136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2685 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2685  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 146 aa  303  4.0000000000000004e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0992523 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11678  putative transcription regulator  53.28 
 
 		 137 aa  166  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4566  Fur family transcriptional regulator protein  43.7 
 
 		 136 aa  117  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5541  ferric uptake regulator, Fur family  46.15 
 
 		 138 aa  113  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.713771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0533  ferric uptake regulator, Fur family  37.59 
 
 		 141 aa  93.6  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1233  ferric uptake regulator family protein  34.97 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1183  ferric uptake regulator, Fur family  27.86 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.837957 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1467  transcriptional regulator, Fur family  27.86 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3379  ferric uptake regulator, Fur family  32.59 
 
 		 175 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3702  ferric uptake regulator, Fur family  32.59 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1930  ferric uptake regulator, Fur family  25.38 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3496  ferric uptake regulator, Fur family  28.99 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0931  ferric uptake regulator family protein  30.4 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0164  putative transcription regulator protein  29.29 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0048  putative transcription regulator protein  32.65 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2512  ferric uptake regulator family protein  28.57 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.450617  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0128  ferric uptake regulator family protein  29.85 
 
 		 169 aa  63.5  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1335 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1728  ferric uptake regulator family protein  34.31 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.597021 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3018  ferric uptake regulator, Fur family  27.34 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0481144  normal  0.294593 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0747  ferric-uptake regulator  27.46 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0466  ferric uptake regulator family protein  27.78 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000190383  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1713  FUR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0366911  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0025  ferric uptake regulator family protein  31.78 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344249  normal  0.157034 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0208  ferric uptake regulator family protein  24.11 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  27.21 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  31.47 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  30.83 
 
 		 153 aa  53.5  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1604  putative transcription regulator protein  24.09 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000436344  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1445  FUR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0423256  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21260  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  29.71 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.570442  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  34.04 
 
 		 167 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  34.04 
 
 		 167 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  34.04 
 
 		 167 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1144  ferric uptake regulator family protein  33.03 
 
 		 137 aa  50.1  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0132  ferric-uptake regulator  26.98 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  24.63 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1272  ferric uptake regulator family protein  27.89 
 
 		 158 aa  48.9  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  30.53 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  27.08 
 
 		 142 aa  48.1  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2798  Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins  25.17 
 
 		 146 aa  47.8  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.1309500000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  28.08 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1277  ferric uptake regulator family protein  29.5 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000971648  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1411  ferric uptake regulator family protein  23.94 
 
 		 150 aa  47.8  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  30.15 
 
 		 143 aa  47.8  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0577  ferric-uptake regulator  27.4 
 
 		 156 aa  47.4  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1469  ferric uptake regulator, Fur family  28.26 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0185274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1102  ferric uptake regulator, Fur family  27.52 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.387055  normal  0.912899 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2141  ferric uptake regulator family protein  33.7 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1905  ferric uptake regulator family protein  29.79 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0734  ferric uptake regulator family protein  23.23 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000194517  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3397  zinc uptake transcriptional repressor  28.08 
 
 		 169 aa  46.2  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2198  ferric uptake regulator, Fur family  25.69 
 
 		 169 aa  46.2  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  26.06 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2211  ferric uptake regulator family protein  25.38 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.395667  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0061  FUR family nickel uptake regulator  26.39 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2058  ferric uptake regulator, Fur family  27.01 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  28.68 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0515  zinc uptake regulation protein  25.58 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  27.54 
 
 		 154 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  24.83 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4071  ferric uptake regulator, Fur family  27.27 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000323892  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1138  ferric uptake regulator, Fur family  26.06 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716078  normal  0.825565 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3054  ferric uptake regulator, Fur family  27.41 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0515  ferric uptake regulator, Fur family  24.82 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1648  ferric uptake regulator family protein  25.87 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.499744 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  23.13 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1409  ferric uptake regulator family protein  27.34 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000310643  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3662  ferric uptake regulator, Fur family  28.77 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0584  ferric uptake regulator family protein  25.69 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.274905  normal  0.220198 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  28.68 
 
 		 143 aa  44.7  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07451  ferric uptake regulator family protein  25.53 
 
 		 148 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0979772 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4458  ferric uptake regulator family protein  31.18 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.342841  hitchhiker  0.00667855 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  26.09 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1799  FUR family manganese uptake regulator  32.98 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1991  ferric uptake regulator family protein  36.76 
 
 		 151 aa  43.9  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2524  ferric uptake regulator, Fur family  24.82 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.568134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1597  ferric uptake regulator, Fur family  26.28 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0468  ferric-uptake regulator  26.95 
 
 		 173 aa  43.5  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4742  ferric uptake regulator, Fur family  26.47 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13391  hypothetical protein  23.91 
 
 		 186 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  31.52 
 
 		 176 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  24.81 
 
 		 152 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0637  ferric uptake regulator family protein  25.93 
 
 		 150 aa  42.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.835222  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0945  ferric uptake regulator, Fur family  25.71 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2513  ferric uptake regulator, Fur family  29.35 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275348  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1195  ferric uptake regulator family protein  22.22 
 
 		 136 aa  42.7  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.4932  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3769  ferric uptake regulator, Fur family  27.59 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0184  ferric uptake regulator, Fur family  21.8 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.567959  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0630  FUR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06931  ferric uptake regulator family protein  26.12 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.247961  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06641  ferric uptake regulator family protein  26.12 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2859  ferric-uptake regulator  23.94 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.141734 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1300  ferric uptake regulator family protein  24.65 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0883  ferric uptake regulator, Fur family  25.17 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.061821  hitchhiker  0.00451054 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3769  zinc uptake transcriptional repressor  26.67 
 
 		 170 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.352583  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0092  metallo-beta-lactamase family protein  26.12 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.019878  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0516  zinc uptake transcriptional repressor  26.71 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0255  ferric uptake regulator family protein  26.98 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.127404 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3859  zinc uptake transcriptional repressor  26.67 
 
 		 170 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  28.78 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>