106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0273 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0273  DGPFAETKE family protein  100 
 
 
112 aa  232  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260759  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0755  YCII-related protein  51.82 
 
 
124 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5356  YCII-related protein  48.62 
 
 
113 aa  114  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2781  YCII-related protein  52.29 
 
 
112 aa  113  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.496959  normal  0.164771 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1214  YCII-related  42.2 
 
 
112 aa  94.7  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742931  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2475  hypothetical protein  43.59 
 
 
114 aa  87.8  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0163393 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0567  YCII-related protein  38.05 
 
 
111 aa  86.3  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115419  normal  0.692983 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0528  YCII-related  38.94 
 
 
114 aa  86.3  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3338  DGPFAETKE family protein  38.18 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0729969  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4313  DGPFAETKE domain-containing protein  38.04 
 
 
118 aa  63.5  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243383  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1350  hypothetical protein  33.66 
 
 
110 aa  62.8  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2534  DGPFAETKE family protein  31.82 
 
 
125 aa  62  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490619  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3346  DGPFAETKE family protein  34.55 
 
 
137 aa  60.8  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119641  normal  0.552539 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2507  YCII-related protein  46.03 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.521642  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1521  YCII-related protein  38.6 
 
 
118 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000673434 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1521  hypothetical protein  44.44 
 
 
101 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.411224 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  46.3 
 
 
118 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0960  DGPFAETKE family protein  44.44 
 
 
119 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2366  DGPFAETKE family protein  32.74 
 
 
115 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  47.83 
 
 
116 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  41.54 
 
 
122 aa  51.6  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  40.74 
 
 
114 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  40.74 
 
 
114 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1111  YCII-related  42.59 
 
 
119 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0493804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  32.32 
 
 
119 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  29.73 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0955  DGPFAETKE family protein  45.65 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  normal  0.159018 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  42.86 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5743  YCII-related protein  34.41 
 
 
118 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4175  hypothetical protein  48.84 
 
 
126 aa  47.8  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  40.74 
 
 
114 aa  47  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4928  DGPFAETKE family protein  28.85 
 
 
117 aa  46.2  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0813146 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4100  DGPFAETKE family protein  38.36 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0561  YCII-related protein  39.22 
 
 
115 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0382  YCII-related protein  43.48 
 
 
115 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00477239  decreased coverage  0.00575194 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0231  hypothetical protein  38.36 
 
 
117 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3428  DGPFAETKE domain-containing protein  39.22 
 
 
226 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5537  DGPFAETKE family protein  43.1 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3712  DGPFAETKE family protein  43.1 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555531  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0959  DGPFAETKE family protein  46.67 
 
 
119 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2256  YCII-related protein  45.65 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  38.67 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  37.66 
 
 
116 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  32.04 
 
 
126 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  40.26 
 
 
120 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  42.55 
 
 
124 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  36.59 
 
 
116 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0409  DGPFAETKE family protein  36.71 
 
 
135 aa  44.7  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00347395  normal  0.0963285 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1110  YCII-related  45.1 
 
 
119 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1007  DGPFAETKE domain-containing protein  33.33 
 
 
123 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7112  DGPFAETKE family protein  36.71 
 
 
117 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87407  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  29.9 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  41.3 
 
 
119 aa  43.9  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1553  YCII-related protein  30 
 
 
117 aa  43.9  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.374591 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2011  YCII-related protein  36.99 
 
 
114 aa  43.5  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2236  YCII-related protein  34.41 
 
 
128 aa  43.5  0.0009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.352695  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  41.67 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2285  hypothetical protein  29.25 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0910084 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0245  hypothetical protein  28.92 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4260  DGPF protein  31.58 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286045  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  47.83 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  44 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5295  DGPFAETKE domain-containing protein  31.33 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  44.68 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5384  DGPFAETKE family protein  31.33 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6623  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3965  DGPFAETKE family protein  31.91 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.34547  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  32.95 
 
 
389 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2170  YCII-related protein  45.65 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.87091  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4396  hypothetical protein  37.25 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759442  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  45.65 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  29.7 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4552  hypothetical protein  28.3 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.40507  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3811  DGPFAETKE family protein  28.3 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.276008 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3713  DGPFAETKE family protein  28.3 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.832455 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  29.7 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  51.06 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0533  DGPF domain-containing protein  29.41 
 
 
117 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4161  hypothetical protein  31.58 
 
 
123 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.78704  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  34.34 
 
 
138 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2421  DGPFAETKE domain-containing protein  34.74 
 
 
145 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5674  DGPFAETKE family protein  28.92 
 
 
135 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6650  DGPFAETKE family protein  42.5 
 
 
123 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.96352  normal  0.40787 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1747  YCII-related  43.48 
 
 
126 aa  41.6  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  29.7 
 
 
147 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  44 
 
 
144 aa  41.6  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3925  hypothetical protein  41.3 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  43.18 
 
 
119 aa  41.6  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0396  DGPFAETKE family protein  47.46 
 
 
120 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2611  DGPFAETKE family protein  32.53 
 
 
135 aa  41.2  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.089181  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  44.44 
 
 
117 aa  41.2  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0814  YCII-related protein  35.19 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.487046  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  28.32 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8876  YCII-related protein  43.24 
 
 
117 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3354  DGPFAETKE family protein  28.43 
 
 
260 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526097  normal  0.294803 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4403  DGPFAETKE family protein  31.33 
 
 
136 aa  41.2  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354347  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1915  YCII-related protein  27.71 
 
 
135 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.191468  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  41.3 
 
 
115 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4227  YCII-related protein  41.3 
 
 
110 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2336  YCII-related  24.37 
 
 
118 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000398459  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>