More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1453 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1453  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 
151 aa  303  7e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.023883  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2189  ferric uptake regulator, Fur family  25.9 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000532241  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1469  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 
130 aa  73.6  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0185274  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1138  ferric uptake regulator, Fur family  31.5 
 
 
143 aa  72  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716078  normal  0.825565 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  30.61 
 
 
159 aa  72  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  29.17 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  28.68 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3007  ferric uptake regulator family protein  26.98 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.830794  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4458  ferric uptake regulator family protein  38.02 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.342841  hitchhiker  0.00667855 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1646  ferric-uptake regulator  27.56 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1612  ferric uptake regulator family protein  27.56 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.339502  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0839  transcriptional regulator, Fur family  26.19 
 
 
128 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.442755  hitchhiker  0.000379655 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4397  transcriptional regulator, Fur family  26.19 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.108592  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  30.88 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4132  ferric uptake regulator family protein  26.19 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4359  FUR family transcriptional regulator  26.19 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.291339  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4181  FUR family transcriptional regulator  26.19 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4019  FUR family transcriptional regulator  26.19 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.642016  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4029  FUR family transcriptional regulator  26.19 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742096  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4503  FUR family transcriptional regulator  26.19 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.606254  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4413  transcriptional regulator, Fur family  26.19 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000236646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4301  transcriptional regulator, Fur family  26.19 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.08025e-17 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  28.47 
 
 
147 aa  67  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0365  ferric uptake regulator, Fur family  30.66 
 
 
150 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0630  FUR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1120  FUR family transcriptional regulator  24.41 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.224553  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0603  ferric uptake regulator family protein  31.62 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  33.09 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  30.6 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1165  ferric uptake regulator family protein  28.67 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0381194  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  29.86 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0940  ferric uptake regulator, Fur family  27.86 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  29.85 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1233  ferric uptake regulator family protein  40.82 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  27.13 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  32.09 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  32.37 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1958  ferric uptake regulator family protein  28.21 
 
 
170 aa  64.3  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0491085  hitchhiker  0.00899541 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  32.37 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0842  ferric uptake regulator, Fur family  25.9 
 
 
152 aa  63.5  0.0000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2401  ferric uptake regulator, Fur family  24.6 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  29.1 
 
 
154 aa  63.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  28.57 
 
 
145 aa  63.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2612  ferric uptake regulator, Fur family  29.63 
 
 
146 aa  63.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1789  ferric uptake regulator, Fur family  27.03 
 
 
151 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.372499  normal  0.929582 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0519  ferric uptake regulator family protein  34.92 
 
 
135 aa  63.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.639512  normal  0.494415 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0564  ferric uptake regulator  28.77 
 
 
151 aa  63.5  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  29.17 
 
 
155 aa  62.8  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  30.6 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  30.6 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0577  ferric-uptake regulator  27.94 
 
 
156 aa  62  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  29.37 
 
 
157 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0987  ferric uptake regulator family protein  30.88 
 
 
147 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00388915 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1467  transcriptional regulator, Fur family  32.43 
 
 
158 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2259  ferric uptake regulator, Fur family  32.03 
 
 
154 aa  62  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  31.88 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1183  ferric uptake regulator, Fur family  32.43 
 
 
158 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.837957 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  29.37 
 
 
157 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1216  ferric uptake regulator, Fur family  31.58 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
149 aa  62  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  29.37 
 
 
157 aa  62  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0170  ferric uptake regulator, Fur family  23.02 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  28.24 
 
 
148 aa  61.6  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  28.24 
 
 
148 aa  61.6  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  27.21 
 
 
143 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  26.24 
 
 
154 aa  61.2  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  31.16 
 
 
144 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08960  ferric uptake regulator, Fur family  25 
 
 
134 aa  61.2  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2809  FUR family transcriptional regulator  32.19 
 
 
152 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.110848  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1272  ferric uptake regulator family protein  27.21 
 
 
158 aa  60.1  0.000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  27.48 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  27.74 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1995  ferric uptake regulator, Fur family  28.26 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.134138  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3019  ferric uptake regulator family protein  32.35 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000804743  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1140  ferric uptake regulator family protein  37.01 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3404  ferric uptake regulator family protein  27.13 
 
 
174 aa  60.1  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.092554  normal  0.327657 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0747  ferric-uptake regulator  34.04 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2668  ferric uptake regulator family protein  28.57 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  27.21 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0045  ferric uptake regulator family protein  29.63 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3389  ferric uptake regulator family protein  33.86 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.261962  normal  0.0261677 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4185  ferric uptake regulator, Fur family  28.46 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.421488  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  26.28 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  33.08 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2987  FUR family transcriptional regulator  30.82 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2790  ferric uptake regulator family protein  31.75 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000512773  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0931  ferric uptake regulator family protein  30 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1645  ferric uptake regulation protein (ferric uptake regulator)  27.74 
 
 
155 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  30.08 
 
 
143 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0279  ferric uptake regulator family protein  22.14 
 
 
138 aa  57.8  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.666463  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0515  ferric uptake regulator, Fur family  25.56 
 
 
142 aa  57.4  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0159  ferric uptake regulator, Fur family  32.33 
 
 
176 aa  57  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  29.23 
 
 
147 aa  57  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
142 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4160  FUR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3832  FUR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3848  FUR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000844204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4313  FUR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2066  ferric uptake regulator family protein  30.3 
 
 
141 aa  57  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.779744  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4115  transcriptional regulator, Fur family  30.95 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5116299999999997e-20 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>