196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1911 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1911  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 177 aa  349  1e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0060  zinc uptake regulation protein, putative  48.8 
 
 		 160 aa  150  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0134  ferric uptake regulator family protein  47.9 
 
 		 161 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74995  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5109  ferric uptake regulator family protein  46.11 
 
 		 161 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.143994 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72560  transcriptional regulator np20  46.39 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6300  transcriptional regulator np20  46.39 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0136  ferric uptake regulator family protein  46.11 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4496  ferric uptake regulator family protein  46.71 
 
 		 161 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00840  zinc uptake transcriptional regulator, Fur family  48.05 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5267  zinc uptake regulation protein, putative  46.06 
 
 		 160 aa  134  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0276  zinc uptake regulation protein, putative  46.06 
 
 		 160 aa  132  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7635  ferric uptake regulator family protein  46.95 
 
 		 163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3775  ferric uptake regulator family protein  45 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3054  ferric uptake regulator, Fur family  44.87 
 
 		 157 aa  127  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0119  FUR family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 135 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.723813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3615  ferric uptake regulator family protein  45.81 
 
 		 156 aa  127  7.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0123339 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4139  ferric uptake regulator family protein  44.31 
 
 		 164 aa  127  8.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0983423 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0313  ferric uptake regulator family protein  47.13 
 
 		 172 aa  125  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1729  ferric uptake regulator family protein  46.2 
 
 		 164 aa  124  8.000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1888  ferric uptake regulator family protein  48.12 
 
 		 175 aa  122  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0469325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3152  ABC-type uncharacterized transport systems ATPase components-like protein  47.77 
 
 		 163 aa  121  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.459101 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0059  zinc uptake regulation protein, putative  35.37 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0489  ferric uptake regulator family protein  46.91 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.574052  normal  0.122535 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0524  ferric uptake regulator family protein  44.51 
 
 		 162 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.912553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0518  ferric uptake regulator, Fur family  43.11 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3182  ferric uptake regulator family protein  41.36 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.346814  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0319  zinc uptake regulator ZUR  43.29 
 
 		 162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2424  ferric-uptake regulator  42.48 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.688654  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0292  ferric uptake regulator family protein  40 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0252498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0493  ferric-uptake regulator  40.49 
 
 		 177 aa  112  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.592412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0766  ferric uptake regulator family protein  40.88 
 
 		 160 aa  111  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.885762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1882  ferric uptake regulator family protein  45.52 
 
 		 149 aa  111  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161499  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0618  ferric uptake regulator family protein  40.61 
 
 		 163 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1195  ferric uptake regulator family protein  41.83 
 
 		 162 aa  110  8.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal  0.113542 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3128  ferric uptake regulator family protein  46.58 
 
 		 161 aa  107  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1703  putative zinc uptake regulation protein  50.96 
 
 		 165 aa  107  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0261954  normal  0.0208783 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2432  ferric uptake regulator, Fur family  41.29 
 
 		 156 aa  105  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00932127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3569  Zinc-uptake regulator, Zur  47.56 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0812  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  45.26 
 
 		 167 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.139641 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3252  ferric uptake regulator family protein  46.95 
 
 		 163 aa  101  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0890854 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0247  ferric uptake regulator family protein  39.44 
 
 		 143 aa  100  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0554  ferric uptake regulator, Fur family  38.96 
 
 		 153 aa  100  9e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.028923  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0184  ferric uptake regulator family protein  35.64 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0654518  hitchhiker  0.00635481 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3010  ferric uptake regulator family protein  41.35 
 
 		 159 aa  98.6  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.184065 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5385  ferric uptake regulator family protein  44.59 
 
 		 173 aa  98.2  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1951  ferric uptake regulator family protein  39.13 
 
 		 169 aa  97.1  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2029  FUR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 169 aa  97.1  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.653891  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5586  ferric uptake regulator, Fur family  43.45 
 
 		 176 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0827067  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04819  transcriptional regulator, Fur family  39.86 
 
 		 168 aa  95.9  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1210  ferric uptake regulator, Fur family  40.3 
 
 		 163 aa  95.9  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.427545  decreased coverage  0.00910774 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2322  transctiptional regulator, putative  35.67 
 
