More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3048 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_3048  putative DNA-binding transcriptional regulator  100 
 
 		 282 aa  577  1e-164  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0712519  normal  0.0247781 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2815  putative DNA-binding transcriptional regulator  86.52 
 
 		 282 aa  505  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.901844 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2950  putative DNA-binding transcriptional regulator  86.52 
 
 		 282 aa  505  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2775  putative DNA-binding transcriptional regulator  86.52 
 
 		 282 aa  505  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2734  putative DNA-binding transcriptional regulator  86.17 
 
 		 282 aa  504  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2838  putative DNA-binding transcriptional regulator  86.17 
 
 		 282 aa  504  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02455  predicted DNA-binding transcriptional regulator  80.5 
 
 		 282 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1107  transcriptional regulator, RpiR family  80.5 
 
 		 282 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.379447  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02419  hypothetical protein  80.5 
 
 		 282 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3796  putative DNA-binding transcriptional regulator  80.5 
 
 		 282 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.796505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2714  putative DNA-binding transcriptional regulator  80.5 
 
 		 282 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2714  putative DNA-binding transcriptional regulator  80.5 
 
 		 282 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2926  putative DNA-binding transcriptional regulator  80.5 
 
 		 282 aa  465  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2846  putative DNA-binding transcriptional regulator  79.79 
 
 		 282 aa  461  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.632746  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1116  putative DNA-binding transcriptional regulator  80.14 
 
 		 282 aa  463  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3662  putative DNA-binding transcriptional regulator  64.56 
 
 		 282 aa  364  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3618  putative DNA-binding transcriptional regulator  59.57 
 
 		 279 aa  350  1e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1248  putative DNA-binding transcriptional regulator  59.57 
 
 		 279 aa  350  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.964935  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1142  putative DNA-binding transcriptional regulator  59.57 
 
 		 279 aa  350  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2584  hypothetical protein  40.46 
 
 		 282 aa  203  3e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001002  transcriptional regulator RpiR family  39.01 
 
 		 283 aa  202  4e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3122  RpiR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1252  RpiR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.102619 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2582  RpiR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02327  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.27 
 
 		 285 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02288  hypothetical protein  36.27 
 
 		 285 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1234  transcriptional regulator, RpiR family  36.62 
 
 		 285 aa  178  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2563  RpiR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2713  RpiR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 285 aa  176  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2799  transcriptional regulator, RpiR family  36.27 
 
 		 285 aa  176  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.576789  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3657  transcriptional regulator, RpiR family  35.94 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4164  RpiR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.045816  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1259  HTH-type transcription regulator, RpiR family  35.98 
 
 		 267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3802  RpiR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 306 aa  157  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0439738  decreased coverage  0.00014335 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1544  transcriptional regulator, RpiR family  32.51 
 
 		 279 aa  151  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0338  transcriptional regulator, RpiR family  34.64 
 
 		 282 aa  140  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2136  transcriptional regulator, RpiR family  28.16 
 
 		 284 aa  130  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000108566  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1662  RpiR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.574027  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0607  RpiR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 280 aa  122  5e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.173614  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0593  RpiR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 280 aa  122  5e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590128  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2756  transcriptional regulator, RpiR family  29.24 
 
 		 298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0182  RpiR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1993  transcriptional regulator, RpiR family  25.77 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1243  transcriptional regulator  27.56 
 
 		 283 aa  120  3.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.665754  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0179  RpiR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2323  putative transcriptional regulator  29.47 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1770  transcriptional regulator  27.68 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000030583  hitchhiker  0.000572207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0269  transcriptional regulator, RpiR family  29.89 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.409833  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2088  RpiR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0949278  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3077  transcriptional regulator, RpiR family  28.46 
 
 		 284 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143664 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2246  transcriptional regulator, RpiR family  28.46 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2295  RpiR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 284 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.651664  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35980  transcriptional regulator, RpiR family  29.89 
 
 		 333 aa  116  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.309329  normal  0.261129 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1776  transcriptional regulator, RpiR family  25.63 
 
 		 281 aa  115  6e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0475  transcriptional regulator, RpiR family  30.18 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1528  transcriptional regulator, RpiR family  28.46 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1162  RpiR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 270 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.164823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2581  RpiR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  hitchhiker  0.000000255705 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1200  transcriptional regulator, RpiR family  28.46 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3745  RpiR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 282 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4022  transcriptional regulator, RpiR family  27.07 
 
 		 320 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0204031  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0554  RpiR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 282 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.335525  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0250  DNA-binding transcriptional repressor RpiR  29.57 
 
 		 287 aa  108  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0580  RpiR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 282 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658912  normal  0.89076 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0875  putative transcriptional regulator, RpiR family  28.91 
 
 		 287 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0168  RpiR family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.057217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0917  putative transcriptional regulator, RpiR family  28.91 
 
 		 287 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.47337e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0782  RpiR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 287 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0731  RpiR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 287 aa  106  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0821  RpiR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 287 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1547  RpiR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 296 aa  106  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0588  RpiR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 273 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.189062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2498  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0986  putative transcriptional regulator, RpiR family  28.91 
 
 		 287 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0626  RpiR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 282 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0178  RpiR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 291 aa  106  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0176  RpiR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 282 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1122  RpiR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 285 aa  106  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0183  helix-turn-helix protein RpiR  29.41 
 
 		 291 aa  106  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0659  RpiR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 282 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.78991  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3209  RpiR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 320 aa  106  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4460  putative transcriptional regulator, RpiR family  28.91 
 
 		 287 aa  106  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.857974 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0912  RpiR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 287 aa  105  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0717  RpiR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 287 aa  105  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0731  RpiR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 287 aa  105  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1468  transcriptional regulator, RpiR family  26.15 
 
 		 286 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000610661  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3371  transcriptional regulator, RpiR family  25.47 
 
 		 281 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.00000000707391 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2984  sugar isomerase (SIS)  26.16 
 
 		 319 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7367  DNA-binding transcriptional repressor RpiR  27.55 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276033  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5684  putative transcriptional regulator, RpiR family  24.45 
 
 		 299 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.474804 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0668  RpiR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 287 aa  102  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3232  transcriptional regulator  26.34 
 
 		 274 aa  102  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0360083  normal  0.0600235 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2724  RpiR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0151  transcriptional regulator, RpiR family  28.95 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.15102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1524  transcriptional regulator  27.11 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0550  transcriptional regulator  27.01 
 
 		 284 aa  100  4e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00967802  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1297  RpiR family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 292 aa  97.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0972  transcriptional regulator, RpiR family  26.33 
 
 		 281 aa  97.4  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1406  RpiR family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 292 aa  97.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1348  transcriptional regulator, RpiR family  26.48 
 
 		 307 aa  97.4  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.478547  normal  0.506779 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>