66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11678 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_11678  putative transcription regulator  100 
 
 		 137 aa  283  5e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2685  ferric uptake regulator family protein  53.28 
 
 		 146 aa  166  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0992523 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4566  Fur family transcriptional regulator protein  43.07 
 
 		 136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5541  ferric uptake regulator, Fur family  38.69 
 
 		 138 aa  92.8  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.713771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0533  ferric uptake regulator, Fur family  36.09 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1930  ferric uptake regulator, Fur family  28.03 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1183  ferric uptake regulator, Fur family  25.9 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.837957 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1467  transcriptional regulator, Fur family  25.9 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0931  ferric uptake regulator family protein  29.27 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2512  ferric uptake regulator family protein  30.16 
 
 		 201 aa  60.1  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.450617  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0048  putative transcription regulator protein  30 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3379  ferric uptake regulator, Fur family  28.68 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3702  ferric uptake regulator, Fur family  28.68 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0164  putative transcription regulator protein  30.93 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0128  ferric uptake regulator family protein  29.52 
 
 		 169 aa  57.4  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1335 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1233  ferric uptake regulator family protein  28.17 
 
 		 147 aa  57  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3496  ferric uptake regulator, Fur family  26.77 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1604  putative transcription regulator protein  23.88 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000436344  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0747  ferric-uptake regulator  28.67 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0208  ferric uptake regulator family protein  24.46 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1728  ferric uptake regulator family protein  29.63 
 
 		 164 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.597021 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0734  ferric uptake regulator family protein  26.17 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000194517  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2198  ferric uptake regulator, Fur family  26.12 
 
 		 169 aa  51.2  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0584  ferric uptake regulator family protein  27.14 
 
 		 149 aa  50.4  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.274905  normal  0.220198 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3018  ferric uptake regulator, Fur family  24.31 
 
 		 145 aa  50.1  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0481144  normal  0.294593 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1713  FUR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0366911  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  25.52 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2809  FUR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.110848  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1195  ferric uptake regulator family protein  23.24 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.4932  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1445  FUR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0423256  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  23.65 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  24.49 
 
 		 152 aa  47  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0092  metallo-beta-lactamase family protein  26.12 
 
 		 119 aa  47  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.019878  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0466  ferric uptake regulator family protein  25.55 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000190383  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1411  ferric uptake regulator family protein  25 
 
 		 150 aa  45.4  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  25.35 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1453  ferric uptake regulator, Fur family  28.78 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.023883  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4742  ferric uptake regulator, Fur family  26.43 
 
 		 154 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0515  ferric uptake regulator, Fur family  28.08 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1795  SsrA-binding protein  24.81 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.248367  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0802  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  25.55 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00102348  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3951  ferric uptake regulator family protein  21.01 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.781008  normal  0.0311151 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  29.35 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4538  ferric uptake regulator family protein  27.07 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148082  normal  0.344615 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0945  ferric uptake regulator, Fur family  23.94 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  24.09 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1138  ferric uptake regulator, Fur family  26.9 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716078  normal  0.825565 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21260  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  27.55 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.570442  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0564  ferric uptake regulator  27.27 
 
 		 151 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0396  ferric uptake regulator, Fur family  26.6 
 
 		 175 aa  42  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0515  zinc uptake regulation protein  24.03 
 
 		 117 aa  41.2  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2294  ferric uptake regulator, Fur family  26.12 
 
 		 123 aa  41.2  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1300  ferric uptake regulator family protein  24.48 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2141  ferric uptake regulator family protein  27.96 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1102  ferric uptake regulator, Fur family  24.83 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.387055  normal  0.912899 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0621  putative ferric uptake regulator, Fur family  27.59 
 
 		 155 aa  40.8  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.776664  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1144  ferric uptake regulator family protein  29.79 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1648  ferric uptake regulator family protein  23.94 
 
 		 149 aa  40.4  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.499744 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  27.66 
 
 		 143 aa  40.4  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3662  ferric uptake regulator, Fur family  27.08 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2798  Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins  20.98 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.1309500000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4071  ferric uptake regulator, Fur family  25.53 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000323892  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4457  zinc uptake transcriptional repressor  23.45 
 
 		 170 aa  40.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1991  ferric uptake regulator family protein  28.57 
 
 		 151 aa  40  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0132  ferric-uptake regulator  27.96 
 
 		 123 aa  40  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1460  ferric uptake regulator, Fur family  28.42 
 
 		 161 aa  40  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>