More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1544 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1544  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  100 
 
 		 374 aa  778    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0845  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  47.48 
 
 		 376 aa  338  7e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.42 
 
 		 905 aa  333  2e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0030  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  46.38 
 
 		 359 aa  332  6e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00062453  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.62 
 
 		 886 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1831  NADH dehydrogenase I chain G  41.98 
 
 		 363 aa  286  4e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1029  NADH dehydrogenase I chain G  40.91 
 
 		 358 aa  279  6e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.73 
 
 		 893 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.37 
 
 		 900 aa  276  5e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.27 
 
 		 893 aa  272  8.000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1856  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  39.04 
 
 		 351 aa  271  9e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2705  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  41.04 
 
 		 355 aa  271  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  38.85 
 
 		 899 aa  270  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.31 
 
 		 904 aa  266  4e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0785  NADH dehydrogenase I chain G  40.48 
 
 		 353 aa  266  5e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.69 
 
 		 906 aa  264  2e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.05 
 
 		 900 aa  263  3e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.74 
 
 		 917 aa  259  7e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.04 
 
 		 893 aa  257  3e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.73 
 
 		 898 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25280  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.02 
 
 		 911 aa  248  1e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0556633 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.83 
 
 		 901 aa  248  2e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2249  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.76 
 
 		 903 aa  242  9e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.580662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3920  molybdopterin oxidoreductase  36.19 
 
 		 821 aa  228  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.403816  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4004  molybdopterin oxidoreductase  35.66 
 
 		 821 aa  227  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08061e-23 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.08 
 
 		 920 aa  224  2e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4238  molybdopterin oxidoreductase  35.92 
 
 		 828 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1282  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.26 
 
 		 933 aa  220  3e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.402771 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.17 
 
 		 879 aa  220  3.9999999999999997e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0843  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.76 
 
 		 994 aa  219  6e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1341  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.29 
 
 		 987 aa  219  7e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3639  molybdopterin oxidoreductase  33.33 
 
 		 843 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.424964  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.87 
 
 		 937 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3190  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.68 
 
 		 924 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.523924  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.37 
 
 		 925 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6354  putative formate dehydrogenase alpha subunit  36.68 
 
 		 909 aa  215  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0660  molybdopterin oxidoreductase  32.53 
 
 		 822 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.672989  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0334  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit G, iron-sulphur binding protein  35.92 
 
 		 826 aa  211  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0031  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.64 
 
 		 1000 aa  211  1e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3349  NADH dehydrogenase I, G subunit, putative  35.12 
 
 		 828 aa  211  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.407234  normal  0.217544 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0509  Fe(III) reductase, alpha subunit  33.86 
 
 		 844 aa  210  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3269  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.49 
 
 		 942 aa  210  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0673  molybdopterin oxidoreductase  32.53 
 
 		 822 aa  210  4e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01358e-20 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4072  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.6 
 
 		 957 aa  209  9e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1636  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.84 
 
 		 979 aa  209  9e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.632493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1925  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.13 
 
 		 986 aa  208  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3588  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.6 
 
 		 1012 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3598  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.6 
 
 		 979 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.45 
 
 		 945 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3022  Fe(III) reductase, alpha subunit  33.6 
 
 		 831 aa  207  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2513  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.13 
 
 		 927 aa  206  5e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0190469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4582  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.67 
 
 		 989 aa  206  8e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.656955 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0464  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.58 
 
 		 987 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5043  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.67 
 
 		 989 aa  205  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.331865  normal  0.361747 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0293  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.42 
 
 		 989 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.48 
 
 		 1440 aa  204  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0344  NADH dehydrogenase I, G subunit, putative  33.42 
 
 		 826 aa  204  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3581  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.12 
 
 		 979 aa  203  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3266  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.36 
 
 		 988 aa  203  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271284  normal  0.20027 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0641  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.05 
 
 		 979 aa  203  5e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0255  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.68 
 
 		 952 aa  203  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0971632  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0937  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.11 
 
 		 1426 aa  202  6e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0661  molybdopterin oxidoreductase  32.44 
 
 		 808 aa  202  6e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5226  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.02 
 
 		 988 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3281  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.12 
 
 		 979 aa  202  7e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8358  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.02 
 
 		 988 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0505  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.34 
 
 		 980 aa  202  7e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3367  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.88 
 
 		 979 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3331  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.88 
 
 		 979 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.291632  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1109  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.76 
 
 		 963 aa  202  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.612386  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3631  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.88 
 
 		 979 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461158  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3470  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.75 
 
 		 963 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.873157  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3681  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.36 
 
 		 979 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.725199  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2058  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.65 
 
 		 967 aa  201  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.896651  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1318  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.54 
 
 		 973 aa  200  3e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2823  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.41 
 
 		 949 aa  200  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.156592  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0627  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.34 
 
 		 978 aa  200  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4710  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.34 
 
 		 978 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0502  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.85 
 
 		 980 aa  199  6e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6171  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.66 
 
 		 989 aa  199  6e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.796652 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0655  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.1 
 
 		 978 aa  199  9e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0716  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.1 
 
 		 978 aa  199  9e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0501  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  30.1 
 
 		 978 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3617  molybdopterin oxidoreductase  34.47 
 
 		 850 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2558  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.28 
 
 		 973 aa  198  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.779669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1309  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31 
 
 		 788 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0557  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.1 
 
 		 978 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0499  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  30.1 
 
 		 978 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0589  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.1 
 
 		 978 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0645  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.1 
 
 		 978 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.293395 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4097  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.67 
 
 		 959 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3636  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.1 
 
 		 959 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.234983 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3660  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.88 
 
 		 888 aa  198  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4914  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.8 
 
 		 950 aa  197  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.263268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2797  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.75 
 
 		 961 aa  197  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265518  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3926  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.15 
 
 		 924 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0450  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.87 
 
 		 984 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.858013  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2595  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.87 
 
 		 984 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.619743  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2902  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.87 
 
 		 984 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679741  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0967  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.87 
 
 		 984 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>