216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0533 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0533  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 
141 aa  291  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4566  Fur family transcriptional regulator protein  43.28 
 
 
136 aa  123  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5541  ferric uptake regulator, Fur family  48.06 
 
 
138 aa  121  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.713771 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2685  ferric uptake regulator family protein  37.59 
 
 
146 aa  111  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0992523 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11678  putative transcription regulator  36.09 
 
 
137 aa  87.8  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2512  ferric uptake regulator family protein  34.81 
 
 
201 aa  85.5  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.450617  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0931  ferric uptake regulator family protein  34.17 
 
 
130 aa  85.9  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3702  ferric uptake regulator, Fur family  33.58 
 
 
175 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3379  ferric uptake regulator, Fur family  32.84 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0164  putative transcription regulator protein  33.33 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0025  ferric uptake regulator family protein  35.51 
 
 
149 aa  80.1  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344249  normal  0.157034 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0048  putative transcription regulator protein  31.03 
 
 
172 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0128  ferric uptake regulator family protein  29.86 
 
 
169 aa  77.4  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.1335 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3018  ferric uptake regulator, Fur family  30.41 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0481144  normal  0.294593 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3496  ferric uptake regulator, Fur family  31.39 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1930  ferric uptake regulator, Fur family  30.6 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1467  transcriptional regulator, Fur family  29.41 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1183  ferric uptake regulator, Fur family  29.41 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.837957 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1233  ferric uptake regulator family protein  31.45 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1604  putative transcription regulator protein  28.89 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000436344  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0184  ferric uptake regulator, Fur family  33.08 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.567959  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0208  ferric uptake regulator family protein  25.36 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1120  FUR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
139 aa  62  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.224553  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0466  ferric uptake regulator family protein  32.62 
 
 
137 aa  61.6  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000190383  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2211  ferric uptake regulator family protein  31.03 
 
 
150 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.395667  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1612  ferric uptake regulator family protein  31.72 
 
 
136 aa  61.6  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.339502  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1646  ferric-uptake regulator  31.72 
 
 
136 aa  61.6  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  27.14 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21120  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  27.86 
 
 
139 aa  58.9  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0391  FUR family transcriptional regulator  28.77 
 
 
159 aa  58.2  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0747  ferric-uptake regulator  27.74 
 
 
152 aa  58.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0621  putative ferric uptake regulator, Fur family  30.22 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.776664  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  25.71 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0529  ferric uptake regulator, Fur family  30.77 
 
 
143 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000605392  normal  0.102669 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  29.5 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0734  ferric uptake regulator family protein  24.66 
 
 
155 aa  53.5  0.0000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000194517  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  26.32 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2987  FUR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
139 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1728  ferric uptake regulator family protein  32.98 
 
 
164 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.597021 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  29.37 
 
 
154 aa  51.2  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07451  ferric uptake regulator family protein  31.11 
 
 
148 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0979772 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1143  ferric uptake regulator, Fur family  27.78 
 
 
150 aa  50.8  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000124537  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  27.97 
 
 
159 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2725  ferric uptake regulator, Fur family  25.66 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122956  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3523  zinc uptake transcriptional repressor  27.15 
 
 
169 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1991  ferric uptake regulator family protein  27.21 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13391  hypothetical protein  32.35 
 
 
186 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  27.34 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  27.34 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3640  hypothetical protein  27.27 
 
 
155 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2727  ferric uptake regulator family protein  23.7 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284846  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1144  ferric uptake regulator family protein  26.77 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0132  ferric-uptake regulator  20.97 
 
 
123 aa  49.3  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0145  fur family transcriptional regulator  27.86 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51439  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3397  zinc uptake transcriptional repressor  26.14 
 
 
169 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1966  ferric uptake regulator family protein  28 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00359557  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0515  zinc uptake regulation protein  25.38 
 
 
117 aa  48.1  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  27.34 
 
 
150 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1453  ferric uptake regulator, Fur family  28.15 
 
 
151 aa  47.8  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.023883  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0468  ferric-uptake regulator  25.17 
 
 
173 aa  47.8  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0116  ferric uptake regulator, Fur family  28.06 
 
 
142 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.241411 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07031  ferric uptake regulator family protein  35.79 
 
 
150 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0821588  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24980  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  27.97 
 
 
153 aa  47  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  25.17 
 
 
144 aa  47  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0684  ferric uptake regulator family protein  25.87 
 
 
142 aa  47.4  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564127  normal  0.74996 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1905  ferric uptake regulator family protein  26.43 
 
 
140 aa  47  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  25.66 
 
 
143 aa  47  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  26.24 
 
 
142 aa  47  0.00009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0352  ferric uptake regulator, Fur family  40 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  28.29 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  25.69 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  30.28 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2705  ferric uptake regulator, Fur family  26.28 
 
 
139 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.344666 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0237  Fur family ferric uptake regulator  27.14 
 
 
161 aa  47  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  28.28 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20420  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  26.09 
 
 
140 aa  46.2  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.375668  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1995  ferric uptake regulator, Fur family  28.1 
 
 
146 aa  45.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.134138  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  28.17 
 
 
144 aa  45.4  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  26.24 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1211  ferric uptake regulation protein  27.13 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0179394  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0105  ferric uptake regulator family protein  25 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.013681  normal  0.263297 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3272  ferric uptake regulator, Fur family  29.5 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.710175  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3924  ferric uptake regulator family protein  29.5 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  25 
 
 
143 aa  45.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  26.97 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4803  ferric uptake regulator, Fur family  25.87 
 
 
154 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1806  ferric uptake regulator family protein  27.41 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.696064  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0734  zinc uptake transcriptional repressor  24 
 
 
171 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.660786  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0615  ferric uptake regulator, Fur family  29.17 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.12884  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4185  ferric uptake regulator, Fur family  27.72 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.421488  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  26.57 
 
 
143 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1411  ferric uptake regulator family protein  25.55 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1272  ferric uptake regulator family protein  26.95 
 
 
158 aa  45.1  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0292  ferric uptake regulator family protein  26.43 
 
 
174 aa  44.7  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0252498  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2745  ferric uptake regulator, Fur family  30.61 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_19  transcriptional regulator, Fur family  26.24 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.677591  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0519  ferric uptake regulator family protein  34.07 
 
 
135 aa  44.7  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.639512  normal  0.494415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0518  ferric ion uptake regulator  25.35 
 
 
139 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2668  ferric uptake regulator family protein  28.1 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  26 
 
 
147 aa  45.1  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>