77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1732 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1732  zinc uptake regulation protein  100 
 
 
116 aa  236  5e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0515  zinc uptake regulation protein  56.03 
 
 
117 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1795  SsrA-binding protein  57.26 
 
 
124 aa  141  3e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.248367  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0092  metallo-beta-lactamase family protein  55.93 
 
 
119 aa  136  1e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.019878  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0132  ferric-uptake regulator  30.36 
 
 
123 aa  64.7  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2189  ferric uptake regulator, Fur family  32.81 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000532241  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2515  ferric uptake regulator family protein  27.5 
 
 
218 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.432858 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0747  ferric-uptake regulator  28.46 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2647  ferric uptake regulator family protein  27.5 
 
 
153 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1713  FUR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0366911  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3496  ferric uptake regulator, Fur family  25.19 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5930  ferric uptake regulator family protein  26.79 
 
 
153 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2623  ferric uptake regulator family protein  26.79 
 
 
153 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.195295  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1604  putative transcription regulator protein  27.07 
 
 
144 aa  51.6  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000436344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2599  ferric uptake regulator family protein  26.79 
 
 
153 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1989  ferric uptake regulator family protein  26.79 
 
 
153 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0075  FUR family transcriptional regulator  25 
 
 
154 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0329  transcriptional regulator, putative  25 
 
 
174 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0816853  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0627  FUR family transcriptional regulator  25 
 
 
154 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1930  ferric uptake regulator, Fur family  25.93 
 
 
144 aa  50.4  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0871  FUR family transcriptional regulator  25 
 
 
154 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2461  FUR family transcriptional regulator  27.1 
 
 
251 aa  50.1  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1030  transcriptional regulator np20  27.1 
 
 
266 aa  50.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468809  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0698  ferric uptake regulator family protein  26.42 
 
 
186 aa  50.4  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.470229 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1445  FUR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0423256  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0766  ferric uptake regulator family protein  28.3 
 
 
160 aa  48.9  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.885762  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1296  FUR family transcriptional regulator  25 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2029  FUR family transcriptional regulator  23.44 
 
 
169 aa  47  0.00008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.653891  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1951  ferric uptake regulator family protein  23.44 
 
 
169 aa  47  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0867  FUR family transcriptional regulator  24.26 
 
 
154 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04819  transcriptional regulator, Fur family  24 
 
 
168 aa  47  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5708  ferric uptake regulator, Fur family  26.77 
 
 
143 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1210  ferric uptake regulator, Fur family  28.72 
 
 
163 aa  46.2  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.427545  decreased coverage  0.00910774 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0488  zinc uptake regulation protein  29.91 
 
 
147 aa  46.2  0.0001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.695603  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0263  FUR family transcriptional regulator  26.26 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1672  FUR family transcriptional regulator  26.53 
 
 
136 aa  46.2  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0718  ferric uptake regulator  24.03 
 
 
159 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00407056  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7635  ferric uptake regulator family protein  25 
 
 
163 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1140  ferric uptake regulator family protein  27.55 
 
 
152 aa  45.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0292  ferric uptake regulator family protein  25.93 
 
 
174 aa  44.7  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0252498  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0546  ferric uptake regulator family protein  32.95 
 
 
139 aa  44.3  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1462  transcriptional regulator  26.77 
 
 
158 aa  44.3  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.177861  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1474  ferric uptake regulator family protein  25 
 
 
168 aa  44.3  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0208  ferric uptake regulator family protein  28.57 
 
 
144 aa  43.9  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0367  FUR family transcriptional regulator  26.26 
 
 
136 aa  43.5  0.0008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.596718  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0344  FUR family transcriptional regulator  26.26 
 
 
136 aa  43.9  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.470674  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1641  FUR family transcriptional regulator  26.26 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.600696  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2033  FUR family transcriptional regulator  23.91 
 
 
171 aa  43.5  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.728485  normal  0.0108698 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0045  ferric uptake regulator family protein  25.4 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  24.03 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4496  ferric uptake regulator family protein  27.36 
 
 
161 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3775  ferric uptake regulator family protein  23.7 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3007  ferric uptake regulator, Fur family  24.62 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4139  ferric uptake regulator family protein  21.17 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0983423 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2336  ferric uptake regulator family protein  23.57 
 
 
173 aa  43.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0048  putative transcription regulator protein  22.58 
 
 
172 aa  42  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0524  ferric uptake regulator family protein  24.59 
 
 
162 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.912553  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0518  ferric uptake regulator, Fur family  23.77 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0319  zinc uptake regulator ZUR  26.14 
 
 
162 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72560  transcriptional regulator np20  23.2 
 
 
167 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640017  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0025  ferric uptake regulator family protein  25.71 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344249  normal  0.157034 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1277  ferric uptake regulator family protein  25.62 
 
 
136 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000971648  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1195  ferric uptake regulator family protein  24 
 
 
162 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal  0.113542 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1216  ferric uptake regulator, Fur family  22.73 
 
 
149 aa  41.6  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2360  ferric uptake regulator family protein  26.6 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.930624  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1409  ferric uptake regulator family protein  23.97 
 
 
136 aa  41.2  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000310643  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2211  ferric uptake regulator family protein  23.08 
 
 
150 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.395667  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0489  ferric uptake regulator family protein  26.83 
 
 
167 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.574052  normal  0.122535 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5267  zinc uptake regulation protein, putative  21.13 
 
 
160 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1467  transcriptional regulator, Fur family  23.31 
 
 
158 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1728  ferric uptake regulator family protein  22.79 
 
 
164 aa  40.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.597021 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1183  ferric uptake regulator, Fur family  23.31 
 
 
158 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.837957 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4071  ferric uptake regulator, Fur family  26.77 
 
 
138 aa  40.8  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000323892  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0059  zinc uptake regulation protein, putative  25.6 
 
 
162 aa  40.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0488  ferric uptake regulator family protein  19.49 
 
 
163 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00616714  hitchhiker  0.00143129 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3804  FUR family transcriptional regulator  23.89 
 
 
118 aa  40  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.179482  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3248  transcriptional regulator, TrmB  25.24 
 
 
164 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0836778  normal  0.597442 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>