More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_43000 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_43000  Ferric-uptake regulator, fur  100 
 
 
134 aa  272  9e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3627  ferric uptake regulator family protein  94.03 
 
 
139 aa  257  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63020  ferric uptake regulation protein  90.3 
 
 
134 aa  246  8e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5484  ferric uptake regulation protein  89.55 
 
 
134 aa  244  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4508  ferric uptake regulation protein  88.72 
 
 
135 aa  239  7.999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.358038  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4596  ferric uptake regulator family protein  88.81 
 
 
134 aa  238  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.209502 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4730  ferric uptake regulator, Fur family  88.81 
 
 
134 aa  238  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289101 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0760  ferric uptake regulator family protein  87.31 
 
 
134 aa  238  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.809862  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4731  ferric uptake regulator family protein  88.06 
 
 
134 aa  237  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741724  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4198  ferric-uptake regulator  87.22 
 
 
135 aa  236  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0702  ferric uptake regulator family protein  85.82 
 
 
134 aa  233  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.49525  hitchhiker  0.0000821406 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3097  ferric uptake regulator family protein  75.76 
 
 
150 aa  206  8e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2736  helix-turn-helix, AraC type  72.73 
 
 
135 aa  201  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000081899  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3967  ferric uptake regulator family protein  69.7 
 
 
136 aa  197  6e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.706026 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3365  ferric uptake regulator family protein  68.22 
 
 
139 aa  187  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.019724  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1905  ferric uptake regulator family protein  67.97 
 
 
140 aa  181  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01181  ferric uptake regulator Fur  62.41 
 
 
136 aa  174  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0678895  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1481  ferric uptake regulator family protein  64.23 
 
 
140 aa  172  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.268678  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1459  ferric uptake regulator family protein  60.9 
 
 
146 aa  171  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.773495  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1516  FUR family transcriptional regulator  60.9 
 
 
146 aa  171  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.995871  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1594  ferric uptake regulator, Fur family  62.41 
 
 
135 aa  171  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0438  ferric uptake regulation protein  62.02 
 
 
136 aa  170  5.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0414  ferric uptake regulation protein  62.02 
 
 
136 aa  170  5.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  62.7 
 
 
143 aa  170  6.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1451  ferric uptake regulation protein  63.28 
 
 
155 aa  169  2e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000060196  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1389  ferric uptake regulation protein  63.28 
 
 
145 aa  169  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000498211  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  59.23 
 
 
148 aa  167  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  59.23 
 
 
148 aa  167  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  59.23 
 
 
148 aa  167  6e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135806  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1194  ferric-uptake regulator  57.46 
 
 
159 aa  166  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  60 
 
 
148 aa  165  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  61.11 
 
 
144 aa  164  4e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  61.11 
 
 
144 aa  164  4e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3125  ferric uptake regulator  60 
 
 
149 aa  164  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1206  ferric uptake regulator  60 
 
 
149 aa  164  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000560641  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1117  ferric uptake regulator, Fur family  59.23 
 
 
148 aa  163  6.9999999999999995e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  59.23 
 
 
150 aa  163  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  59.23 
 
 
150 aa  163  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  59.23 
 
 
150 aa  163  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  59.23 
 
 
150 aa  163  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2939  ferric uptake regulator, Fur family  59.23 
 
 
148 aa  163  8e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0253838  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2050  ferric uptake regulator, Fur family  58.59 
 
 
141 aa  163  8e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  59.23 
 
 
150 aa  163  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  59.23 
 
 
148 aa  163  9e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  59.23 
 
 
148 aa  163  9e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  59.23 
 
 
148 aa  163  9e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  59.23 
 
 
148 aa  163  9e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  59.23 
 
 
148 aa  163  9e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  59.23 
 
 
148 aa  163  9e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  59.23 
 
 
148 aa  163  9e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  59.23 
 
 
148 aa  163  9e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  59.23 
 
 
148 aa  163  9e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  59.23 
 
 
148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000206726  normal  0.895859 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2152  ferric uptake regulator  58.14 
 
 
140 aa  160  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0282  ferric uptake regulation protein  57.03 
 
 
158 aa  160  8.000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0458  ferric uptake regulator, Fur family  57.03 
 
 
158 aa  160  8.000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000485327 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0987  ferric uptake regulator, Fur family  57.81 
 
 
139 aa  159  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.647798  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2623  ferric uptake regulation protein  60 
 
 
143 aa  159  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.376677  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0753  ferric uptake regulator family protein  55.38 
 
 
148 aa  158  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.629039  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  58.73 
 
 
161 aa  157  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0475  ferric uptake regulator family protein  56.15 
 
 
149 aa  157  5e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0967  ferric uptake regulator, Fur family  57.03 
 
 
142 aa  157  5e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.924679  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0873  ferric uptake regulator, Fur family protein  56.25 
 
 
142 aa  157  6e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6009  ferric uptake regulator family protein  55.2 
 
 
155 aa  156  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.964976 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  57.94 
 
 
143 aa  157  7e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1575  ferric uptake regulator  55.91 
 
 
147 aa  156  8e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0833  ferric uptake regulator  56.92 
 
 
147 aa  156  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004126  ferric uptake regulation protein FUR  56.92 
 
 
149 aa  155  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0934  ferric uptake regulator family protein  54.96 
 
 
147 aa  155  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.634788  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0474  ferric uptake regulator family protein  53.85 
 
 
143 aa  155  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  57.14 
 
 
143 aa  155  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000966153  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0894  ferric uptake regulator family protein  55.91 
 
 
152 aa  154  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.572753 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1842  ferric uptake regulator  57.94 
 
 
143 aa  154  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000122874  normal  0.0218944 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  56.35 
 
 
143 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  56.35 
 
 
143 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  56.35 
 
 
143 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  56.35 
 
 
143 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  56.35 
 
 
143 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  56.35 
 
 
143 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2810  ferric uptake regulator  57.94 
 
 
143 aa  153  6e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.644684  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  56.35 
 
 
143 aa  153  7e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01339  ferric uptake regulator  56.15 
 
 
149 aa  153  8e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  55.56 
 
 
143 aa  152  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4610  ferric uptake regulator family protein  53.85 
 
 
181 aa  152  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1690  ferric uptake regulator  55.38 
 
 
150 aa  152  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000286155  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2338  ferric uptake regulator  56.35 
 
 
169 aa  152  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807618  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  55.56 
 
 
143 aa  152  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1593  ferric uptake regulator  54.76 
 
 
143 aa  152  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000083166  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1211  ferric uptake regulation protein  59.2 
 
 
148 aa  152  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0179394  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2593  ferric uptake regulator family protein  55.04 
 
 
142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000283641 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0570  ferric uptake regulator family protein  53.49 
 
 
142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.233033 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4555  ferric uptake regulator family protein  51.16 
 
 
145 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0544  ferric uptake regulator family protein  53.49 
 
 
142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0596927  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0223  transcriptional regulator  56 
 
 
145 aa  150  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1727  ferric uptake regulator, Fur family  55.65 
 
 
146 aa  150  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0166  ferric uptake regulator family protein  53.49 
 
 
142 aa  150  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0616  ferric uptake regulator family protein  53.49 
 
 
142 aa  150  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.740565  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0649  ferric uptake regulator family protein  53.49 
 
 
142 aa  150  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2737  ferric uptake regulator family protein  53.49 
 
 
142 aa  150  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348547  normal  0.830954 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3420  ferric uptake regulator  53.49 
 
 
142 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>