183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5541 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5541  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 
138 aa  284  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.713771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4566  Fur family transcriptional regulator protein  59.12 
 
 
136 aa  168  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2685  ferric uptake regulator family protein  46.15 
 
 
146 aa  128  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0992523 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0533  ferric uptake regulator, Fur family  48.06 
 
 
141 aa  122  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11678  putative transcription regulator  38.41 
 
 
137 aa  98.6  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0931  ferric uptake regulator family protein  35.77 
 
 
130 aa  91.3  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3496  ferric uptake regulator, Fur family  32.61 
 
 
152 aa  87  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1183  ferric uptake regulator, Fur family  34.04 
 
 
158 aa  84.3  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.837957 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1467  transcriptional regulator, Fur family  34.04 
 
 
158 aa  84.3  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1604  putative transcription regulator protein  31.5 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000436344  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2512  ferric uptake regulator family protein  34.13 
 
 
201 aa  80.5  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.450617  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3702  ferric uptake regulator, Fur family  32.84 
 
 
175 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3379  ferric uptake regulator, Fur family  32.84 
 
 
175 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1930  ferric uptake regulator, Fur family  29.1 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1233  ferric uptake regulator family protein  29.5 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0164  putative transcription regulator protein  29.37 
 
 
172 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0048  putative transcription regulator protein  32.09 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0128  ferric uptake regulator family protein  28.37 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.1335 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1120  FUR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.224553  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1612  ferric uptake regulator family protein  31.88 
 
 
136 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.339502  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1646  ferric-uptake regulator  31.88 
 
 
136 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07451  ferric uptake regulator family protein  34.09 
 
 
148 aa  61.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0979772 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0025  ferric uptake regulator family protein  27.41 
 
 
149 aa  57.8  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344249  normal  0.157034 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3018  ferric uptake regulator, Fur family  31.85 
 
 
145 aa  57.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0481144  normal  0.294593 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07031  ferric uptake regulator family protein  32.58 
 
 
150 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0821588  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13391  hypothetical protein  30.6 
 
 
186 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2401  ferric uptake regulator, Fur family  30.94 
 
 
141 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06931  ferric uptake regulator family protein  31.82 
 
 
150 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.247961  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  26.87 
 
 
153 aa  54.3  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06641  ferric uptake regulator family protein  31.82 
 
 
150 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0747  ferric-uptake regulator  30.37 
 
 
152 aa  53.9  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 
147 aa  53.5  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0637  ferric uptake regulator family protein  31.82 
 
 
150 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.835222  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0987  ferric uptake regulator family protein  33.77 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00388915 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1144  ferric uptake regulator family protein  30.23 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0734  ferric uptake regulator family protein  26.21 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000194517  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1775  ferric uptake regulator family protein  30.08 
 
 
151 aa  51.6  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.103697  normal  0.0302993 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3397  zinc uptake transcriptional repressor  27.4 
 
 
169 aa  52  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3523  zinc uptake transcriptional repressor  28.77 
 
 
169 aa  51.2  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0184  ferric uptake regulator, Fur family  25.18 
 
 
143 aa  51.6  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.567959  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0077  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  30.08 
 
 
154 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1648  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 
149 aa  50.4  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.499744 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  28.57 
 
 
143 aa  50.4  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0170  ferric uptake regulator, Fur family  28.06 
 
 
139 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  28.03 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4359  FUR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.291339  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4181  FUR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4019  FUR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.642016  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4029  FUR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742096  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4503  FUR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.606254  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0734  zinc uptake transcriptional repressor  27.52 
 
 
171 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.660786  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4413  transcriptional regulator, Fur family  31.94 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000236646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4301  transcriptional regulator, Fur family  31.94 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.08025e-17 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11800  zinc uptake regulator, Fur family  26.52 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00894406  normal  0.765019 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1727  ferric uptake regulator, Fur family  31.03 
 
 
146 aa  48.9  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  28.26 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1272  ferric uptake regulator family protein  29.79 
 
 
158 aa  48.1  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0931  ferric uptake regulator family protein  27.86 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2171  ferric uptake regulator, Fur family  27.27 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00854605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  27.07 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4132  ferric uptake regulator family protein  30.99 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4397  transcriptional regulator, Fur family  31.94 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.108592  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0132  ferric-uptake regulator  22.05 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0208  ferric uptake regulator family protein  27.21 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1882  ferric uptake regulator family protein  26.9 
 
 
149 aa  47.4  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161499  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2141  ferric uptake regulator family protein  28.24 
 
 
137 aa  47.8  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1188  ferric uptake regulator, Fur family  30.28 
 
 
146 aa  47.8  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1959  putative ferric uptake regulator, Fur family  30.56 
 
 
161 aa  47.8  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2745  ferric uptake regulator, Fur family  26.57 
 
 
138 aa  47.4  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  28.26 
 
 
152 aa  47.4  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1411  ferric uptake regulator family protein  28.89 
 
 
150 aa  47  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  26.76 
 
 
146 aa  47  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0516  zinc uptake transcriptional repressor  26.85 
 
 
171 aa  47  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2211  ferric uptake regulator family protein  25.71 
 
 
150 aa  47  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.395667  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1165  ferric uptake regulator family protein  31.34 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0381194  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07800  zinc uptake regulator, Fur family  32.63 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1934  zinc uptake regulator  27.74 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395595  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1991  ferric uptake regulator family protein  28.26 
 
 
151 aa  46.2  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07001  ferric uptake regulator family protein  34.74 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0209563  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  28.37 
 
 
130 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3007  ferric uptake regulator family protein  32.88 
 
 
137 aa  47  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.830794  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  26.32 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0564  ferric uptake regulator  32.09 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21120  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  29.29 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  27.59 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0515  zinc uptake regulation protein  22.48 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1789  ferric uptake regulator, Fur family  30.6 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.372499  normal  0.929582 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2424  ferric-uptake regulator  27.08 
 
 
163 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.688654  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  24.48 
 
 
150 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3007  ferric uptake regulator, Fur family  27.01 
 
 
143 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4457  zinc uptake transcriptional repressor  33 
 
 
170 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0615  ferric uptake regulator, Fur family  28.17 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.12884  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0847  ferric uptake regulator, Fur family  27.46 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0621  putative ferric uptake regulator, Fur family  26.43 
 
 
155 aa  45.1  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.776664  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1958  ferric uptake regulator family protein  33.04 
 
 
170 aa  44.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0491085  hitchhiker  0.00899541 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0839  transcriptional regulator, Fur family  32.12 
 
 
128 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.442755  hitchhiker  0.000379655 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0842  ferric uptake regulator, Fur family  25.74 
 
 
152 aa  44.7  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3182  ferric uptake regulator family protein  26.52 
 
 
164 aa  44.3  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.346814  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  26.87 
 
 
144 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  24.48 
 
 
150 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>