 
154 aa  316  7e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0871  FUR family transcriptional regulator  100 
 
 
154 aa  316  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0627  FUR family transcriptional regulator  100 
 
 
154 aa  316  7e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0867  FUR family transcriptional regulator  98.7 
 
 
154 aa  312  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0691  transcriptional regulator, putative  98.05 
 
 
216 aa  310  3.9999999999999997e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0698  ferric uptake regulator family protein  87.5 
 
 
186 aa  274  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.470229 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2623  ferric uptake regulator family protein  86.84 
 
 
153 aa  273  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.195295  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1989  ferric uptake regulator family protein  86.84 
 
 
153 aa  273  5e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2599  ferric uptake regulator family protein  86.84 
 
 
153 aa  273  5e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5930  ferric uptake regulator family protein  87.92 
 
 
153 aa  273  8e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2515  ferric uptake regulator family protein  85.53 
 
 
218 aa  269  9e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.432858 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2647  ferric uptake regulator family protein  85.53 
 
 
153 aa  269  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0488  ferric uptake regulator family protein  72.41 
 
 
163 aa  222  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00616714  hitchhiker  0.00143129 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0718  ferric uptake regulator  72.66 
 
 
159 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00407056  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3248  transcriptional regulator, TrmB  73.6 
 
 
164 aa  203  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0836778  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0136  ferric uptake regulator family protein  44.52 
 
 
161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0134  ferric uptake regulator family protein  45.21 
 
 
161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74995  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7635  ferric uptake regulator family protein  47.52 
 
 
163 aa  128  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5109  ferric uptake regulator family protein  43.45 
 
 
161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.143994 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0060  zinc uptake regulation protein, putative  44.83 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0618  ferric uptake regulator family protein  45.07 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6300  transcriptional regulator np20  42.86 
 
 
167 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72560  transcriptional regulator np20  42.18 
 
 
167 aa  124  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640017  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3054  ferric uptake regulator, Fur family  43.17 
 
 
157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00840  zinc uptake transcriptional regulator, Fur family  42.07 
 
 
161 aa  123  8.000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0319  zinc uptake regulator ZUR  42.66 
 
 
162 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0119  FUR family transcriptional regulator  47.29 
 
 
135 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.723813  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002343  zinc uptake regulation protein ZUR  41.43 
 
 
154 aa  122  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0524  ferric uptake regulator family protein  43.66 
 
 
162 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.912553  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1195  ferric uptake regulator family protein  44.2 
 
 
162 aa  122  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal  0.113542 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0493  ferric-uptake regulator  44.14 
 
 
177 aa  122  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.592412  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00010  zinc uptake regulation protein  41.43 
 
 
161 aa  120  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0276  zinc uptake regulation protein, putative  42.76 
 
 
160 aa  120  9e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0292  ferric uptake regulator family protein  41.13 
 
 
174 aa  119  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0252498  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0247  ferric uptake regulator family protein  41.55 
 
 
143 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4496  ferric uptake regulator family protein  44.29 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0518  ferric uptake regulator, Fur family  42.75 
 
 
165 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0766  ferric uptake regulator family protein  43.38 
 
 
160 aa  118  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.885762  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0184  ferric uptake regulator family protein  41.38 
 
 
192 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0654518  hitchhiker  0.00635481 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5267  zinc uptake regulation protein, putative  40.69 
 
 
160 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2788  putative zinc uptake regulation protein  39.71 
 
 
155 aa  114  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0489  ferric uptake regulator family protein  42.34 
 
 
167 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.574052  normal  0.122535 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1882  ferric uptake regulator family protein  41.78 
 
 
149 aa  113  8.999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161499  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5586  ferric uptake regulator, Fur family  40 
 
 
176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0827067  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3128  ferric uptake regulator family protein  43.57 
 
 
161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289928  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2033  FUR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.728485  normal  0.0108698 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2336  ferric uptake regulator family protein  38.31 
 
 
173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1959  putative ferric uptake regulator, Fur family  42.07 
 
 
161 aa  111  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1951  ferric uptake regulator family protein  42.22 
 
 
169 aa  111  3e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3775  ferric uptake regulator family protein  39.01 
 
 
163 aa  111  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2029  FUR family transcriptional regulator  42.22 
 
