235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1462 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1462  transcriptional regulator  100 
 
 		 158 aa  321  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.177861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0159  transcriptional regulator  60.9 
 
 		 156 aa  206  8e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0376  ferric uptake regulator family protein  66.22 
 
 		 154 aa  186  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.872531 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3128  ferric uptake regulator family protein  39.49 
 
 		 161 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1210  ferric uptake regulator, Fur family  32.03 
 
 		 163 aa  90.9  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.427545  decreased coverage  0.00910774 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0718  ferric uptake regulator  34.88 
 
 		 159 aa  89  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00407056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7635  ferric uptake regulator family protein  34.42 
 
 		 163 aa  89.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1888  ferric uptake regulator family protein  36.36 
 
 		 175 aa  88.6  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0469325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1951  ferric uptake regulator family protein  32.9 
 
 		 169 aa  88.6  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2029  FUR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 169 aa  88.6  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.653891  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3054  ferric uptake regulator, Fur family  32.69 
 
 		 157 aa  88.6  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0975  putative ferric uptake regulator, Fur family  35.26 
 
 		 184 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4496  ferric uptake regulator family protein  34.23 
 
 		 161 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3248  transcriptional regulator, TrmB  36.51 
 
 		 164 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0836778  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5385  ferric uptake regulator family protein  34.87 
 
 		 173 aa  87  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5109  ferric uptake regulator family protein  32.43 
 
 		 161 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.143994 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0134  ferric uptake regulator family protein  33.11 
 
 		 161 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74995  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0812  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  36.92 
 
 		 167 aa  85.5  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.139641 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5586  ferric uptake regulator, Fur family  34.81 
 
 		 176 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0827067  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04819  transcriptional regulator, Fur family  32.68 
 
 		 168 aa  85.9  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5738  ferric uptake regulator, Fur family  34.23 
 
 		 161 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2647  ferric uptake regulator family protein  33.86 
 
 		 153 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3179  ferric uptake regulator, Fur family protein  31.25 
 
 		 149 aa  84.7  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0554  ferric uptake regulator, Fur family  35.16 
 
 		 153 aa  84.3  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.028923  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0119  FUR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 135 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.723813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2515  ferric uptake regulator family protein  33.86 
 
 		 218 aa  84.3  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432858 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0867  FUR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 154 aa  84.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0136  ferric uptake regulator family protein  32.43 
 
 		 161 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0329  transcriptional regulator, putative  32.82 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0816853  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2424  ferric-uptake regulator  34.64 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.688654  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0489  ferric uptake regulator family protein  33.57 
 
 		 167 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.574052  normal  0.122535 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0627  FUR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2461  FUR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0871  FUR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0075  FUR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0493  ferric-uptake regulator  32.03 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.592412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1030  transcriptional regulator np20  33.07 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468809  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0060  zinc uptake regulation protein, putative  32 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0488  ferric uptake regulator family protein  33.1 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00616714  hitchhiker  0.00143129 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0691  transcriptional regulator, putative  33.07 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0618  ferric uptake regulator family protein  31.58 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0247  ferric uptake regulator family protein  30.94 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1195  ferric uptake regulator family protein  32.9 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal  0.113542 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1172  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  34.67 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.842565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1989  ferric uptake regulator family protein  32.82 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2599  ferric uptake regulator family protein  32.82 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2623  ferric uptake regulator family protein  32.82 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.195295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0698  ferric uptake regulator family protein  32.06 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.470229 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5930  ferric uptake regulator family protein  33.07 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1045  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  36.64 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.806261  normal  0.0331742 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06414  hypothetical protein  32.61 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0766  ferric uptake regulator family protein  31.33 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.885762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00840  zinc uptake transcriptional regulator, Fur family  31.76 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2033  FUR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.728485  normal  0.0108698 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0297  ferric uptake regulator family protein  30.08 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0518  ferric uptake regulator, Fur family  31.21 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0059  zinc uptake regulation protein, putative  30.53 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2336  ferric uptake regulator family protein  29.63 
 
 		 173 aa  78.2  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0276  zinc uptake regulation protein, putative  32.21 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0734  zinc uptake transcriptional repressor  32.62 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.660786  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5267  zinc uptake regulation protein, putative  32.21 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0524  ferric uptake regulator family protein  30.32 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.912553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0516  zinc uptake transcriptional repressor  32.62 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72560  transcriptional regulator np20  30.67 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1729  ferric uptake regulator family protein  32.21 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6300  transcriptional regulator np20  30.67 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2788  putative zinc uptake regulation protein  35.38 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3397  zinc uptake transcriptional repressor  27.59 
 
 		 169 aa  74.7  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0412  zinc uptake regulation protein  30.07 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.338359  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002343  zinc uptake regulation protein ZUR  33.59 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1125  FUR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.858412  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4179  ferric uptake regulator family protein  31.3 
 
 		 138 aa  73.6  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.458354  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2188  transcriptional regulator Fur family  33.85 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0800466  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3503  ferric uptake regulator family protein  33.09 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.248398 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1882  ferric uptake regulator family protein  27.7 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161499  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0184  ferric uptake regulator family protein  25.17 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0654518  hitchhiker  0.00635481 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00010  zinc uptake regulation protein  33.59 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1030  FUR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 145 aa  73.6  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.718199  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0292  ferric uptake regulator family protein  32.06 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0252498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4457  zinc uptake transcriptional repressor  31.25 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1087  putative transcriptional regulator  27.73 
 
 		 128 aa  72  0.000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.751494  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1911  ferric uptake regulator family protein  33.75 
 
 		 177 aa  71.2  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3615  ferric uptake regulator family protein  30.16 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0123339 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3523  zinc uptake transcriptional repressor  26.9 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0319  zinc uptake regulator ZUR  29.68 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2432  ferric uptake regulator, Fur family  32.47 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00932127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3010  ferric uptake regulator family protein  27.89 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.184065 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1959  putative ferric uptake regulator, Fur family  26.67 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0271  ferric uptake regulator family protein  28.57 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3775  ferric uptake regulator family protein  30.2 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0593  ferric uptake regulator family protein  32.41 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.687838  hitchhiker  0.00515693 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0488  zinc uptake regulation protein  26.62 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.695603  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4894  ferric uptake regulator, Fur family  30 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.164543 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1694  ferric uptake regulator family protein  31.06 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.924713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1776  ferric uptake regulator family protein  31.78 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000166629 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0313  ferric uptake regulator family protein  29.22 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3182  ferric uptake regulator family protein  28.57 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.346814  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3769  zinc uptake transcriptional repressor  28.8 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.352583  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4635  zinc uptake transcriptional repressor  28.08 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4433  zinc uptake transcriptional repressor  28.08 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000291933 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>