296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0164 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0164  putative transcription regulator protein  100 
 
 		 172 aa  348  3e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0128  ferric uptake regulator family protein  73.94 
 
 		 169 aa  236  9e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1335 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3379  ferric uptake regulator, Fur family  54.17 
 
 		 175 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3702  ferric uptake regulator, Fur family  58.39 
 
 		 175 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0048  putative transcription regulator protein  58.71 
 
 		 172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3496  ferric uptake regulator, Fur family  45.58 
 
 		 152 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1467  transcriptional regulator, Fur family  42.96 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1183  ferric uptake regulator, Fur family  42.96 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.837957 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2512  ferric uptake regulator family protein  39.44 
 
 		 201 aa  105  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.450617  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1233  ferric uptake regulator family protein  39.19 
 
 		 147 aa  103  8e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0025  ferric uptake regulator family protein  37.5 
 
 		 149 aa  84.7  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344249  normal  0.157034 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3018  ferric uptake regulator, Fur family  35.42 
 
 		 145 aa  83.6  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0481144  normal  0.294593 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3640  hypothetical protein  36.75 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0621  putative ferric uptake regulator, Fur family  33.77 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.776664  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4566  Fur family transcriptional regulator protein  31.25 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1728  ferric uptake regulator family protein  35.86 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.597021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0533  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 141 aa  73.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1604  putative transcription regulator protein  33.58 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000436344  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2211  ferric uptake regulator family protein  30.61 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.395667  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2685  ferric uptake regulator family protein  29.29 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0992523 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0931  ferric uptake regulator family protein  28.03 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0116  ferric uptake regulator, Fur family  36.5 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.241411 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1930  ferric uptake regulator, Fur family  26.72 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5541  ferric uptake regulator, Fur family  30 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.713771 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0734  ferric uptake regulator family protein  26.25 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000194517  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3240  ferric uptake regulator family protein  31.82 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000230922  hitchhiker  0.00191408 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  32.87 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3292  FUR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000231053  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07031  ferric uptake regulator family protein  31.43 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0821588  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0519  ferric uptake regulator family protein  34.93 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.639512  normal  0.494415 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11678  putative transcription regulator  30.93 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2623  ferric uptake regulation protein  29.79 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.376677  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0077  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  27.67 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4458  ferric uptake regulator family protein  31.25 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.342841  hitchhiker  0.00667855 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07451  ferric uptake regulator family protein  30.92 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0979772 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2813  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.162605  normal  0.605747 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1211  ferric uptake regulation protein  27.14 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0179394  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  28.08 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1469  ferric uptake regulator, Fur family  32.84 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0185274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0637  ferric uptake regulator family protein  30 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.835222  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06931  ferric uptake regulator family protein  30 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.247961  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06641  ferric uptake regulator family protein  30 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1194  ferric-uptake regulator  29.86 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0132  ferric-uptake regulator  27.62 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0314  ferric uptake regulator  29.73 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0967  ferric uptake regulator, Fur family  30.56 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.924679  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1389  ferric uptake regulation protein  26.95 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000498211  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  26.09 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0747  ferric-uptake regulator  29.41 
 
 		 152 aa  53.9  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1195  ferric uptake regulator family protein  26.21 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.4932  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1451  ferric uptake regulation protein  26.95 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000060196  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1966  ferric uptake regulator family protein  28.48 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00359557  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  27.97 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  25.74 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0045  ferric uptake regulator, Fur family  25.36 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.4921e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  27.4 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  29.03 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  29.03 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0546  ferric uptake regulator family protein  23.94 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2727  ferric uptake regulator family protein  30 
 
 		 135 aa  53.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284846  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  29.03 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  29.03 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1411  ferric uptake regulator family protein  23.08 
 
 		 150 aa  52.4  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  27.97 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  27.97 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  25.74 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  27.97 
 
 		 142 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3965  ferric uptake regulator, Fur family  30.28 
 
 		 138 aa  52.4  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  27.97 
 
 		 142 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1145  ferric uptake regulator family protein  31.25 
 
 		 168 aa  52.4  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1991  ferric uptake regulator family protein  32.68 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0778  ferric uptake regulator family protein  28.3 
 
 		 152 aa  52  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.714115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  27.97 
 
 		 142 aa  52  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3564  ferric uptake regulator family protein  32.17 
 
 		 137 aa  52  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.201475 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  27.97 
 
 		 142 aa  52  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  27.97 
 
 		 142 aa  52  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  28.19 
 
 		 148 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  28.19 
 
 		 148 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  28.19 
 
 		 148 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  28.19 
 
 		 150 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  28.19 
 
 		 148 aa  51.6  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  26.17 
 
 		 150 aa  51.6  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  28.19 
 
 		 148 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  28.19 
 
 		 148 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  28.19 
 
 		 148 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  28.19 
 
 		 148 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  28.19 
 
 		 148 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4538  ferric uptake regulator family protein  32.09 
 
 		 134 aa  51.6  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148082  normal  0.344615 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1293  ferric uptake regulator family protein  27.4 
 
 		 149 aa  51.2  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  24.83 
 
 		 152 aa  51.6  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1575  ferric uptake regulator  27.14 
 
 		 147 aa  50.8  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0438  ferric uptake regulation protein  28.37 
 
 		 136 aa  51.2  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0414  ferric uptake regulation protein  28.37 
 
 		 136 aa  51.2  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2338  ferric uptake regulator  22.7 
 
 		 169 aa  50.8  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807618  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4139  ferric uptake regulator family protein  32.21 
 
 		 164 aa  50.8  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0983423 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2294  ferric uptake regulator, Fur family  30 
 
 		 123 aa  50.8  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0536  ferric uptake regulator family protein  37.18 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>