31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3951 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3951  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 165 aa  325  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.781008  normal  0.0311151 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2813  ferric uptake regulator family protein  49.01 
 
 		 167 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.162605  normal  0.605747 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1145  ferric uptake regulator family protein  39.04 
 
 		 168 aa  86.7  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2054  ferric uptake regulator family protein  36.36 
 
 		 181 aa  85.5  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1677  ferric uptake regulator family protein  36.26 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.531485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3640  hypothetical protein  32.89 
 
 		 155 aa  70.5  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3702  ferric uptake regulator, Fur family  31.17 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3379  ferric uptake regulator, Fur family  31.13 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0931  ferric uptake regulator family protein  25.87 
 
 		 130 aa  53.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2512  ferric uptake regulator family protein  28.57 
 
 		 201 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.450617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0546  ferric uptake regulator family protein  31.91 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0164  putative transcription regulator protein  30.28 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0621  putative ferric uptake regulator, Fur family  28.39 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.776664  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4566  Fur family transcriptional regulator protein  27.46 
 
 		 136 aa  46.6  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0128  ferric uptake regulator family protein  27.46 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1335 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1389  ferric uptake regulation protein  26.71 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000498211  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0048  putative transcription regulator protein  28.95 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1451  ferric uptake regulation protein  26.71 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000060196  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1373  ferric uptake regulator, Fur family  22.82 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000536701  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2623  ferric uptake regulation protein  26.49 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.376677  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0184  ferric uptake regulator, Fur family  26.95 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.567959  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11678  putative transcription regulator  21.01 
 
 		 137 aa  43.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0734  ferric uptake regulator family protein  24 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000194517  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2986  ferric uptake regulator, Fur family  25.79 
 
 		 143 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.105319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1411  ferric uptake regulator family protein  22.67 
 
 		 150 aa  42.4  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2576  ferric uptake regulator, Fur family  25.79 
 
 		 143 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.710249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0894  ferric uptake regulator family protein  29.35 
 
 		 152 aa  42  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572753 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2747  ferric uptake transcriptional repressor transcription regulator protein  27.45 
 
 		 143 aa  42  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3496  ferric uptake regulator, Fur family  31.08 
 
 		 152 aa  40.8  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0229  ferric uptake regulator family protein  26.17 
 
 		 151 aa  40.8  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1194  ferric-uptake regulator  26.45 
 
 		 159 aa  40.8  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>