52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1795 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1795  SsrA-binding protein  100 
 
 
124 aa  253  5e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.248367  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0092  metallo-beta-lactamase family protein  71.19 
 
 
119 aa  180  5.0000000000000004e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.019878  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0515  zinc uptake regulation protein  54.7 
 
 
117 aa  142  2e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1732  zinc uptake regulation protein  57.26 
 
 
116 aa  141  3e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0132  ferric-uptake regulator  37.27 
 
 
123 aa  86.3  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1930  ferric uptake regulator, Fur family  30.6 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2189  ferric uptake regulator, Fur family  31.01 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000532241  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3496  ferric uptake regulator, Fur family  22.56 
 
 
152 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0208  ferric uptake regulator family protein  29.69 
 
 
144 aa  50.4  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1713  FUR family transcriptional regulator  26.15 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0366911  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0020  FUR family transcriptional regulator  24.03 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147149  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1445  FUR family transcriptional regulator  26.15 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0423256  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_19  transcriptional regulator, Fur family  24.03 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.677591  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0546  ferric uptake regulator family protein  30.08 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1604  putative transcription regulator protein  25.56 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000436344  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4555  ferric uptake regulator family protein  30.69 
 
 
145 aa  47  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3007  ferric uptake regulator, Fur family  22.31 
 
 
143 aa  47  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3272  ferric uptake regulator, Fur family  28.97 
 
 
138 aa  46.2  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.710175  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0825  ferric uptake regulator family protein  25.42 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4071  ferric uptake regulator, Fur family  30.3 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000323892  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5267  zinc uptake regulation protein, putative  23.94 
 
 
160 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1233  ferric uptake regulator family protein  26.52 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0802  ferric uptake regulator family protein  25.42 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3018  ferric uptake regulator, Fur family  23.31 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0481144  normal  0.294593 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3924  ferric uptake regulator family protein  28.97 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6009  ferric uptake regulator family protein  28.46 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.964976 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0045  ferric uptake regulator, Fur family  32.61 
 
 
137 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.4921e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  25 
 
 
142 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0276  zinc uptake regulation protein, putative  24.62 
 
 
160 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11678  putative transcription regulator  24.81 
 
 
137 aa  43.9  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1373  ferric uptake regulator, Fur family  29.67 
 
 
135 aa  43.9  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000536701  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1728  ferric uptake regulator family protein  24.26 
 
 
164 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.597021 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3859  zinc uptake transcriptional repressor  21.32 
 
 
170 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0045  ferric uptake regulator family protein  29.17 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1301  zinc uptake transcriptional repressor  21.32 
 
 
172 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0432  ferric uptake regulator family protein  30.61 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.089656  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1982  ferric uptake regulator family protein  27.1 
 
 
165 aa  42.7  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3769  zinc uptake transcriptional repressor  21.32 
 
 
170 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.352583  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  30.08 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2685  ferric uptake regulator family protein  22.31 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0992523 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4496  ferric uptake regulator family protein  22.54 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1472  ferric uptake regulator, Fur family  24.37 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000290418  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0931  ferric uptake regulator family protein  26.83 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  28.69 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1183  ferric uptake regulator, Fur family  23.88 
 
 
158 aa  41.6  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.837957 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1467  transcriptional regulator, Fur family  23.88 
 
 
158 aa  41.6  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1411  ferric uptake regulator family protein  32.18 
 
 
150 aa  41.6  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3397  zinc uptake transcriptional repressor  22 
 
 
169 aa  41.2  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3775  ferric uptake regulator family protein  24.83 
 
 
163 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4457  zinc uptake transcriptional repressor  21.21 
 
 
170 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0515  ferric uptake regulator, Fur family  31.58 
 
 
142 aa  40.4  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1637  ferric uptake regulator family protein  25.93 
 
 
145 aa  40  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000434333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>