More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0747 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0747  ferric-uptake regulator  100 
 
 		 152 aa  315  2e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3018  ferric uptake regulator, Fur family  42.86 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0481144  normal  0.294593 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1930  ferric uptake regulator, Fur family  33.08 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1467  transcriptional regulator, Fur family  32.84 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1183  ferric uptake regulator, Fur family  32.84 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.837957 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0132  ferric-uptake regulator  30.37 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3496  ferric uptake regulator, Fur family  29.45 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2512  ferric uptake regulator family protein  37.1 
 
 		 201 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.450617  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1233  ferric uptake regulator family protein  37 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0025  ferric uptake regulator family protein  31.58 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344249  normal  0.157034 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3379  ferric uptake regulator, Fur family  31.78 
 
 		 175 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3702  ferric uptake regulator, Fur family  31.54 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0128  ferric uptake regulator family protein  30.82 
 
 		 169 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1335 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2211  ferric uptake regulator family protein  29.25 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.395667  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0048  putative transcription regulator protein  30.87 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  27.86 
 
 		 152 aa  60.1  0.000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1453  ferric uptake regulator, Fur family  34.04 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.023883  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1481  ferric uptake regulator family protein  31.43 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.268678  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2685  ferric uptake regulator family protein  27.46 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0992523 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1469  ferric uptake regulator, Fur family  35.61 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0185274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  26.62 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0734  ferric uptake regulator family protein  28.08 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000194517  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0940  ferric uptake regulator, Fur family  30.77 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1966  ferric uptake regulator family protein  27.4 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1728  ferric uptake regulator family protein  29.2 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.597021 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0621  putative ferric uptake regulator, Fur family  28.47 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.776664  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  29.92 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  29.92 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4566  Fur family transcriptional regulator protein  27.74 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  31.69 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1604  putative transcription regulator protein  27.48 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000436344  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1211  ferric uptake regulation protein  29.17 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0179394  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  30.43 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3125  ferric uptake regulator  32.09 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1206  ferric uptake regulator  32.09 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000560641  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  30.88 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  30.88 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  30.88 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  30.88 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  30.88 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  30.88 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  30.88 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  30.88 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  30.88 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2058  ferric uptake regulator, Fur family  32.99 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0164  putative transcription regulator protein  29.41 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  30.88 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  30.88 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  30.88 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  24.84 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  30.88 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  30.88 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0116  ferric uptake regulator, Fur family  36.54 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.241411 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  30.5 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1354  ferric uptake regulator, Fur family  30.23 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000236384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  30.88 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0931  ferric uptake regulator family protein  30.94 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  30.5 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5746  ferric uptake regulator, DNA-binding transcriptional dual regulator of siderophore biosynthesis and transport  29.2 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0294  ferric uptake regulator, Fur family  33.57 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.774382  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1732  zinc uptake regulation protein  28.46 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0833  ferric uptake regulator  34.62 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4742  ferric uptake regulator, Fur family  27.94 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0468  ferric-uptake regulator  31.69 
 
 		 173 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11678  putative transcription regulator  28.67 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0939  ferric uptake regulator family protein  35.11 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1117  ferric uptake regulator, Fur family  36 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1575  ferric uptake regulator  35.24 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  29.41 
 
 		 148 aa  51.6  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  29.41 
 
 		 148 aa  51.6  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  36 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000206726  normal  0.895859 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2736  helix-turn-helix, AraC type  33.33 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000081899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  29.41 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4458  ferric uptake regulator family protein  27.27 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.342841  hitchhiker  0.00667855 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0282  ferric uptake regulation protein  33.33 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2810  ferric uptake regulator  36 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.644684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0458  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000485327 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0544  ferric uptake regulator family protein  35.51 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0596927  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  35.29 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0570  ferric uptake regulator family protein  35.51 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.233033 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01084  ferric uptake regulator  36.08 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00618384  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  33.33 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000966153  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3735  ferric uptake regulator family protein  35.51 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.345676 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  25.36 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  27.54 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3944  ferric uptake regulator, Fur family  28.68 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0223  transcriptional regulator  31.78 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43000  Ferric-uptake regulator, fur  34.19 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4057  ferric uptake regulator, Fur family  28.68 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0247  ferric uptake transcriptional (FUR)-like transcription regulator protein  28.68 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.406535  normal  0.140515 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1411  ferric uptake regulator family protein  27.12 
 
 		 150 aa  50.4  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1991  ferric uptake regulator family protein  29.29 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  29.93 
 
 		 144 aa  50.8  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2939  ferric uptake regulator, Fur family  35 
 
 		 148 aa  50.8  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0253838  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0603  ferric uptake regulator family protein  28.99 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.401566  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0438  ferric uptake regulation protein  38.14 
 
 		 136 aa  50.4  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0414  ferric uptake regulation protein  38.14 
 
 		 136 aa  50.4  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0616  ferric uptake regulator family protein  34.58 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.740565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0649  ferric uptake regulator family protein  34.58 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>