180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0128 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0128  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 169 aa  345  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1335 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0164  putative transcription regulator protein  73.94 
 
 		 172 aa  236  9e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3702  ferric uptake regulator, Fur family  57.24 
 
 		 175 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3379  ferric uptake regulator, Fur family  57.24 
 
 		 175 aa  171  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0048  putative transcription regulator protein  57.14 
 
 		 172 aa  165  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1467  transcriptional regulator, Fur family  45.65 
 
 		 158 aa  120  8e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1183  ferric uptake regulator, Fur family  45.65 
 
 		 158 aa  120  8e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.837957 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1233  ferric uptake regulator family protein  39.01 
 
 		 147 aa  112  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3496  ferric uptake regulator, Fur family  43.94 
 
 		 152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2512  ferric uptake regulator family protein  38.3 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.450617  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3018  ferric uptake regulator, Fur family  37.78 
 
 		 145 aa  84  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0481144  normal  0.294593 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0025  ferric uptake regulator family protein  34.29 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344249  normal  0.157034 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1728  ferric uptake regulator family protein  36.17 
 
 		 164 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.597021 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0621  putative ferric uptake regulator, Fur family  31.16 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.776664  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0116  ferric uptake regulator, Fur family  36.96 
 
 		 142 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.241411 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3640  hypothetical protein  38.85 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1604  putative transcription regulator protein  37.58 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000436344  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0931  ferric uptake regulator family protein  30.3 
 
 		 130 aa  72  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0533  ferric uptake regulator, Fur family  29.86 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2211  ferric uptake regulator family protein  32.21 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.395667  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4566  Fur family transcriptional regulator protein  30.71 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2685  ferric uptake regulator family protein  29.85 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0992523 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1930  ferric uptake regulator, Fur family  29.46 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0747  ferric-uptake regulator  30.82 
 
 		 152 aa  62  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3965  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5541  ferric uptake regulator, Fur family  29.1 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.713771 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0734  ferric uptake regulator family protein  28.87 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000194517  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11678  putative transcription regulator  29.52 
 
 		 137 aa  57.4  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1469  ferric uptake regulator, Fur family  32.58 
 
 		 130 aa  57  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0185274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2366  ferric uptake regulator family protein  41.77 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171245 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3239  ferric uptake regulator, Fur family  32.85 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0517924 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24980  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  29.63 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13391  hypothetical protein  35.24 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2623  ferric uptake regulation protein  30.77 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.376677  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3389  ferric uptake regulator family protein  33.08 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.261962  normal  0.0261677 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3564  ferric uptake regulator family protein  31.65 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.201475 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2124  ferric uptake regulator, Fur family  30.77 
 
 		 157 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.506102  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0132  ferric-uptake regulator  24.6 
 
 		 123 aa  53.1  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07031  ferric uptake regulator family protein  33.82 
 
 		 150 aa  52.4  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0821588  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0045  ferric uptake regulator, Fur family  27.61 
 
 		 137 aa  52.4  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.4921e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2145  ferric-uptake regulator  29.27 
 
 		 164 aa  51.6  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1453  ferric uptake regulator, Fur family  30.83 
 
 		 151 aa  51.6  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.023883  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3240  ferric uptake regulator family protein  28.29 
 
 		 148 aa  51.2  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000230922  hitchhiker  0.00191408 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4458  ferric uptake regulator family protein  29.93 
 
 		 141 aa  51.6  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.342841  hitchhiker  0.00667855 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1293  ferric uptake regulator family protein  30.66 
 
 		 149 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1411  ferric uptake regulator family protein  25.5 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1144  ferric uptake regulator family protein  32.17 
 
 		 137 aa  50.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2813  ferric uptake regulator family protein  32.12 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.162605  normal  0.605747 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0466  ferric uptake regulator family protein  27.41 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000190383  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1649  ferric uptake regulator family protein  29.2 
 
 		 149 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0556503  hitchhiker  0.00120732 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2159  ferric uptake regulator family protein  29.14 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00488582 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3523  zinc uptake transcriptional repressor  27.38 
 
 		 169 aa  49.3  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1879  ferric uptake regulator, Fur family  31.85 
 
 		 139 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00751157  normal  0.013308 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0593  ferric uptake regulator family protein  28.86 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.687838  hitchhiker  0.00515693 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4538  ferric uptake regulator family protein  34.56 
 
 		 134 aa  49.3  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148082  normal  0.344615 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2294  ferric uptake regulator, Fur family  29.46 
 
 		 123 aa  48.5  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4057  ferric uptake regulator, Fur family  31.54 
 
 		 151 aa  48.9  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3859  zinc uptake transcriptional repressor  29.56 
 
 		 170 aa  48.9  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3944  ferric uptake regulator, Fur family  31.54 
 
 		 151 aa  48.9  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3769  zinc uptake transcriptional repressor  29.56 
 
 		 170 aa  48.9  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.352583  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06414  hypothetical protein  24.5 
 
 		 152 aa  48.5  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1301  zinc uptake transcriptional repressor  29.56 
 
 		 172 aa  48.9  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  31.91 
 
 		 146 aa  48.1  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  30.41 
 
 		 159 aa  48.1  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0294  ferric uptake regulator, Fur family  28.78 
 
 		 170 aa  48.1  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.774382  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1991  ferric uptake regulator family protein  30.88 
 
 		 151 aa  47.8  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06931  ferric uptake regulator family protein  31.62 
 
 		 150 aa  47.8  0.00007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.247961  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0515  ferric uptake regulator, Fur family  23.4 
 
 		 142 aa  47.8  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06641  ferric uptake regulator family protein  30.88 
 
 		 150 aa  47.8  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36340  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  27.34 
 
 		 151 aa  47.8  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0839  ferric-uptake regulator  28.17 
 
 		 143 aa  47.4  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0077  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  30 
 
 		 154 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1775  ferric uptake regulator family protein  32.47 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.103697  normal  0.0302993 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0637  ferric uptake regulator family protein  30 
 
 		 150 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.835222  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3007  ferric uptake regulator, Fur family  25 
 
 		 143 aa  47.4  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3370  ferric uptake regulator, Fur family  35.46 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.073099  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20420  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  31.16 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.375668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07451  ferric uptake regulator family protein  30.07 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0979772 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1623  ferric uptake regulator, Fur family  32.86 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3292  FUR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 121 aa  45.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000231053  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0391  FUR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 159 aa  45.8  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2705  ferric uptake regulator, Fur family  30.34 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.344666 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2727  ferric uptake regulator family protein  25.87 
 
 		 135 aa  45.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284846  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0519  ferric uptake regulator family protein  30.77 
 
 		 135 aa  45.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.639512  normal  0.494415 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  27.21 
 
 		 144 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2053  ferric-uptake regulator  25.81 
 
 		 201 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0603  ferric uptake regulator family protein  29.41 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1373  ferric uptake regulator, Fur family  26.28 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000536701  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  28.21 
 
 		 142 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0885  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  29.1 
 
 		 142 aa  45.4  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  28.21 
 
 		 142 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  27.74 
 
 		 142 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  27.74 
 
 		 142 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  27.74 
 
 		 142 aa  45.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0059  zinc uptake regulation protein, putative  38.03 
 
 		 162 aa  45.1  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  28.1 
 
 		 143 aa  45.1  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  27.21 
 
 		 138 aa  45.1  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0255  ferric uptake regulator family protein  29.23 
 
 		 161 aa  45.1  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.127404 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  26.11 
 
 		 150 aa  45.1  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  26.28 
 
 		 152 aa  44.7  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>