110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4566 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4566  Fur family transcriptional regulator protein  100 
 
 		 136 aa  283  7e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5541  ferric uptake regulator, Fur family  59.12 
 
 		 138 aa  154  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.713771 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2685  ferric uptake regulator family protein  43.7 
 
 		 146 aa  117  7e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0992523 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0533  ferric uptake regulator, Fur family  43.28 
 
 		 141 aa  115  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11678  putative transcription regulator  43.07 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0931  ferric uptake regulator family protein  39.02 
 
 		 130 aa  92  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3702  ferric uptake regulator, Fur family  35 
 
 		 175 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3379  ferric uptake regulator, Fur family  35 
 
 		 175 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0164  putative transcription regulator protein  31.25 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3496  ferric uptake regulator, Fur family  31.65 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0048  putative transcription regulator protein  35.77 
 
 		 172 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1183  ferric uptake regulator, Fur family  31.62 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.837957 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1467  transcriptional regulator, Fur family  31.62 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1604  putative transcription regulator protein  28.12 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000436344  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1930  ferric uptake regulator, Fur family  29.6 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1233  ferric uptake regulator family protein  32.81 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2512  ferric uptake regulator family protein  32.54 
 
 		 201 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.450617  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0128  ferric uptake regulator family protein  30.71 
 
 		 169 aa  67.4  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1335 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3018  ferric uptake regulator, Fur family  29.79 
 
 		 145 aa  67  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0481144  normal  0.294593 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0734  ferric uptake regulator family protein  30.2 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000194517  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0025  ferric uptake regulator family protein  29.41 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344249  normal  0.157034 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0208  ferric uptake regulator family protein  26.95 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0747  ferric-uptake regulator  27.74 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1411  ferric uptake regulator family protein  29.08 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1612  ferric uptake regulator family protein  29.1 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.339502  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1646  ferric-uptake regulator  29.1 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1120  FUR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.224553  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1144  ferric uptake regulator family protein  31.01 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07451  ferric uptake regulator family protein  31.58 
 
 		 148 aa  51.2  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0979772 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  34.27 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0519  ferric uptake regulator family protein  37.63 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.639512  normal  0.494415 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  28.97 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0184  ferric uptake regulator, Fur family  25.69 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.567959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  30.07 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3523  zinc uptake transcriptional repressor  31.58 
 
 		 169 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  31.06 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1648  ferric uptake regulator family protein  26.76 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.499744 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1188  ferric uptake regulator, Fur family  26.71 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3007  ferric uptake regulator, Fur family  28.97 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2211  ferric uptake regulator family protein  33.02 
 
 		 150 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.395667  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0842  ferric uptake regulator, Fur family  27.66 
 
 		 152 aa  47.4  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07031  ferric uptake regulator family protein  30.3 
 
 		 150 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0821588  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0515  zinc uptake regulation protein  24.24 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0077  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  30.83 
 
 		 154 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1728  ferric uptake regulator family protein  30.43 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.597021 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  31.06 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  31.06 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3397  zinc uptake transcriptional repressor  29.77 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0515  ferric uptake regulator, Fur family  24.46 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0488  zinc uptake regulation protein  28.17 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.695603  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3951  ferric uptake regulator family protein  31.52 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.781008  normal  0.0311151 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1453  ferric uptake regulator, Fur family  27.41 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.023883  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1934  zinc uptake regulator  27.94 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395595  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3775  ferric uptake regulator family protein  25.38 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1991  ferric uptake regulator family protein  28.87 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06931  ferric uptake regulator family protein  29.55 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.247961  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13391  hypothetical protein  30.37 
 
 		 186 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  27.03 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  31.06 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  27.48 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1230  FUR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0757057  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06641  ferric uptake regulator family protein  29.55 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2141  ferric uptake regulator family protein  25.95 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0637  ferric uptake regulator family protein  30.08 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.835222  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1195  ferric uptake regulator family protein  23.94 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.4932  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1420  FUR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0522352  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0564  ferric uptake regulator  30.99 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1165  ferric uptake regulator family protein  31.69 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0381194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  31.06 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1597  ferric uptake regulator, Fur family  28.06 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  25.5 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1272  ferric uptake regulator family protein  26.35 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  27.08 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0990  ferric uptake regulator family protein  24.22 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1472  ferric uptake regulator, Fur family  27.17 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000290418  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4584  zinc uptake transcriptional repressor  29.32 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.735671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4583  zinc uptake transcriptional repressor  29.32 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4433  zinc uptake transcriptional repressor  29.32 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000291933 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4498  zinc uptake transcriptional repressor  29.32 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4635  zinc uptake transcriptional repressor  29.32 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  30.88 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0516  zinc uptake transcriptional repressor  32.98 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0621  putative ferric uptake regulator, Fur family  26.15 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.776664  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3240  ferric uptake regulator family protein  26.67 
 
 		 148 aa  41.6  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000230922  hitchhiker  0.00191408 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4099  ferric uptake regulator family protein  31.11 
 
 		 143 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4458  ferric uptake regulator family protein  26.92 
 
 		 141 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.342841  hitchhiker  0.00667855 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2145  ferric-uptake regulator  25.83 
 
 		 164 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0488  ferric uptake regulator family protein  27.94 
 
 		 163 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00616714  hitchhiker  0.00143129 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0116  ferric uptake regulator, Fur family  31.58 
 
 		 142 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.241411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1789  ferric uptake regulator, Fur family  32.86 
 
 		 151 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.372499  normal  0.929582 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0734  zinc uptake transcriptional repressor  32.98 
 
 		 171 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.660786  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1469  ferric uptake regulator, Fur family  35.16 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0185274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2401  ferric uptake regulator, Fur family  29.41 
 
 		 141 aa  41.2  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  29.1 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0466  ferric uptake regulator family protein  25.56 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000190383  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2859  ferric-uptake regulator  28.47 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.141734 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3895  ferric uptake regulator family protein  26.39 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.845515 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3626  ferric uptake regulator, Fur family  27.82 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  27.97 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07001  ferric uptake regulator family protein  34 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0209563  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>