More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2220 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2220  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 
134 aa  277  3e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.508413  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2566  ferric uptake regulator family protein  79.84 
 
 
136 aa  216  7.999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29341  ferric uptake regulator family  64.46 
 
 
134 aa  165  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15241  ferric uptake regulator family protein  58.27 
 
 
133 aa  157  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1033  ferric uptake regulator family  56.69 
 
 
146 aa  154  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19031  ferric uptake regulator family protein  55.91 
 
 
134 aa  152  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.442263  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11321  ferric uptake regulator family protein  55.12 
 
 
144 aa  146  9e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.948862  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11241  ferric uptake regulator family protein  51.91 
 
 
135 aa  144  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.934792  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1041  ferric uptake regulator family protein  55.28 
 
 
144 aa  142  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.213524  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11321  ferric uptake regulator family protein  55.28 
 
 
144 aa  142  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4383  ferric uptake regulator, Fur family  48.31 
 
 
132 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.134348 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0405  ferric uptake regulator family protein  45.16 
 
 
134 aa  116  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1917  ferric uptake regulator, Fur family  45.08 
 
 
143 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0817  ferric uptake regulator family protein  44.44 
 
 
130 aa  108  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4134  ferric uptake regulator, Fur family  44.44 
 
 
132 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4174  ferric uptake regulator, Fur family  44.44 
 
 
132 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3508  ferric uptake regulator  45.3 
 
 
134 aa  107  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2248  ferric uptake regulator, Fur family  42.74 
 
 
133 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0111232 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1953  ferric uptake regulator family protein  37.07 
 
 
131 aa  98.2  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0546  ferric uptake regulator family protein  28.46 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2745  ferric uptake regulator, Fur family  33.85 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3007  ferric uptake regulator, Fur family  30.71 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1040  transcriptional regulator, Fur family  36.09 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0066  ferric uptake regulator, Fur family  32.23 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1536  ferric uptake regulator, Fur family  36.07 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.451133  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2543  ferric-uptake regulator  35.66 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37741  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  31.54 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3447  zinc uptake regulator  32.31 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0819749  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3458  zinc uptake regulator  32.31 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.455544  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3510  zinc uptake regulator  32.31 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11469  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  30 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  30.95 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11800  zinc uptake regulator, Fur family  35 
 
 
129 aa  64.3  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00894406  normal  0.765019 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2085  zinc uptake regulator  32.33 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  30.65 
 
 
146 aa  62.8  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2638  zinc uptake regulator  32.37 
 
 
154 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17110  zinc uptake regulator, Fur family  36.67 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184262  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2730  ferric uptake regulator family protein  35.43 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1460  ferric uptake regulator, Fur family  28.93 
 
 
161 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0856  zinc uptake regulator  35.54 
 
 
129 aa  62.8  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.763265  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  27.64 
 
 
146 aa  62  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2171  ferric uptake regulator, Fur family  34.35 
 
 
133 aa  62.8  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00854605  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1934  zinc uptake regulator  33.33 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395595  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  29.01 
 
 
153 aa  61.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0515  ferric uptake regulator, Fur family  21.31 
 
 
142 aa  61.2  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3820  ferric uptake regulator family protein  34.11 
 
 
131 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.396621  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  27.2 
 
 
154 aa  60.8  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2373  ferric uptake regulator, Fur family  33.82 
 
 
154 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000416204 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0734  ferric uptake regulator, Fur family  31.4 
 
 
123 aa  60.5  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264881  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 
143 aa  60.5  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  32.54 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0135  ferric uptake regulator, Fur family  29.63 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000297915  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0885  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  38.02 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  29.41 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  30 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0754  ferric uptake regulator family protein  29.63 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.354602  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  28.07 
 
 
166 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0101  ferric uptake regulator, Fur family  28.23 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133113  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13650  zinc uptake regulator, Fur family  35.45 
 
 
136 aa  57.8  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.357837 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  26.19 
 
 
145 aa  57.8  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1373  ferric uptake regulator, Fur family  22.73 
 
 
135 aa  57.8  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000536701  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3150  ferric-uptake regulator  36.27 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.517881  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2442  ferric uptake regulator, Fur family  33.88 
 
 
131 aa  57.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000168746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1293  ferric uptake regulator family protein  29.2 
 
 
149 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998505  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0939  ferric uptake regulator family protein  30.33 
 
 
158 aa  57.8  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2623  ferric uptake regulation protein  29.41 
 
 
143 aa  57.8  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.376677  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1599  ferric uptake regulator, Fur family  36.36 
 
 
135 aa  57.4  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  24.17 
 
 
148 aa  57.4  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  24.17 
 
 
148 aa  57.4  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7263  ferric uptake regulator family protein  33.61 
 
 
175 aa  57  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0931  ferric uptake regulator family protein  35.23 
 
 
151 aa  57  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2576  ferric uptake regulator, Fur family  33.63 
 
 
143 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.710249  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2986  ferric uptake regulator, Fur family  33.63 
 
 
143 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.105319  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0141  ferric uptake regulator, Fur family  30.51 
 
 
133 aa  57  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.896296  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07800  zinc uptake regulator, Fur family  32.61 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1230  FUR family transcriptional regulator  24.14 
 
 
139 aa  56.2  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0757057  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0616  ferric uptake regulator family protein  30.28 
 
 
142 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.740565  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  28.33 
 
 
143 aa  55.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2747  ferric uptake transcriptional repressor transcription regulator protein  33.63 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0570  ferric uptake regulator family protein  30.28 
 
 
142 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.233033 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3455  ferric uptake regulator  29.58 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114286  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3420  ferric uptake regulator  29.58 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133952  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2645  ferric uptake regulator  29.58 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  29.84 
 
 
159 aa  55.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2458  ferric uptake regulator  29.58 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3457  ferric uptake regulator  29.58 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0406  ferric uptake regulator, Fur family  29.92 
 
 
139 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2737  ferric uptake regulator family protein  30.28 
 
 
142 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348547  normal  0.830954 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1206  ferric uptake regulator  29.58 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0061  zinc uptake regulator  32.84 
 
 
142 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0166  ferric uptake regulator family protein  30.28 
 
 
142 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1234  ferric uptake regulator  29.58 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  29.31 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2189  ferric uptake regulator, Fur family  28.81 
 
 
140 aa  55.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000532241  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0544  ferric uptake regulator family protein  30.28 
 
 
142 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0596927  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0649  ferric uptake regulator family protein  30.28 
 
 
142 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0375  ferric uptake regulator  29.58 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1649  ferric uptake regulator family protein  31.01 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0556503  hitchhiker  0.00120732 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  29.91 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2593  ferric uptake regulator family protein  31.82 
 
 
142 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000283641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>