More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1120 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1120  FUR family transcriptional regulator  100 
 
 
139 aa  288  2e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.224553  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1646  ferric-uptake regulator  85.19 
 
 
136 aa  248  3e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1612  ferric uptake regulator family protein  85.19 
 
 
136 aa  248  3e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.339502  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2401  ferric uptake regulator, Fur family  54.01 
 
 
141 aa  159  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0170  ferric uptake regulator, Fur family  51.08 
 
 
139 aa  157  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4132  ferric uptake regulator family protein  45.26 
 
 
137 aa  142  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4397  transcriptional regulator, Fur family  45.26 
 
 
137 aa  142  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.108592  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3007  ferric uptake regulator family protein  45.99 
 
 
137 aa  142  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.830794  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4359  FUR family transcriptional regulator  44.53 
 
 
137 aa  140  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.291339  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4181  FUR family transcriptional regulator  44.53 
 
 
137 aa  140  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4019  FUR family transcriptional regulator  44.53 
 
 
137 aa  140  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.642016  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4029  FUR family transcriptional regulator  44.53 
 
 
137 aa  140  8e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742096  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4503  FUR family transcriptional regulator  44.53 
 
 
137 aa  140  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.606254  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4413  transcriptional regulator, Fur family  44.53 
 
 
137 aa  140  8e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000236646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4301  transcriptional regulator, Fur family  44.53 
 
 
137 aa  140  8e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.08025e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0839  transcriptional regulator, Fur family  46.09 
 
 
128 aa  133  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.442755  hitchhiker  0.000379655 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2612  ferric uptake regulator, Fur family  40 
 
 
146 aa  127  6e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1637  ferric uptake regulator family protein  38.41 
 
 
145 aa  111  3e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000434333  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4185  ferric uptake regulator, Fur family  35.97 
 
 
139 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.421488  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  38.24 
 
 
146 aa  101  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  33.33 
 
 
148 aa  96.3  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 
148 aa  96.3  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0279  ferric uptake regulator family protein  33.81 
 
 
138 aa  93.2  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.666463  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
150 aa  90.1  8e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1216  ferric uptake regulator, Fur family  29.55 
 
 
149 aa  88.6  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  31.43 
 
 
150 aa  86.7  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0931  ferric uptake regulator family protein  28.37 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  31.3 
 
 
153 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  31.43 
 
 
150 aa  85.5  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  31.3 
 
 
143 aa  84.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  34.59 
 
 
145 aa  84.7  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  31.16 
 
 
143 aa  84.3  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  31.39 
 
 
142 aa  84  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  30.66 
 
 
142 aa  84  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  31.39 
 
 
144 aa  84  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  31.39 
 
 
144 aa  84  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  31.39 
 
 
144 aa  84  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  31.39 
 
 
142 aa  84  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  31.39 
 
 
144 aa  84  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1892  Fur family transcriptional regulator  33.33 
 
 
141 aa  84  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  32.06 
 
 
143 aa  84  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  30.66 
 
 
142 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  30.66 
 
 
142 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  30.66 
 
 
142 aa  83.6  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  30.53 
 
 
143 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  32.31 
 
 
143 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0802  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  30.6 
 
 
149 aa  80.9  0.000000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00102348  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  31.3 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  31.21 
 
 
166 aa  78.6  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  29.58 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0885  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  30.33 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0546  ferric uptake regulator family protein  29.32 
 
 
139 aa  77  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  32.06 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2058  ferric uptake regulator, Fur family  31.16 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0045  ferric uptake regulator family protein  30.53 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1373  ferric uptake regulator, Fur family  32.58 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000536701  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  25.76 
 
 
167 aa  74.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  30.23 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  25.76 
 
 
167 aa  74.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  31.43 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  28.36 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1645  ferric uptake regulation protein (ferric uptake regulator)  30.71 
 
 
155 aa  73.6  0.0000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  28.57 
 
 
146 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  25.76 
 
 
167 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2730  ferric uptake regulator family protein  32.28 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  29.93 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  31.34 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0515  ferric uptake regulator, Fur family  35.04 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  31.62 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0603  ferric uptake regulator family protein  29.01 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1272  ferric uptake regulator family protein  31.65 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0332  ferric uptake regulator, Fur family  35.46 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000307002  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1505  FUR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000456774  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2745  ferric uptake regulator, Fur family  28.36 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  32.84 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1279  transcriptional regulator, Fur family  28.47 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000471651  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0101  ferric uptake regulator, Fur family  28.03 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133113  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13391  hypothetical protein  29.2 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0543  ferric uptake regulator, Fur family  33.07 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.70942 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1295  ferric uptake regulator family protein  29.92 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000494544  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2859  ferric-uptake regulator  28.24 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.141734 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1189  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  29.69 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0630  FUR family transcriptional regulator  26.87 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1142  ferric uptake regulator family protein  31.62 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000076439  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1040  transcriptional regulator, Fur family  31.71 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0519  ferric uptake regulator family protein  28.35 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.639512  normal  0.494415 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  24.26 
 
 
176 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2717  ferric uptake regulator family protein  28.57 
 
 
134 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1165  ferric uptake regulator family protein  31.69 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0381194  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  31.11 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1140  ferric uptake regulator family protein  28.91 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0615  ferric uptake regulator, Fur family  34.78 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.12884  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0584  ferric uptake regulator family protein  32.33 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.274905  normal  0.220198 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  29.85 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  30.6 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  27.27 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1991  ferric uptake regulator family protein  27.46 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0153  ferric uptake regulator, Fur family  29.37 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000104646  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  24.62 
 
 
130 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  27.01 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>