198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0285 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0302  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  311  2.9999999999999996e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0285  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  311  2.9999999999999996e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0136  ferric uptake regulator family protein  42.55 
 
 
161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4496  ferric uptake regulator family protein  42.45 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5109  ferric uptake regulator family protein  42.96 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.143994 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0060  zinc uptake regulation protein, putative  42.96 
 
 
160 aa  111  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1959  putative ferric uptake regulator, Fur family  38.62 
 
 
161 aa  111  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0134  ferric uptake regulator family protein  42.25 
 
 
161 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74995  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72560  transcriptional regulator np20  44.2 
 
 
167 aa  110  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640017  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5267  zinc uptake regulation protein, putative  42.14 
 
 
160 aa  110  9e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1882  ferric uptake regulator family protein  40 
 
 
149 aa  110  9e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161499  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0119  FUR family transcriptional regulator  43.18 
 
 
135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.723813  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2424  ferric-uptake regulator  40.29 
 
 
163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.688654  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0276  zinc uptake regulation protein, putative  42.14 
 
 
160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3775  ferric uptake regulator family protein  41.61 
 
 
163 aa  107  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6300  transcriptional regulator np20  43.17 
 
 
167 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0489  ferric uptake regulator family protein  37.41 
 
 
167 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.574052  normal  0.122535 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00840  zinc uptake transcriptional regulator, Fur family  41.01 
 
 
161 aa  103  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1729  ferric uptake regulator family protein  37.59 
 
 
164 aa  102  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0292  ferric uptake regulator family protein  35.77 
 
 
174 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0252498  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0766  ferric uptake regulator family protein  38.41 
 
 
160 aa  101  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.885762  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0255  ferric uptake regulator family protein  38.71 
 
 
161 aa  101  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.127404 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4139  ferric uptake regulator family protein  35.21 
 
 
164 aa  100  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0983423 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3152  ABC-type uncharacterized transport systems ATPase components-like protein  35.97 
 
 
163 aa  99.4  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.459101 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3179  ferric uptake regulator, Fur family protein  35.92 
 
 
149 aa  99  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7635  ferric uptake regulator family protein  36.43 
 
 
163 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0247  ferric uptake regulator family protein  37.86 
 
 
143 aa  97.8  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0493  ferric-uptake regulator  34.78 
 
 
177 aa  97.4  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.592412  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0524  ferric uptake regulator family protein  35 
 
 
162 aa  94.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.912553  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0313  ferric uptake regulator family protein  34.78 
 
 
172 aa  93.6  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0618  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 
163 aa  93.6  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5586  ferric uptake regulator, Fur family  35.21 
 
 
176 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0827067  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0593  ferric uptake regulator family protein  35.97 
 
 
145 aa  93.2  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.687838  hitchhiker  0.00515693 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0412  zinc uptake regulation protein  34.97 
 
 
146 aa  92.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.338359  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0319  zinc uptake regulator ZUR  34.06 
 
 
162 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3615  ferric uptake regulator family protein  35.04 
 
 
156 aa  92.8  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0123339 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0518  ferric uptake regulator, Fur family  34.78 
 
 
165 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2432  ferric uptake regulator, Fur family  35.51 
 
 
156 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00932127  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0387  zinc uptake regulation protein  35.21 
 
 
149 aa  91.3  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.183946  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2033  FUR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
171 aa  91.3  5e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.728485  normal  0.0108698 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5385  ferric uptake regulator family protein  34.51 
 
 
173 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0975  putative ferric uptake regulator, Fur family  32.14 
 
 
184 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3569  Zinc-uptake regulator, Zur  37.1 
 
 
167 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2336  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 
173 aa  88.2  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0184  ferric uptake regulator family protein  34.69 
 
 
192 aa  88.6  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0654518  hitchhiker  0.00635481 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3252  ferric uptake regulator family protein  36.29 
 
 
163 aa  87.8  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0890854 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1172  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  31.43 
 
 
197 aa  87.4  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.842565  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0059  zinc uptake regulation protein, putative  31.21 
 
 
162 aa  87.4  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3859  zinc uptake transcriptional repressor  33.1 
 
