More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_14820 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_14820  yjeF-like protein  100 
 
 		 447 aa  917    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0790751 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1099  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  51.55 
 
 		 173 aa  187  4e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.792997  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2134  hypothetical protein  56.17 
 
 		 173 aa  179  8e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000535646  normal  0.960143 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0865  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  52.25 
 
 		 184 aa  175  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0444  Uracil-DNA glycosylase superfamily  48.08 
 
 		 185 aa  156  7e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11950  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  48.48 
 
 		 172 aa  154  2e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.969798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1270  hypothetical protein  44.94 
 
 		 160 aa  145  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0254283  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1391  hypothetical protein  44.3 
 
 		 160 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1935  Mug G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  41.98 
 
 		 168 aa  144  3e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.346025  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0471  hypothetical protein  43.67 
 
 		 160 aa  144  3e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0142072  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0946  hypothetical protein  40 
 
 		 171 aa  143  6e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1263  Mug G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  44.3 
 
 		 157 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1340  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.18 
 
 		 669 aa  136  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.774889 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1246  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.53 
 
 		 541 aa  133  5e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0082  hypothetical protein  40 
 
 		 157 aa  126  7e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0526  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  41.67 
 
 		 194 aa  125  1e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4322  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  37.66 
 
 		 160 aa  116  7.999999999999999e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2433  hypothetical protein  40.12 
 
 		 168 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00350669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0825  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  33.69 
 
 		 204 aa  114  5e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0073415  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.24 
 
 		 513 aa  110  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1066  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  38.3 
 
 		 162 aa  110  6e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1313  hypothetical protein  38.36 
 
 		 168 aa  106  8e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000209173  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3816  hypothetical protein  33.93 
 
 		 188 aa  104  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.206129  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2110  hypothetical protein  35.67 
 
 		 157 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.17064 
 
 
-
 
NC_002950  PG0908  G/U mismatch-specific DNA glycosylase, putative  33.77 
 
 		 163 aa  102  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2749  hypothetical protein  36.31 
 
 		 184 aa  102  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.288888  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1733  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like  34.78 
 
 		 158 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2345  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  34.78 
 
 		 158 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3415  hypothetical protein  35.67 
 
 		 207 aa  101  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0418768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4022  hypothetical protein  36.88 
 
 		 196 aa  101  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.505375  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1017  hypothetical protein  37.24 
 
 		 159 aa  100  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.276388 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2381  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  33.33 
 
 		 158 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2366  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  34.16 
 
 		 158 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1222  hypothetical protein  36.71 
 
 		 157 aa  100  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.979198 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2261  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  33.53 
 
 		 158 aa  99.8  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.100994  normal  0.792334 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1640  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.78 
 
 		 542 aa  99.8  9e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0283025 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2486  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  35.37 
 
 		 174 aa  99  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1979  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  40 
 
 		 168 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5684  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like  35.06 
 
 		 158 aa  98.6  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.740759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3324  hypothetical protein  35.67 
 
 		 157 aa  99  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.580749 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0991  hypothetical protein  36.13 
 
 		 166 aa  97.1  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.229474 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1007  hypothetical protein  34.38 
 
 		 158 aa  96.7  8e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511889  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1320  hypothetical protein  34.38 
 
 		 158 aa  96.7  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.890852  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0291  hypothetical protein  34.38 
 
 		 158 aa  96.7  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.35138  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1160  hypothetical protein  34.38 
 
 		 158 aa  96.7  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0857  hypothetical protein  34.38 
 
 		 158 aa  96.7  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2312  hypothetical protein  34.18 
 
 		 175 aa  95.9  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1169  hypothetical protein  34.38 
 
 		 158 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3242  hypothetical protein  34.18 
 
 		 165 aa  95.1  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0957  hypothetical protein  34.38 
 
 		 158 aa  95.1  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113684  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0989  hypothetical protein  32.12 
 
 		 160 aa  95.5  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.208762  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1057  hypothetical protein  36.94 
 
 		 171 aa  94.7  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.970747  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  35.68 
 
 		 513 aa  94.7  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1247  hypothetical protein  33.76 
 
 		 175 aa  93.6  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.883347  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1066  hypothetical protein  37.01 
 
 		 196 aa  93.6  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.187825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5397  hypothetical protein  35.62 
 
 		 181 aa  92.4  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538915  normal  0.547582 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0355  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.73 
 
 		 500 aa  92.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  34.32 
 
 		 512 aa  92.4  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3216  hypothetical protein  32.19 
 
 		 180 aa  91.3  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3522  hypothetical protein  35.76 
 
 		 171 aa  91.3  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2450  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 		 477 aa  91.3  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0491  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.82 
 
 		 504 aa  91.3  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0936655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  35.02 
 
 		 488 aa  90.9  4e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2774  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.65 
 
 		 520 aa  90.1  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.966522  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2019  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.77 
 
 		 520 aa  90.1  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000259128  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0613  Uracil-DNA glycosylase superfamily  34.93 
 
 		 171 aa  89.7  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.115212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1172  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  35.97 
 
 		 168 aa  89.4  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.276296  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3440  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  37.68 
 
 		 166 aa  89.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3884  hypothetical protein  30.91 
 
 		 173 aa  88.6  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.489493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.01 
 
 		 524 aa  89  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.66 
 
 		 502 aa  89  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  37.7 
 
 		 502 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  34.53 
 
 		 486 aa  87.4  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3867  hypothetical protein  34.38 
 
 		 176 aa  87.8  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.674324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4579  hypothetical protein  32.87 
 
 		 499 aa  87.8  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.72 
 
 		 521 aa  87.4  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  29.34 
 
 		 524 aa  86.3  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2329  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.41 
 
 		 507 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896222  normal  0.257652 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  34.7 
 
 		 499 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1401  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.17 
 
 		 507 aa  86.3  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.324731  normal  0.9044 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.82 
 
 		 524 aa  86.3  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3236  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.19 
 
 		 510 aa  85.5  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.593017 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0520  hypothetical protein  28.52 
 
 		 586 aa  85.1  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.75104  decreased coverage  0.0023767 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2191  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 		 522 aa  85.1  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755695  normal  0.636409 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2560  hypothetical protein  33.18 
 
 		 519 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1868  hypothetical protein  31.21 
 
 		 185 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3313  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.49 
 
 		 499 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5131  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.47 
 
 		 500 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.94 
 
 		 517 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0921  Uracil-DNA glycosylase superfamily  31.71 
 
 		 165 aa  84  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.299989  normal  0.705929 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2204  hypothetical protein  34.39 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  34.04 
 
 		 499 aa  83.2  0.000000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0852  Uracil-DNA glycosylase superfamily  34.01 
 
 		 167 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0607293  normal  0.83582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3959  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  33.09 
 
 		 190 aa  83.2  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.306587 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3587  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.71 
 
 		 496 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.439263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1886  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.91 
 
 		 513 aa  82.8  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794004  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2373  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.87 
 
 		 507 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.01 
 
 		 499 aa  82.4  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2650  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.49 
 
 		 507 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1264  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.17 
 
 		 527 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>