More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_29341 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_29341  ferric uptake regulator family  100 
 
 		 134 aa  276  7e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2566  ferric uptake regulator family protein  67.2 
 
 		 136 aa  172  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2220  ferric uptake regulator family protein  64.46 
 
 		 134 aa  165  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.508413  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15241  ferric uptake regulator family protein  56.82 
 
 		 133 aa  165  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1033  ferric uptake regulator family  55.12 
 
 		 146 aa  157  5e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19031  ferric uptake regulator family protein  53.49 
 
 		 134 aa  154  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.442263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11321  ferric uptake regulator family protein  58.06 
 
 		 144 aa  153  6e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.948862  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11241  ferric uptake regulator family protein  56.45 
 
 		 135 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.934792  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11321  ferric uptake regulator family protein  54.62 
 
 		 144 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1041  ferric uptake regulator family protein  53.08 
 
 		 144 aa  147  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.213524  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4174  ferric uptake regulator, Fur family  47.54 
 
 		 132 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4134  ferric uptake regulator, Fur family  47.54 
 
 		 132 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0405  ferric uptake regulator family protein  45.97 
 
 		 134 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2248  ferric uptake regulator, Fur family  45.9 
 
 		 133 aa  117  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0111232 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3508  ferric uptake regulator  45.45 
 
 		 134 aa  114  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4383  ferric uptake regulator, Fur family  45.9 
 
 		 132 aa  110  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.134348 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0817  ferric uptake regulator family protein  41.94 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1953  ferric uptake regulator family protein  41.38 
 
 		 131 aa  107  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1917  ferric uptake regulator, Fur family  42.99 
 
 		 143 aa  90.9  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2745  ferric uptake regulator, Fur family  32.52 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  33.33 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  33.33 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  33.33 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2442  ferric uptake regulator, Fur family  36 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3447  zinc uptake regulator  33.88 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0819749  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3510  zinc uptake regulator  33.88 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3458  zinc uptake regulator  33.88 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.455544  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2373  ferric uptake regulator, Fur family  37.74 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000416204 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1536  ferric uptake regulator, Fur family  36.29 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.451133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1040  transcriptional regulator, Fur family  36.22 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0066  ferric uptake regulator, Fur family  33.6 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  32.52 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0546  ferric uptake regulator family protein  26.4 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  32.46 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000206726  normal  0.895859 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2638  zinc uptake regulator  36.79 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1934  zinc uptake regulator  32.79 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395595  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2543  ferric-uptake regulator  36.89 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37741  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0885  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  36.8 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  32.71 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2171  ferric uptake regulator, Fur family  33.87 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00854605  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0856  zinc uptake regulator  37.86 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.763265  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2730  ferric uptake regulator family protein  36.52 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3125  ferric uptake regulator  31.3 
 
 		 149 aa  67  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1206  ferric uptake regulator  31.3 
 
 		 149 aa  67  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000560641  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1117  ferric uptake regulator, Fur family  31.58 
 
 		 148 aa  67  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1373  ferric uptake regulator, Fur family  25.6 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000536701  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  31.4 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2939  ferric uptake regulator, Fur family  30.97 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0253838  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  34 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3820  ferric uptake regulator family protein  35.24 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.396621  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2085  zinc uptake regulator  35.92 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3150  ferric-uptake regulator  34.62 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.517881  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2152  ferric uptake regulator  30.56 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1420  FUR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0522352  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1230  FUR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0757057  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  29.25 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0630  FUR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0603  ferric uptake regulator family protein  31.11 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  33 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  33 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0833  ferric uptake regulator  33 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1690  ferric uptake regulator  32.38 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000286155  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1460  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 161 aa  63.5  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  33 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2810  ferric uptake regulator  33 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.644684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  29.03 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  36.04 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3007  ferric uptake regulator, Fur family  31.25 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  33 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  31.19 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  31.19 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  31.19 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  31.19 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  30.91 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0515  ferric uptake regulator, Fur family  31.19 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  30.91 
 
 		 143 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  31.19 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1599  ferric uptake regulator, Fur family  37.5 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  31.19 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  31.19 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  33 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000966153  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  31.19 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  31.19 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  31.19 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  30.15 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  30.91 
 
 		 143 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  30.91 
 
 		 143 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  33.96 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  31.19 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  31.19 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17110  zinc uptake regulator, Fur family  36.89 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184262  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  30.91 
 
 		 143 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  31.19 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13650  zinc uptake regulator, Fur family  35.29 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.357837 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  31.19 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  28 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11800  zinc uptake regulator, Fur family  31.4 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00894406  normal  0.765019 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0734  ferric uptake regulator, Fur family  30.33 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  34.29 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1593  ferric uptake regulator  31.43 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000083166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>