58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1505 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1505  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  100 
 
 		 836 aa  1737    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0609191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0791  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  67.13 
 
 		 815 aa  1100    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18940  hypothetical protein  73.09 
 
 		 908 aa  1229    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0727779 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1815  putative type IV secretory pathway VirB4 protein  34.46 
 
 		 747 aa  439  1e-121  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0914  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  32.61 
 
 		 1043 aa  395  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1287  Tn5252, Orf26  29.13 
 
 		 776 aa  355  2e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1816  truncated type IV secretory pathway VirB4 component protein  29.46 
 
 		 668 aa  290  6e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4080  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.7 
 
 		 631 aa  137  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020005  normal  0.0495521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.81 
 
 		 608 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.68 
 
 		 629 aa  123  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  24.79 
 
 		 629 aa  124  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.15 
 
 		 630 aa  120  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6728  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  26.06 
 
 		 657 aa  120  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.71 
 
 		 595 aa  111  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0714  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  23.53 
 
 		 611 aa  108  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4995  hypothetical protein  22.26 
 
 		 893 aa  105  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.124549  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2973  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.35 
 
 		 659 aa  102  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1056  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.34 
 
 		 566 aa  93.6  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000236301  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2528  AAA ATPase  23.06 
 
 		 621 aa  87  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0931  hypothetical protein  23.53 
 
 		 616 aa  85.5  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  23.79 
 
 		 569 aa  85.9  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1395  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  23.74 
 
 		 616 aa  79.3  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0290868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0132  hypothetical protein  19.49 
 
 		 699 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000387943 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0025  hypothetical protein  19.49 
 
 		 699 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1815  truncated type IV secretory pathway VirB4 component protein  33.87 
 
 		 127 aa  71.6  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0226  hypothetical protein  19.22 
 
 		 699 aa  71.2  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06770  hypothetical protein  22.26 
 
 		 495 aa  69.3  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2211  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  22.8 
 
 		 618 aa  69.3  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0179  membrane bound ATPase, putative  20 
 
 		 955 aa  68.6  0.0000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0805  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.52 
 
 		 495 aa  66.6  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  20.09 
 
 		 847 aa  66.6  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0371  F-pilin subunit assembly into extended F pili  19.12 
 
 		 809 aa  64.7  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.221651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3176  conjugation protein  21.08 
 
 		 1085 aa  64.3  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4226  hypothetical protein  22.24 
 
 		 827 aa  61.6  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0565  hypothetical protein  22.87 
 
 		 945 aa  61.2  0.00000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  23.84 
 
 		 868 aa  60.5  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00150  hypothetical protein  21.29 
 
 		 495 aa  59.7  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2948  Type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TRAC  22.42 
 
 		 841 aa  57.4  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3629  Type IV secretory pathway VirB4 protein  26.37 
 
 		 866 aa  57.4  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5522  hypothetical protein  27.62 
 
 		 516 aa  56.6  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.349353  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0028  hypothetical protein  23.39 
 
 		 858 aa  55.8  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0798103  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0177  hypothetical protein  20.94 
 
 		 696 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  23.29 
 
 		 864 aa  55.5  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1342  ATP-binding protein  26.42 
 
 		 461 aa  54.7  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0095  type IV conjugative transfer system protein TraC  23.28 
 
 		 815 aa  54.3  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1688  transfer complex protein  20.35 
 
 		 663 aa  52.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.330287  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1502  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.06 
 
 		 609 aa  52.8  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4559  hypothetical protein  25.82 
 
 		 485 aa  51.2  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.168528 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2753  hypothetical protein  22.66 
 
 		 610 aa  50.4  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4178  hypothetical protein  22.38 
 
 		 874 aa  50.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0161122 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4502  hypothetical protein  25 
 
 		 528 aa  48.9  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.689738  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1535  hypothetical protein  23.33 
 
 		 860 aa  48.1  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.324807 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0368  ATPase  23.88 
 
 		 532 aa  48.1  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0513969  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4215  hypothetical protein  24.89 
 
 		 518 aa  47  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3127  hypothetical protein  20.33 
 
 		 610 aa  47  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2964  transfer complex protein  19.93 
 
 		 711 aa  46.2  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0008  hypothetical protein  22.04 
 
 		 644 aa  45.4  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.263896  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0008  ATPase  32.63 
 
 		 645 aa  45.4  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>