 
170 aa  87.4  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3769  zinc uptake transcriptional repressor  33.1 
 
 
170 aa  87.4  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.352583  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1301  zinc uptake transcriptional repressor  33.57 
 
 
172 aa  87  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3523  zinc uptake transcriptional repressor  32.86 
 
 
169 aa  87  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0812  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  32.82 
 
 
167 aa  86.3  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.139641 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0734  zinc uptake transcriptional repressor  34.29 
 
 
171 aa  86.7  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.660786  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1195  ferric uptake regulator family protein  34.56 
 
 
162 aa  86.3  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal  0.113542 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1703  putative zinc uptake regulation protein  37.6 
 
 
165 aa  86.3  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0261954  normal  0.0208783 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3010  ferric uptake regulator family protein  36.15 
 
 
159 aa  86.3  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.184065 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1210  ferric uptake regulator, Fur family  37.5 
 
 
163 aa  85.9  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.427545  decreased coverage  0.00910774 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04819  transcriptional regulator, Fur family  35.71 
 
 
168 aa  85.9  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1045  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  30.71 
 
 
197 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.806261  normal  0.0331742 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1888  ferric uptake regulator family protein  32.86 
 
 
175 aa  85.1  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0469325  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3128  ferric uptake regulator family protein  32.86 
 
 
161 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289928  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5738  ferric uptake regulator, Fur family  31.65 
 
 
161 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002343  zinc uptake regulation protein ZUR  32.14 
 
 
154 aa  84.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3054  ferric uptake regulator, Fur family  34.48 
 
 
157 aa  84.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0554  ferric uptake regulator, Fur family  33.79 
 
 
153 aa  84.3  6e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.028923  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1911  ferric uptake regulator family protein  38.19 
 
 
177 aa  84  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0516  zinc uptake transcriptional repressor  33.57 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0250  zinc uptake transcriptional repressor  35.46 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4433  zinc uptake transcriptional repressor  33.57 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000291933 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4635  zinc uptake transcriptional repressor  33.57 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00010  zinc uptake regulation protein  33.57 
 
 
161 aa  82  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3503  ferric uptake regulator family protein  33.1 
 
 
166 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.248398 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0488  ferric uptake regulator family protein  31.39 
 
 
163 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00616714  hitchhiker  0.00143129 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4498  zinc uptake transcriptional repressor  33.57 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4551  zinc uptake transcriptional repressor  34.29 
 
 
171 aa  82  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4584  zinc uptake transcriptional repressor  33.57 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.735671  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4583  zinc uptake transcriptional repressor  33.57 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03918  DNA-binding transcriptional repressor, Zn(II)-binding  34.29 
 
 
171 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3947  ferric uptake regulator, Fur family  34.29 
 
 
171 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03878  hypothetical protein  34.29 
 
 
171 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3982  zinc uptake transcriptional repressor  34.29 
 
 
171 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.224982 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4508  zinc uptake transcriptional repressor  34.29 
 
 
171 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3182  ferric uptake regulator family protein  33.57 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.346814  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2029  FUR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.653891  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4286  zinc uptake transcriptional repressor  34.29 
 
 
171 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3397  zinc uptake transcriptional repressor  32.14 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1951  ferric uptake regulator family protein  34.85 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4599  zinc uptake transcriptional repressor  34.29 
 
 
171 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5527  zinc uptake transcriptional repressor  34.29 
 
 
171 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.508187  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4457  zinc uptake transcriptional repressor  33.33 
 
 
170 aa  80.5  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2647  ferric uptake regulator family protein  32.12 
 
 
153 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0329  transcriptional regulator, putative  31.39 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0816853  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1030  transcriptional regulator np20  31.39 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468809  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0691  transcriptional regulator, putative  31.39 
 
 
216 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2515  ferric uptake regulator family protein  32.12 
 
 
218 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.432858 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0627  FUR family transcriptional regulator  31.39 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2461  FUR family transcriptional regulator  31.39 
 
 
251 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0871  FUR family transcriptional regulator  31.39 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0075  FUR family transcriptional regulator  31.39 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>