More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0282 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_0282  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  100 
 
 
139 aa  287  3e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.220465 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03951  formate dehydrogenase-H, selenopolypeptide subunit  95.68 
 
 
715 aa  280  5.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.803476  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3913  formate dehydrogenase, alpha subunit  95.68 
 
 
715 aa  280  5.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3948  formate dehydrogenase, alpha subunit  95.68 
 
 
715 aa  280  5.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4324  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  95.68 
 
 
715 aa  280  5.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03911  hypothetical protein  95.68 
 
 
715 aa  280  5.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.988265  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4542  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  95.68 
 
 
715 aa  280  5.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2424  formate dehydrogenase, alpha subunit  76.26 
 
 
718 aa  235  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.680227 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1268  formate dehydrogenase, alpha subunit  74.1 
 
 
716 aa  231  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.424555  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2721  formate dehydrogenase, alpha subunit  74.1 
 
 
716 aa  229  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0016187  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4578  formate dehydrogenase, alpha subunit  72.66 
 
 
723 aa  225  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1781  formate dehydrogenase, alpha subunit  71.22 
 
 
716 aa  224  3e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1383  formate dehydrogenase, alpha subunit  71.22 
 
 
716 aa  220  4e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.627092  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0324  formate dehydrogenase alpha subunit  69.06 
 
 
713 aa  219  8e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3682  anaerobic formate dehydrogenase, alpha subunit, -type  67.63 
 
 
715 aa  218  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3829  formate dehydrogenase, alpha subunit  67.63 
 
 
715 aa  218  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0729  formate dehydrogenase H  67.63 
 
 
715 aa  218  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.708724 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1753  formate dehydrogenase alpha subunit  69.78 
 
 
716 aa  218  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0179443  hitchhiker  0.000996092 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00920  formate dehydrogenase alpha subunit  66.91 
 
 
737 aa  207  4e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2859  formate dehydrogenase, alpha subunit  62.32 
 
 
808 aa  196  7e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.960143 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.55 
 
 
879 aa  142  1e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  49.64 
 
 
745 aa  136  7.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0030  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  51.08 
 
 
359 aa  135  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00062453  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.2 
 
 
906 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.52 
 
 
917 aa  133  6.0000000000000005e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2032  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 subunit  47.95 
 
 
140 aa  133  8e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1029  NADH dehydrogenase I chain G  47.48 
 
 
358 aa  132  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.71 
 
 
905 aa  132  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1925  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.76 
 
 
986 aa  131  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0472  formate dehydrogenase-like protein  50 
 
 
133 aa  131  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1831  NADH dehydrogenase I chain G  45.32 
 
 
363 aa  131  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2705  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  50.35 
 
 
355 aa  131  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.48 
 
 
893 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0785  NADH dehydrogenase I chain G  48.59 
 
 
353 aa  130  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0201  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 subunit  45.89 
 
 
140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0845  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  47.1 
 
 
376 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4391  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.51 
 
 
886 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.410335  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4523  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.51 
 
 
886 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.195662  normal  0.224956 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.72 
 
 
1428 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2249  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.88 
 
 
903 aa  125  3e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.580662  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4642  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.78 
 
 
886 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0800652  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3566  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.78 
 
 
886 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0757584 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.76 
 
 
900 aa  124  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.07 
 
 
1410 aa  124  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  51.08 
 
 
724 aa  124  6e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  46.81 
 
 
1387 aa  122  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25280  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.2 
 
 
911 aa  122  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0556633 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.48 
 
 
893 aa  121  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.77 
 
 
1440 aa  121  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1544  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  43.88 
 
 
374 aa  121  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.78 
 
 
904 aa  121  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0641  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.6 
 
 
979 aa  120  5e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1856  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  43.88 
 
 
351 aa  120  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2746  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.03 
 
 
1004 aa  120  5e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94455  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0843  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.17 
 
 
994 aa  120  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.77 
 
 
1440 aa  120  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.66 
 
 
1406 aa  120  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.66 
 
 
1424 aa  120  8e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.71 
 
 
898 aa  119  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2946  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  47.14 
 
 
135 aa  119  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.750797  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.88 
 
 
901 aa  118  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.57 
 
 
686 aa  118  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.65 
 
 
886 aa  118  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0937  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.26 
 
 
1426 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137872  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2333  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.45 
 
 
984 aa  117  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2376  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.45 
 
 
984 aa  117  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.57 
 
 
893 aa  117  7.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1796  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  43.88 
 
 
135 aa  116  9e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.461798  normal  0.880254 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.85 
 
 
1421 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.45 
 
 
676 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  41.84 
 
 
899 aa  115  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0825  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.37 
 
 
1432 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00541451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3198  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.76 
 
 
1432 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.554904 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.15 
 
 
920 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.93 
 
 
674 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2023  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.14 
 
 
685 aa  114  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0303762  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.37 
 
 
1432 aa  115  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.44 
 
 
674 aa  114  5e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6354  putative formate dehydrogenase alpha subunit  38.78 
 
 
909 aa  114  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0821  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.03 
 
 
985 aa  114  5e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.366025  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  43.26 
 
 
1412 aa  114  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.14 
 
 
688 aa  114  5e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.73 
 
 
676 aa  114  6e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.34 
 
 
900 aa  113  8.999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0389  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.17 
 
 
944 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.73 
 
 
676 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  42.86 
 
 
689 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4160  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.03 
 
 
1110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.129392  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  42.96 
 
 
1385 aa  111  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.44 
 
 
674 aa  111  3e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.55 
 
 
1425 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1318  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.73 
 
 
973 aa  111  4.0000000000000004e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.88 
 
 
677 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.8 
 
 
674 aa  110  5e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  44.29 
 
 
687 aa  110  8.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.86 
 
 
925 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.57 
 
 
687 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0464  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.45 
 
 
987 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3421  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.85 
 
 
1425 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3710  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  43.07 
 
 
977 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.749683  normal  0.699855 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>