More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_5109 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_5109  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 161 aa  328  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.143994 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0136  ferric uptake regulator family protein  91.3 
 
 		 161 aa  306  9e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0134  ferric uptake regulator family protein  91.3 
 
 		 161 aa  304  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74995  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0060  zinc uptake regulation protein, putative  84.38 
 
 		 160 aa  284  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5267  zinc uptake regulation protein, putative  81.25 
 
 		 160 aa  272  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4496  ferric uptake regulator family protein  80.12 
 
 		 161 aa  270  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0276  zinc uptake regulation protein, putative  79.38 
 
 		 160 aa  269  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00840  zinc uptake transcriptional regulator, Fur family  77.5 
 
 		 161 aa  262  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72560  transcriptional regulator np20  80 
 
 		 167 aa  262  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640017  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0119  FUR family transcriptional regulator  92.59 
 
 		 135 aa  261  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.723813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6300  transcriptional regulator np20  79.35 
 
 		 167 aa  259  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3775  ferric uptake regulator family protein  55.97 
 
 		 163 aa  183  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0059  zinc uptake regulation protein, putative  54.67 
 
 		 162 aa  175  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2424  ferric-uptake regulator  53.5 
 
 		 163 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.688654  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0292  ferric uptake regulator family protein  52.45 
 
 		 174 aa  171  5e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0252498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1195  ferric uptake regulator family protein  51.02 
 
 		 162 aa  157  6e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal  0.113542 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3054  ferric uptake regulator, Fur family  50 
 
 		 157 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1729  ferric uptake regulator family protein  46.79 
 
 		 164 aa  153  8e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0766  ferric uptake regulator family protein  47.68 
 
 		 160 aa  148  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.885762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0313  ferric uptake regulator family protein  46.75 
 
 		 172 aa  147  8e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3152  ABC-type uncharacterized transport systems ATPase components-like protein  47.1 
 
 		 163 aa  143  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.459101 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1882  ferric uptake regulator family protein  48.61 
 
 		 149 aa  138  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161499  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1959  putative ferric uptake regulator, Fur family  49.66 
 
 		 161 aa  137  7e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1911  ferric uptake regulator family protein  46.11 
 
 		 177 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3615  ferric uptake regulator family protein  43.24 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0123339 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7635  ferric uptake regulator family protein  46.71 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0489  ferric uptake regulator family protein  45.03 
 
 		 167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.574052  normal  0.122535 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1210  ferric uptake regulator, Fur family  45.39 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.427545  decreased coverage  0.00910774 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3569  Zinc-uptake regulator, Zur  47.74 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2322  transctiptional regulator, putative  46.94 
 
 		 340 aa  132  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.559268  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0554  ferric uptake regulator, Fur family  44.67 
 
 		 153 aa  131  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.028923  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3252  ferric uptake regulator family protein  47.74 
 
 		 163 aa  131  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0890854 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04819  transcriptional regulator, Fur family  45.33 
 
 		 168 aa  131  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4139  ferric uptake regulator family protein  44.22 
 
 		 164 aa  130  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0983423 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2029  FUR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 169 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.653891  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0867  FUR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 154 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1951  ferric uptake regulator family protein  42.67 
 
 		 169 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0691  transcriptional regulator, putative  44.83 
 
 		 216 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0618  ferric uptake regulator family protein  42.76 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0493  ferric-uptake regulator  41.45 
 
 		 177 aa  128  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.592412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2647  ferric uptake regulator family protein  45.21 
 
 		 153 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2515  ferric uptake regulator family protein  45.45 
 
 		 218 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432858 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0488  ferric uptake regulator family protein  46.38 
 
 		 163 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00616714  hitchhiker  0.00143129 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1030  transcriptional regulator np20  43.45 
 
 		 266 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468809  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2461  FUR family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 251 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2432  ferric uptake regulator, Fur family  41.61 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00932127  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0329  transcriptional regulator, putative  43.45 
 
 		 174 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0816853  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0075  FUR family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0871  FUR family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0627  FUR family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0319  zinc uptake regulator ZUR  42.28 
 