 		 340 aa  93.6  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.559268  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0975  putative ferric uptake regulator, Fur family  43.66 
 
 		 184 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1959  putative ferric uptake regulator, Fur family  40.91 
 
 		 161 aa  93.6  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0593  ferric uptake regulator family protein  37.5 
 
 		 145 aa  93.6  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.687838  hitchhiker  0.00515693 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3179  ferric uptake regulator, Fur family protein  37.96 
 
 		 149 aa  93.6  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1087  putative transcriptional regulator  35.29 
 
 		 128 aa  92.4  3e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.751494  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1030  transcriptional regulator np20  35.58 
 
 		 266 aa  92  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468809  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0329  transcriptional regulator, putative  35.58 
 
 		 174 aa  91.7  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0816853  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0718  ferric uptake regulator  41.78 
 
 		 159 aa  91.7  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00407056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2461  FUR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 251 aa  91.7  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0302  hypothetical protein  39.04 
 
 		 148 aa  90.5  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0285  hypothetical protein  39.04 
 
 		 148 aa  90.5  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1172  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  41.03 
 
 		 197 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.842565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0627  FUR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 154 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0867  FUR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 154 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0871  FUR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 154 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0075  FUR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 154 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2715  zinc uptake transcriptional regulator protein, Fur family  41.04 
 
 		 132 aa  90.1  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1045  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  42.57 
 
 		 197 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.806261  normal  0.0331742 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002343  zinc uptake regulation protein ZUR  34.03 
 
 		 154 aa  89.4  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0255  ferric uptake regulator family protein  44.7 
 
 		 161 aa  89.4  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.127404 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4894  ferric uptake regulator, Fur family  34.91 
 
 		 190 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.164543 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0691  transcriptional regulator, putative  37.5 
 
 		 216 aa  89  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2336  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 173 aa  89.4  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2360  ferric uptake regulator family protein  42.01 
 
 		 156 aa  89  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.930624  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0488  ferric uptake regulator family protein  38.06 
 
 		 163 aa  89  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00616714  hitchhiker  0.00143129 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3397  zinc uptake transcriptional repressor  34.25 
 
 		 169 aa  88.2  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0376  ferric uptake regulator family protein  39.1 
 
 		 154 aa  88.6  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.872531 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2381  putative ferric uptake regulator, Fur family  41.04 
 
 		 132 aa  88.2  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.972498  normal  0.534577 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0412  zinc uptake regulation protein  37.24 
 
 		 146 aa  87.4  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.338359  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2033  FUR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 171 aa  87.4  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.728485  normal  0.0108698 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2647  ferric uptake regulator family protein  38.19 
 
 		 153 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00010  zinc uptake regulation protein  34.72 
 
 		 161 aa  87  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0387  zinc uptake regulation protein  31.47 
 
 		 149 aa  86.3  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.183946  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2515  ferric uptake regulator family protein  38.19 
 
 		 218 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432858 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2188  transcriptional regulator Fur family  39.55 
 
 		 133 aa  85.5  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0800466  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1776  ferric uptake regulator family protein  36.67 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000166629 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4179  ferric uptake regulator family protein  39.1 
 
 		 138 aa  85.5  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.458354  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0516  zinc uptake transcriptional repressor  36.99 
 
 		 171 aa  85.5  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5930  ferric uptake regulator family protein  37.5 
 
 		 153 aa  84.7  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1989  ferric uptake regulator family protein  37.5 
 
 		 153 aa  84.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5738  ferric uptake regulator, Fur family  37.84 
 
 		 161 aa  84.7  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2599  ferric uptake regulator family protein  37.5 
 
 		 153 aa  84.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2623  ferric uptake regulator family protein  37.5 
 
 		 153 aa  84.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.195295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0297  ferric uptake regulator family protein  32.64 
 
 		 159 aa  84.3  9e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3248  transcriptional regulator, TrmB  42.11 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0836778  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1125  FUR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 145 aa  84  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.858412  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1030  FUR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 145 aa  84  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.718199  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0734  zinc uptake transcriptional repressor  36.99 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.660786  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0698  ferric uptake regulator family protein  37.93 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.470229 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>