201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06414 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06414  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  309  7.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1974  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase, subtype 1  42.42 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0297  ferric uptake regulator family protein  40.6 
 
 		 159 aa  102  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0271  ferric uptake regulator family protein  44.27 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1462  transcriptional regulator  32.61 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.177861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5738  ferric uptake regulator, Fur family  31.79 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0489  ferric uptake regulator family protein  33.8 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.574052  normal  0.122535 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0159  transcriptional regulator  35.07 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2432  ferric uptake regulator, Fur family  29.93 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00932127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3179  ferric uptake regulator, Fur family protein  32.81 
 
 		 149 aa  77  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0812  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  34.81 
 
 		 167 aa  77.4  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.139641 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3503  ferric uptake regulator family protein  32.65 
 
 		 166 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.248398 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2188  transcriptional regulator Fur family  38.64 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0800466  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1911  ferric uptake regulator family protein  36.3 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1210  ferric uptake regulator, Fur family  35.1 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.427545  decreased coverage  0.00910774 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0766  ferric uptake regulator family protein  37.04 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.885762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04819  transcriptional regulator, Fur family  33.55 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3152  ABC-type uncharacterized transport systems ATPase components-like protein  31.47 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.459101 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1172  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  32.88 
 
 		 197 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.842565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4139  ferric uptake regulator family protein  31.97 
 
 		 164 aa  73.9  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0983423 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1882  ferric uptake regulator family protein  30.41 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161499  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1045  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  32.88 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.806261  normal  0.0331742 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1694  ferric uptake regulator family protein  35.82 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.924713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3010  ferric uptake regulator family protein  36.92 
 
 		 159 aa  72  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.184065 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7635  ferric uptake regulator family protein  30.34 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0493  ferric-uptake regulator  30.99 
 
 		 177 aa  71.2  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.592412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1959  putative ferric uptake regulator, Fur family  32.61 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0975  putative ferric uptake regulator, Fur family  31.47 
 
 		 184 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2029  FUR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.653891  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0247  ferric uptake regulator family protein  32.84 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1951  ferric uptake regulator family protein  35.14 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3615  ferric uptake regulator family protein  31.29 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0123339 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3523  zinc uptake transcriptional repressor  30.92 
 
 		 169 aa  70.5  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1888  ferric uptake regulator family protein  33.59 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0469325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2788  putative zinc uptake regulation protein  31.25 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0734  zinc uptake transcriptional repressor  29.86 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.660786  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0376  ferric uptake regulator family protein  29.85 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.872531 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1729  ferric uptake regulator family protein  31.51 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3397  zinc uptake transcriptional repressor  29.45 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0313  ferric uptake regulator family protein  33.08 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5109  ferric uptake regulator family protein  32.41 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.143994 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3128  ferric uptake regulator family protein  31.54 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002343  zinc uptake regulation protein ZUR  31.25 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0119  FUR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.723813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0524  ferric uptake regulator family protein  32.87 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.912553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0593  ferric uptake regulator family protein  31.3 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.687838  hitchhiker  0.00515693 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2033  FUR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.728485  normal  0.0108698 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0518  ferric uptake regulator, Fur family  30.56 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4496  ferric uptake regulator family protein  33.59 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0516  zinc uptake transcriptional repressor  29.86 
 
 		 171 aa  67.4  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5385  ferric uptake regulator family protein  31.58 
 
 		 173 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1125  FUR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.858412  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4894  ferric uptake regulator, Fur family  30 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.164543 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0718  ferric uptake regulator  29.25 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00407056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1776  ferric uptake regulator family protein  29.08 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000166629 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5586  ferric uptake regulator, Fur family  30.07 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0827067  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00010  zinc uptake regulation protein  30.67 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2336  ferric uptake regulator family protein  28.03 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1030  FUR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.718199  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4457  zinc uptake transcriptional repressor  30 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3775  ferric uptake regulator family protein  32.33 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2360  ferric uptake regulator family protein  36.08 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.930624  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0136  ferric uptake regulator family protein  32.84 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1195  ferric uptake regulator family protein  28.67 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal  0.113542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72560  transcriptional regulator np20  31.11 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0319  zinc uptake regulator ZUR  30.99 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0618  ferric uptake regulator family protein  28.87 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0134  ferric uptake regulator family protein  33.08 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74995  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0488  zinc uptake regulation protein  28.91 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.695603  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4179  ferric uptake regulator family protein  29.55 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.458354  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3859  zinc uptake transcriptional repressor  30.53 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3769  zinc uptake transcriptional repressor  30.53 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.352583  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0060  zinc uptake regulation protein, putative  29.1 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1301  zinc uptake transcriptional repressor  30.53 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6300  transcriptional regulator np20  30.6 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0292  ferric uptake regulator family protein  31.51 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0252498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3054  ferric uptake regulator, Fur family  29.01 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0554  ferric uptake regulator, Fur family  30.56 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.028923  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0387  zinc uptake regulation protein  32.62 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.183946  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3569  Zinc-uptake regulator, Zur  30.53 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0255  ferric uptake regulator family protein  29.55 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.127404 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2381  putative ferric uptake regulator, Fur family  32.06 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.972498  normal  0.534577 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3248  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0836778  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4003  ferric uptake regulator family protein  31.06 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162019  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5267  zinc uptake regulation protein, putative  31.3 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3252  ferric uptake regulator family protein  30.53 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0890854 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0276  zinc uptake regulation protein, putative  31.3 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2515  ferric uptake regulator family protein  28.57 
 
 		 218 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432858 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2647  ferric uptake regulator family protein  28.57 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2715  zinc uptake transcriptional regulator protein, Fur family  32.06 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3182  ferric uptake regulator family protein  29.05 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.346814  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0412  zinc uptake regulation protein  28.97 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.338359  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2322  transctiptional regulator, putative  30.14 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.559268  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0184  ferric uptake regulator family protein  27.97 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0654518  hitchhiker  0.00635481 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1703  putative zinc uptake regulation protein  33.33 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0261954  normal  0.0208783 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0250  zinc uptake transcriptional repressor  30.3 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.463823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3648  ferric uptake regulator family protein  32.28 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0129314  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00840  zinc uptake transcriptional regulator, Fur family  27.61 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0059  zinc uptake regulation protein, putative  30.15 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3354  ferric uptake regulator family protein  30.16 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000170522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>