 
169 aa  111  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.653891  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0059  zinc uptake regulation protein, putative  38.3 
 
 
162 aa  110  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1888  ferric uptake regulator family protein  41.38 
 
 
175 aa  110  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0469325  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1729  ferric uptake regulator family protein  39.71 
 
 
164 aa  110  8.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2424  ferric-uptake regulator  40.44 
 
 
163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.688654  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3615  ferric uptake regulator family protein  39.58 
 
 
156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0123339 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2322  transctiptional regulator, putative  41.01 
 
 
340 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.559268  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3179  ferric uptake regulator, Fur family protein  36.5 
 
 
149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5385  ferric uptake regulator family protein  39.73 
 
 
173 aa  107  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0313  ferric uptake regulator family protein  40.56 
 
 
172 aa  107  8.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0412  zinc uptake regulation protein  40.43 
 
 
146 aa  105  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.338359  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0554  ferric uptake regulator, Fur family  40.88 
 
 
153 aa  104  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.028923  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0593  ferric uptake regulator family protein  41.5 
 
 
145 aa  103  6e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.687838  hitchhiker  0.00515693 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3152  ABC-type uncharacterized transport systems ATPase components-like protein  41.43 
 
 
163 aa  103  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.459101 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2432  ferric uptake regulator, Fur family  38.85 
 
 
156 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00932127  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4139  ferric uptake regulator family protein  39.44 
 
 
164 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0983423 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5738  ferric uptake regulator, Fur family  38.89 
 
 
161 aa  101  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04819  transcriptional regulator, Fur family  41.22 
 
 
168 aa  101  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0387  zinc uptake regulation protein  35 
 
 
149 aa  99.8  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.183946  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1776  ferric uptake regulator family protein  37.41 
 
 
188 aa  99.4  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000166629 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0376  ferric uptake regulator family protein  36.22 
 
 
154 aa  99.4  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.872531 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4894  ferric uptake regulator, Fur family  37.68 
 
 
190 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.164543 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0975  putative ferric uptake regulator, Fur family  37.58 
 
 
184 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1210  ferric uptake regulator, Fur family  40 
 
 
163 aa  98.6  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.427545  decreased coverage  0.00910774 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0488  zinc uptake regulation protein  35.51 
 
 
147 aa  97.4  7e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.695603  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0812  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  38.46 
 
 
167 aa  95.5  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.139641 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1172  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  37.14 
 
 
197 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.842565  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0255  ferric uptake regulator family protein  41.13 
 
 
161 aa  95.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.127404 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1045  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  36.43 
 
 
197 aa  94  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.806261  normal  0.0331742 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0734  zinc uptake transcriptional repressor  36.23 
 
 
171 aa  92.8  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.660786  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0516  zinc uptake transcriptional repressor  36.96 
 
 
171 aa  93.6  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3569  Zinc-uptake regulator, Zur  40.65 
 
 
167 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3252  ferric uptake regulator family protein  40.65 
 
 
163 aa  91.3  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0890854 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1301  zinc uptake transcriptional repressor  35.77 
 
 
172 aa  90.9  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3859  zinc uptake transcriptional repressor  35.77 
 
 
170 aa  90.5  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0159  transcriptional regulator  37.69 
 
 
156 aa  90.5  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3769  zinc uptake transcriptional repressor  35.77 
 
 
170 aa  90.5  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.352583  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0250  zinc uptake transcriptional repressor  34.31 
 
 
186 aa  89.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4457  zinc uptake transcriptional repressor  35.77 
 
 
170 aa  89  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1703  putative zinc uptake regulation protein  42.64 
 
 
165 aa  88.6  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0261954  normal  0.0208783 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5527  zinc uptake transcriptional repressor  34.31 
 
 
171 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.508187  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3523  zinc uptake transcriptional repressor  34.06 
 
 
169 aa  88.6  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3397  zinc uptake transcriptional repressor  33.82 
 
 
169 aa  87.4  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3354  ferric uptake regulator family protein  35.71 
 
 
197 aa  87  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000170522 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3947  ferric uptake regulator, Fur family  33.58 
 
 
171 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03878  hypothetical protein  33.58 
 
 
171 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4286  zinc uptake transcriptional repressor  33.58 
 
 
171 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>