244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0297 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0297  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 159 aa  329  1e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1974  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase, subtype 1  38.41 
 
 		 155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06414  hypothetical protein  40.6 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72560  transcriptional regulator np20  34.27 
 
 		 167 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6300  transcriptional regulator np20  34.27 
 
 		 167 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1210  ferric uptake regulator, Fur family  35.86 
 
 		 163 aa  94.7  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.427545  decreased coverage  0.00910774 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0276  zinc uptake regulation protein, putative  36.17 
 
 		 160 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4496  ferric uptake regulator family protein  35.21 
 
 		 161 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5267  zinc uptake regulation protein, putative  35.46 
 
 		 160 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1959  putative ferric uptake regulator, Fur family  29.87 
 
 		 161 aa  92.8  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0271  ferric uptake regulator family protein  37.41 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4139  ferric uptake regulator family protein  37.69 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0983423 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1172  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  32.03 
 
 		 197 aa  89  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.842565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0493  ferric-uptake regulator  31.94 
 
 		 177 aa  89.4  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.592412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0292  ferric uptake regulator family protein  33.56 
 
 		 174 aa  89.4  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0252498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7635  ferric uptake regulator family protein  33.56 
 
 		 163 aa  88.6  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0518  ferric uptake regulator, Fur family  34.04 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0134  ferric uptake regulator family protein  33.1 
 
 		 161 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74995  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5109  ferric uptake regulator family protein  33.8 
 
 		 161 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.143994 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1045  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  32.03 
 
 		 197 aa  88.2  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.806261  normal  0.0331742 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1729  ferric uptake regulator family protein  32.65 
 
 		 164 aa  87.8  6e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0975  putative ferric uptake regulator, Fur family  30.13 
 
 		 184 aa  87  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0119  FUR family transcriptional regulator  35 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.723813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2432  ferric uptake regulator, Fur family  33.57 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00932127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3179  ferric uptake regulator, Fur family protein  33.33 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04819  transcriptional regulator, Fur family  33.33 
 
 		 168 aa  85.9  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00840  zinc uptake transcriptional regulator, Fur family  33.8 
 
 		 161 aa  85.9  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0060  zinc uptake regulation protein, putative  34.51 
 
 		 160 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0618  ferric uptake regulator family protein  30.28 
 
 		 163 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1195  ferric uptake regulator family protein  33.1 
 
 		 162 aa  84.7  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal  0.113542 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0812  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  30.94 
 
 		 167 aa  84.7  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.139641 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0524  ferric uptake regulator family protein  32.17 
 
 		 162 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.912553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0136  ferric uptake regulator family protein  34.27 
 
 		 161 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4894  ferric uptake regulator, Fur family  32.41 
 
 		 190 aa  84.3  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.164543 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5385  ferric uptake regulator family protein  31.29 
 
 		 173 aa  84.3  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2424  ferric-uptake regulator  31.47 
 
 		 163 aa  84.3  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.688654  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5586  ferric uptake regulator, Fur family  33.1 
 
 		 176 aa  84.3  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0827067  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2029  FUR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 169 aa  83.6  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.653891  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1951  ferric uptake regulator family protein  30.82 
 
 		 169 aa  83.6  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0159  transcriptional regulator  32.45 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1776  ferric uptake regulator family protein  32.39 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000166629 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3128  ferric uptake regulator family protein  30.92 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0489  ferric uptake regulator family protein  32.21 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.574052  normal  0.122535 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0255  ferric uptake regulator family protein  30.77 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.127404 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1888  ferric uptake regulator family protein  34.81 
 
 		 175 aa  80.5  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0469325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0247  ferric uptake regulator family protein  30.94 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0412  zinc uptake regulation protein  29.61 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.338359  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3775  ferric uptake regulator family protein  30.34 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0319  zinc uptake regulator ZUR  31.29 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0766  ferric uptake regulator family protein  30.14 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.885762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1462  transcriptional regulator  30.08 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.177861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0387  zinc uptake regulation protein  33.57 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.183946  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0376  ferric uptake regulator family protein  32.59 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.872531 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1911  ferric uptake regulator family protein  32.64 
 
 		 177 aa  77.8  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3152  ABC-type uncharacterized transport systems ATPase components-like protein  31.03 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.459101 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2033  FUR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 171 aa  77.4  0.00000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.728485  normal  0.0108698 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2336  ferric uptake regulator family protein  30.32 
 
 		 173 aa  77.4  0.00000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3354  ferric uptake regulator family protein  33.08 
 
 		 197 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000170522 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3523  zinc uptake transcriptional repressor  30.46 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1882  ferric uptake regulator family protein  31.76 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161499  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0059  zinc uptake regulation protein, putative  32.88 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0302  hypothetical protein  30.56 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0285  hypothetical protein  30.56 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3182  ferric uptake regulator family protein  32.61 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.346814  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5738  ferric uptake regulator, Fur family  31.62 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002343  zinc uptake regulation protein ZUR  32.19 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3054  ferric uptake regulator, Fur family  30.41 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3010  ferric uptake regulator family protein  33.08 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.184065 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0184  ferric uptake regulator family protein  28.39 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0654518  hitchhiker  0.00635481 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3397  zinc uptake transcriptional repressor  31.13 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0516  zinc uptake transcriptional repressor  28.66 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0734  zinc uptake transcriptional repressor  28.66 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.660786  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3615  ferric uptake regulator family protein  30.37 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0123339 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0554  ferric uptake regulator, Fur family  31.94 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.028923  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3503  ferric uptake regulator family protein  28.57 
 
 		 166 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.248398 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0593  ferric uptake regulator family protein  31.88 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.687838  hitchhiker  0.00515693 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0488  zinc uptake regulation protein  27.34 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.695603  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00010  zinc uptake regulation protein  33.57 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3569  Zinc-uptake regulator, Zur  31.85 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0313  ferric uptake regulator family protein  29.8 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3252  ferric uptake regulator family protein  31.85 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0890854 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3859  zinc uptake transcriptional repressor  30.46 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4457  zinc uptake transcriptional repressor  30 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1301  zinc uptake transcriptional repressor  30.46 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3769  zinc uptake transcriptional repressor  30.46 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.352583  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2360  ferric uptake regulator family protein  29.63 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.930624  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1087  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.751494  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3648  ferric uptake regulator family protein  32.56 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0129314  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2788  putative zinc uptake regulation protein  31.39 
 
 		 155 aa  67  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2188  transcriptional regulator Fur family  31.01 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0800466  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4003  ferric uptake regulator family protein  31.58 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162019  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0718  ferric uptake regulator  29.41 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00407056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4551  zinc uptake transcriptional repressor  28.29 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3947  ferric uptake regulator, Fur family  28.29 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03878  hypothetical protein  28.29 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4599  zinc uptake transcriptional repressor  28.29 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5527  zinc uptake transcriptional repressor  28.29 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.508187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4286  zinc uptake transcriptional repressor  28.29 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4508  zinc uptake transcriptional repressor  28.29 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1703  putative zinc uptake regulation protein  32.67 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0261954  normal  0.0208783 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>