 		 162 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2623  ferric uptake regulator family protein  44.14 
 
 		 153 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.195295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5930  ferric uptake regulator family protein  44.14 
 
 		 153 aa  124  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1989  ferric uptake regulator family protein  44.14 
 
 		 153 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2599  ferric uptake regulator family protein  44.14 
 
 		 153 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0184  ferric uptake regulator family protein  41.57 
 
 		 192 aa  123  8.000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0654518  hitchhiker  0.00635481 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5586  ferric uptake regulator, Fur family  49.29 
 
 		 176 aa  123  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0827067  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1888  ferric uptake regulator family protein  41.61 
 
 		 175 aa  122  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0469325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0518  ferric uptake regulator, Fur family  42.76 
 
 		 165 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1172  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  45.95 
 
 		 197 aa  122  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.842565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5385  ferric uptake regulator family protein  50 
 
 		 173 aa  121  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1703  putative zinc uptake regulation protein  46.75 
 
 		 165 aa  121  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0261954  normal  0.0208783 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0524  ferric uptake regulator family protein  41.61 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.912553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0975  putative ferric uptake regulator, Fur family  45.58 
 
 		 184 aa  121  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0812  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  44.03 
 
 		 167 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.139641 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1045  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  45.27 
 
 		 197 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.806261  normal  0.0331742 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0698  ferric uptake regulator family protein  44.2 
 
 		 186 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.470229 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0718  ferric uptake regulator  46.1 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00407056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3128  ferric uptake regulator family protein  45.75 
 
 		 161 aa  119  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0247  ferric uptake regulator family protein  41.55 
 
 		 143 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0593  ferric uptake regulator family protein  44.37 
 
 		 145 aa  114  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.687838  hitchhiker  0.00515693 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3179  ferric uptake regulator, Fur family protein  40.56 
 
 		 149 aa  114  6.9999999999999995e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3182  ferric uptake regulator family protein  42.11 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.346814  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0302  hypothetical protein  42.96 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0285  hypothetical protein  42.96 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0412  zinc uptake regulation protein  42.96 
 
 		 146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.338359  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3248  transcriptional regulator, TrmB  45.24 
 
 		 164 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0836778  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002343  zinc uptake regulation protein ZUR  40.71 
 
 		 154 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0255  ferric uptake regulator family protein  44.8 
 
 		 161 aa  110  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.127404 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2033  FUR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 171 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.728485  normal  0.0108698 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0387  zinc uptake regulation protein  41.43 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.183946  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1776  ferric uptake regulator family protein  40.94 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000166629 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2336  ferric uptake regulator family protein  37.68 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3010  ferric uptake regulator family protein  41.35 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.184065 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00010  zinc uptake regulation protein  40.71 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3523  zinc uptake transcriptional repressor  39.57 
 
 		 169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4894  ferric uptake regulator, Fur family  40.27 
 
 		 190 aa  107  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.164543 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2788  putative zinc uptake regulation protein  40.44 
 
 		 155 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0734  zinc uptake transcriptional repressor  39.44 
 
 		 171 aa  107  8.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.660786  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0516  zinc uptake transcriptional repressor  39.44 
 
 		 171 aa  106  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3397  zinc uptake transcriptional repressor  38.13 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3859  zinc uptake transcriptional repressor  41.3 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3769  zinc uptake transcriptional repressor  41.3 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.352583  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1301  zinc uptake transcriptional repressor  41.3 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0376  ferric uptake regulator family protein  37.01 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.872531 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4457  zinc uptake transcriptional repressor  39.86 
 
 		 170 aa  99.8  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0488  zinc uptake regulation protein  35.25 
 
 		 147 aa  97.8  5e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.695603  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4498  zinc uptake transcriptional repressor  38.41 
 
 		 171 aa  97.4  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4583  zinc uptake transcriptional repressor  38.41 
 
 		 171 aa  97.4  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4635  zinc uptake transcriptional repressor  38.41 
 
 		 171 aa  97.4  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.292781 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>