More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1033 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1033  ferric uptake regulator family  100 
 
 
146 aa  301  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19031  ferric uptake regulator family protein  96.27 
 
 
134 aa  270  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.442263  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15241  ferric uptake regulator family protein  79.7 
 
 
133 aa  225  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11321  ferric uptake regulator family protein  67.38 
 
 
144 aa  199  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.948862  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11321  ferric uptake regulator family protein  65.97 
 
 
144 aa  197  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1041  ferric uptake regulator family protein  63.89 
 
 
144 aa  191  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.213524  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11241  ferric uptake regulator family protein  69.05 
 
 
135 aa  190  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.934792  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29341  ferric uptake regulator family  55.12 
 
 
134 aa  157  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2220  ferric uptake regulator family protein  56.69 
 
 
134 aa  154  3e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.508413  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2566  ferric uptake regulator family protein  55.3 
 
 
136 aa  154  3e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4383  ferric uptake regulator, Fur family  41.54 
 
 
132 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.134348 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3508  ferric uptake regulator  42.86 
 
 
134 aa  112  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0405  ferric uptake regulator family protein  42.02 
 
 
134 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4174  ferric uptake regulator, Fur family  41.09 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4134  ferric uptake regulator, Fur family  41.09 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2248  ferric uptake regulator, Fur family  40.65 
 
 
133 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0111232 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0817  ferric uptake regulator family protein  41.18 
 
 
130 aa  103  9e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1953  ferric uptake regulator family protein  37.9 
 
 
131 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1917  ferric uptake regulator, Fur family  40.8 
 
 
143 aa  98.2  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2745  ferric uptake regulator, Fur family  34.71 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2730  ferric uptake regulator family protein  38.52 
 
 
150 aa  79.3  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3447  zinc uptake regulator  34.62 
 
 
131 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0819749  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3458  zinc uptake regulator  34.62 
 
 
131 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.455544  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3510  zinc uptake regulator  34.62 
 
 
131 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11469  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  35.16 
 
 
130 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2543  ferric-uptake regulator  38.52 
 
 
187 aa  78.2  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37741  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2171  ferric uptake regulator, Fur family  36.15 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00854605  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3820  ferric uptake regulator family protein  33.07 
 
 
131 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.396621  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3150  ferric-uptake regulator  41.35 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.517881  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2085  zinc uptake regulator  33.85 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0061  zinc uptake regulator  33.33 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1599  ferric uptake regulator, Fur family  36.23 
 
 
135 aa  72.8  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1536  ferric uptake regulator, Fur family  37.19 
 
 
130 aa  72  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.451133  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7263  ferric uptake regulator family protein  31.75 
 
 
175 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0066  ferric uptake regulator, Fur family  32.79 
 
 
137 aa  72  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2717  ferric uptake regulator family protein  31.58 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1934  zinc uptake regulator  33.33 
 
 
135 aa  70.5  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395595  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2373  ferric uptake regulator, Fur family  32.56 
 
 
154 aa  70.1  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000416204 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2442  ferric uptake regulator, Fur family  32.79 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000168746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3230  ferric uptake regulator, Fur family  34.62 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0854036  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0603  ferric uptake regulator family protein  30.53 
 
 
143 aa  70.1  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0630  FUR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0885  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  33.86 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  30.23 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13670  zinc uptake regulator, Fur family  34.15 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2340  ferric uptake regulator family protein  30.95 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2638  zinc uptake regulator  31.54 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17110  zinc uptake regulator, Fur family  33.86 
 
 
138 aa  67  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184262  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1040  transcriptional regulator, Fur family  31.45 
 
 
134 aa  67  0.00000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1261  ferric uptake regulator, Fur family  33.61 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3370  ferric uptake regulator, Fur family  32.06 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.073099  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1649  ferric uptake regulator family protein  27.41 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0556503  hitchhiker  0.00120732 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0856  zinc uptake regulator  31.71 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.763265  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  27.34 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  28.99 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13650  zinc uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.357837 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1293  ferric uptake regulator family protein  27.54 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998505  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1991  ferric uptake regulator family protein  30.4 
 
 
151 aa  63.5  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0734  ferric uptake regulator, Fur family  30.08 
 
 
123 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264881  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07800  zinc uptake regulator, Fur family  29.37 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1460  ferric uptake regulator, Fur family  28.93 
 
 
161 aa  62  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4538  ferric uptake regulator family protein  30.53 
 
 
134 aa  62.4  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148082  normal  0.344615 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0045  ferric uptake regulator family protein  32.03 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  27.35 
 
 
146 aa  62  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1216  ferric uptake regulator, Fur family  25.78 
 
 
149 aa  61.6  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  28.1 
 
 
143 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1772  ferric uptake regulator, Fur family  32.5 
 
 
141 aa  61.6  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.431388  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7037  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 
150 aa  61.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0546  ferric uptake regulator family protein  23.58 
 
 
139 aa  61.2  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  26.67 
 
 
145 aa  61.6  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11800  zinc uptake regulator, Fur family  31.97 
 
 
129 aa  60.8  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00894406  normal  0.765019 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1120  FUR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
139 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.224553  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  25.78 
 
 
149 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3007  ferric uptake regulator, Fur family  27.34 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  26.02 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  27.13 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1373  ferric uptake regulator, Fur family  23.77 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000536701  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0247  ferric uptake transcriptional (FUR)-like transcription regulator protein  29.23 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.406535  normal  0.140515 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1179  Fur family ferric uptake regulator  28.8 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.462177  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0045  ferric uptake regulator, Fur family  27.05 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.4921e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  26.92 
 
 
144 aa  58.2  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  25.78 
 
 
166 aa  58.2  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  26.76 
 
 
143 aa  58.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  25.55 
 
 
154 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13391  hypothetical protein  33.33 
 
 
186 aa  57.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0940  ferric uptake regulator, Fur family  25 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  26.06 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2189  ferric uptake regulator, Fur family  27.45 
 
 
140 aa  57.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000532241  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2058  ferric uptake regulator, Fur family  28.93 
 
 
145 aa  57.4  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3944  ferric uptake regulator, Fur family  32.73 
 
 
151 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4057  ferric uptake regulator, Fur family  32.73 
 
 
151 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07451  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 
148 aa  57  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0979772 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0432  ferric uptake regulator family protein  28.45 
 
 
123 aa  57  0.00000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.089656  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0842  ferric uptake regulator, Fur family  28.69 
 
 
152 aa  57  0.00000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  25.62 
 
 
153 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0141  ferric uptake regulator, Fur family  27.56 
 
 
133 aa  56.6  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.896296  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  26.23 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3007  ferric uptake regulator family protein  24.06 
 
 
137 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.830794  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  27.21 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4458  ferric uptake regulator family protein  31.52 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.342841  hitchhiker  0.00667855 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>