More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1953 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1953  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 
131 aa  268  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0405  ferric uptake regulator family protein  60.94 
 
 
134 aa  173  6e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3508  ferric uptake regulator  61.29 
 
 
134 aa  171  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2248  ferric uptake regulator, Fur family  62.1 
 
 
133 aa  170  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0111232 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4134  ferric uptake regulator, Fur family  57.36 
 
 
132 aa  166  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4174  ferric uptake regulator, Fur family  57.36 
 
 
132 aa  166  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4383  ferric uptake regulator, Fur family  57.26 
 
 
132 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.134348 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0817  ferric uptake regulator family protein  53.23 
 
 
130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1917  ferric uptake regulator, Fur family  46.61 
 
 
143 aa  116  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29341  ferric uptake regulator family  41.38 
 
 
134 aa  107  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1033  ferric uptake regulator family  37.9 
 
 
146 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19031  ferric uptake regulator family protein  38.33 
 
 
134 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.442263  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2220  ferric uptake regulator family protein  37.07 
 
 
134 aa  98.2  3e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.508413  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2566  ferric uptake regulator family protein  37.21 
 
 
136 aa  97.4  6e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15241  ferric uptake regulator family protein  37.9 
 
 
133 aa  95.9  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11321  ferric uptake regulator family protein  36.13 
 
 
144 aa  94  6e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.948862  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11321  ferric uptake regulator family protein  34.96 
 
 
144 aa  93.2  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11241  ferric uptake regulator family protein  35.29 
 
 
135 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.934792  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1041  ferric uptake regulator family protein  35.29 
 
 
144 aa  90.9  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.213524  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0546  ferric uptake regulator family protein  31.15 
 
 
139 aa  85.5  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1373  ferric uptake regulator, Fur family  33.6 
 
 
135 aa  82  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000536701  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3230  ferric uptake regulator, Fur family  30.77 
 
 
150 aa  80.9  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0854036  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3007  ferric uptake regulator, Fur family  31.71 
 
 
143 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3820  ferric uptake regulator family protein  32.52 
 
 
131 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.396621  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3370  ferric uptake regulator, Fur family  31.45 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.073099  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1179  Fur family ferric uptake regulator  32.23 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.462177  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1599  ferric uptake regulator, Fur family  33.06 
 
 
135 aa  75.9  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2790  ferric uptake regulator family protein  34.75 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000512773  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2340  ferric uptake regulator family protein  30.58 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3458  zinc uptake regulator  31.71 
 
 
131 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.455544  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3447  zinc uptake regulator  31.71 
 
 
131 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0819749  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3510  zinc uptake regulator  31.71 
 
 
131 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11469  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0856  zinc uptake regulator  35.29 
 
 
129 aa  73.9  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.763265  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  32.52 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  32.46 
 
 
130 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  32.46 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  30.89 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3922  ferric uptake regulator family protein  33.05 
 
 
151 aa  72  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000572819  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0515  ferric uptake regulator, Fur family  31.25 
 
 
142 aa  72  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  32.46 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  30.77 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0734  ferric uptake regulator, Fur family  33.07 
 
 
123 aa  71.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264881  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2717  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0365  ferric uptake regulator, Fur family  32.46 
 
 
150 aa  71.2  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1261  ferric uptake regulator, Fur family  30.89 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1036  transcriptional regulator, Fur family  33.05 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0163253  normal  0.210334 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4160  FUR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4001  FUR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000832394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3832  FUR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3848  FUR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000844204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4313  FUR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4224  transcriptional regulator, Fur family  33.05 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00546613  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4201  transcriptional regulator, Fur family  33.05 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0217905  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4115  transcriptional regulator, Fur family  33.05 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5116299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1040  transcriptional regulator, Fur family  32.26 
 
 
134 aa  70.5  0.000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3150  ferric-uptake regulator  33.01 
 
 
137 aa  70.1  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.517881  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11800  zinc uptake regulator, Fur family  29.84 
 
 
129 aa  69.7  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00894406  normal  0.765019 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  32.26 
 
 
143 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  31.71 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  31.71 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1934  zinc uptake regulator  34.31 
 
 
135 aa  70.1  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395595  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  30.08 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  30.09 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0045  ferric uptake regulator, Fur family  30.16 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.4921e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  30.7 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2171  ferric uptake regulator, Fur family  33.04 
 
 
133 aa  68.6  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00854605  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  29.82 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08960  ferric uptake regulator, Fur family  29.13 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  28.46 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2612  ferric uptake regulator, Fur family  30.97 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2745  ferric uptake regulator, Fur family  30.43 
 
 
138 aa  67  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1293  ferric uptake regulator family protein  31.3 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998505  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17110  zinc uptake regulator, Fur family  32.5 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184262  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  30.89 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135806  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0885  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  30.89 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7263  ferric uptake regulator family protein  31.48 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0822  ferric uptake regulator family protein  31.45 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000300093  normal  0.0104511 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1649  ferric uptake regulator family protein  31.3 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0556503  hitchhiker  0.00120732 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2259  ferric uptake regulator, Fur family  32.46 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  30.89 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1892  Fur family transcriptional regulator  29.06 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  37.01 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4545  ferric uptake regulator family protein  30.09 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  30.58 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000206726  normal  0.895859 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  30.08 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2442  ferric uptake regulator, Fur family  29.91 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000168746 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13670  zinc uptake regulator, Fur family  29.51 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2189  ferric uptake regulator, Fur family  29.51 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000532241  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1772  ferric uptake regulator, Fur family  31.4 
 
 
141 aa  63.5  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.431388  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0432  ferric uptake regulator family protein  32.17 
 
 
123 aa  62.8  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.089656  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2939  ferric uptake regulator, Fur family  29.75 
 
 
148 aa  63.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0253838  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  28.32 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2859  ferric-uptake regulator  30.71 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.141734 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4185  ferric uptake regulator, Fur family  25.2 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.421488  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  29.06 
 
 
143 aa  62  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  29.06 
 
 
143 aa  62  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  29.2 
 
 
143 aa  61.6  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  28.21 
 
 
142 aa  61.6  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1842  ferric uptake regulator  27.43 
 
 
143 aa  62  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000122874  normal  0.0218944 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  29.2 
 
 
143 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>