More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1340 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1340  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 
669 aa  1314    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.774889 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08070  glycopeptide antibiotics resistance protein  42.93 
 
 
409 aa  294  3e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000781002 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0210  VanZ family protein  37.78 
 
 
387 aa  205  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1911  hypothetical protein  42.44 
 
 
354 aa  181  4e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0612  VanZ family protein  37.35 
 
 
361 aa  171  5e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000542073  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0647  hypothetical protein  35.28 
 
 
383 aa  162  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.716379  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0681  hypothetical protein  35.28 
 
 
383 aa  162  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.545812  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0591  hypothetical protein  35.28 
 
 
383 aa  161  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.527115  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0592  hypothetical protein  35.28 
 
 
383 aa  161  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0736  hypothetical protein  35.28 
 
 
383 aa  161  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.02924e-25 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14820  yjeF-like protein  41.18 
 
 
447 aa  160  9e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0790751 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0711  hypothetical protein  34.19 
 
 
383 aa  157  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.527264  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4625  hypothetical protein  34.19 
 
 
383 aa  153  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000286703 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0595  VanZ family protein  35.09 
 
 
384 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0808  hypothetical protein  34.48 
 
 
383 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0748  hypothetical protein  34.17 
 
 
383 aa  146  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1246  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.55 
 
 
541 aa  123  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2570  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.6 
 
 
513 aa  94.7  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0989158  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.86 
 
 
513 aa  92.4  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2774  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.34 
 
 
520 aa  89  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.966522  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  35.04 
 
 
514 aa  85.1  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  35.04 
 
 
514 aa  84  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  35.04 
 
 
514 aa  84  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  35.04 
 
 
514 aa  84  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  35.04 
 
 
514 aa  84  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0355  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.3 
 
 
500 aa  83.6  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30 
 
 
499 aa  83.6  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0489  glycopeptide antibiotics resistance protein  32.29 
 
 
344 aa  83.6  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3236  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.55 
 
 
510 aa  82.4  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.593017 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1640  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.71 
 
 
542 aa  82.8  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0283025 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  32.8 
 
 
510 aa  81.3  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  32.8 
 
 
510 aa  80.9  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  32.4 
 
 
515 aa  80.9  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  32.4 
 
 
515 aa  80.9  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  32.4 
 
 
515 aa  80.9  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  32.4 
 
 
515 aa  80.9  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  30.36 
 
 
512 aa  80.9  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.4 
 
 
515 aa  80.5  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  32.4 
 
 
510 aa  80.5  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  34.98 
 
 
514 aa  80.5  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  32.4 
 
 
515 aa  80.1  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  30.74 
 
 
499 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.94 
 
 
502 aa  79.3  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.15 
 
 
509 aa  79  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  34.03 
 
 
502 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  30.12 
 
 
488 aa  78.6  0.0000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  32.94 
 
 
519 aa  78.2  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.48 
 
 
510 aa  77.8  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3587  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.27 
 
 
496 aa  78.2  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.439263  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.92 
 
 
499 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  34.15 
 
 
502 aa  78.2  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  29.66 
 
 
513 aa  77.8  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1020  YjeF-related protein-like  30.77 
 
 
525 aa  77.8  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0522551  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1683  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.65 
 
 
467 aa  77.8  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1786  YjeF-related protein-like  31.64 
 
 
468 aa  77.4  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2019  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.73 
 
 
520 aa  77.4  0.0000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000259128  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.13 
 
 
515 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1191  YjeF-related protein-like protein  34.82 
 
 
449 aa  75.9  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0366  putative sugar kinase  29.73 
 
 
502 aa  75.5  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0491  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.62 
 
 
504 aa  74.7  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0936655  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  32.16 
 
 
462 aa  74.7  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  30.12 
 
 
486 aa  74.7  0.000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.13 
 
 
499 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  30.2 
 
 
492 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.27 
 
 
499 aa  74.3  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  34.57 
 
 
510 aa  74.3  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.98 
 
 
499 aa  73.9  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1886  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 
513 aa  73.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794004  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2531  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.75 
 
 
450 aa  73.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1332  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.92 
 
 
476 aa  73.2  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.977936  normal  0.520853 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.59 
 
 
533 aa  73.6  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  31.36 
 
 
503 aa  72.8  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  28.16 
 
 
524 aa  71.6  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  33.05 
 
 
496 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1519  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.64 
 
 
556 aa  71.6  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.025545 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.87 
 
 
494 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.57 
 
 
524 aa  71.6  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.46 
 
 
499 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0751  YjeF family protein  23.23 
 
 
463 aa  70.9  0.00000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.553827  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1878  hypothetical protein  37.7 
 
 
535 aa  71.2  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00309539  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38730  glycopeptide antibiotics resistance protein  31.82 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.2 
 
 
528 aa  70.9  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1965  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.19 
 
 
539 aa  70.9  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2650  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.03 
 
 
507 aa  70.5  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1880  YjeF-related protein  29.46 
 
 
481 aa  70.5  0.00000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.523049  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.08 
 
 
519 aa  70.1  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1401  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.8 
 
 
507 aa  70.5  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.324731  normal  0.9044 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  32.2 
 
 
513 aa  70.5  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.17 
 
 
532 aa  70.1  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.43 
 
 
500 aa  70.5  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  31.1 
 
 
508 aa  70.5  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.16 
 
 
521 aa  70.1  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  31.17 
 
 
504 aa  69.3  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0567  hypothetical protein  34.18 
 
 
496 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  31.17 
 
 
504 aa  69.3  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.08 
 
 
492 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1143  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.74 
 
 
553 aa  69.3  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1272  hypothetical protein  33.74 
 
 
496 aa  69.7  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28 
 
 
524 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  31.17 
 
 
504 aa  69.3  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>