76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0921 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0921  Uracil-DNA glycosylase superfamily  100 
 
 		 165 aa  333  5.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.299989  normal  0.705929 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0852  Uracil-DNA glycosylase superfamily  81.71 
 
 		 167 aa  272  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0607293  normal  0.83582 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2505  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  72.73 
 
 		 164 aa  249  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.635116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0856  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  99.21 
 
 		 137 aa  249  9.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.893895  normal  0.15216 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2341  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  76.54 
 
 		 167 aa  248  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557164  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0934  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  67.76 
 
 		 155 aa  209  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.242061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3440  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  55.49 
 
 		 166 aa  172  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3959  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  57.67 
 
 		 190 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.306587 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1172  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  54.04 
 
 		 168 aa  167  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.276296  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3324  hypothetical protein  53.59 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.580749 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1222  hypothetical protein  53.59 
 
 		 157 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.979198 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2110  hypothetical protein  50.97 
 
 		 157 aa  149  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.17064 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0991  hypothetical protein  51.27 
 
 		 166 aa  147  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.229474 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5684  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like  52.23 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.740759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2345  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  50 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1733  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like  50 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0857  hypothetical protein  51.28 
 
 		 158 aa  141  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1160  hypothetical protein  51.28 
 
 		 158 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1007  hypothetical protein  51.28 
 
 		 158 aa  141  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511889  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0291  hypothetical protein  51.28 
 
 		 158 aa  141  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.35138  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1320  hypothetical protein  51.28 
 
 		 158 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.890852  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1169  hypothetical protein  51.28 
 
 		 158 aa  141  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0957  hypothetical protein  51.28 
 
 		 158 aa  140  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2366  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  49.36 
 
 		 158 aa  140  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2261  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  50 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.100994  normal  0.792334 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2381  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  50 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2433  hypothetical protein  46.45 
 
 		 168 aa  136  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00350669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2749  hypothetical protein  50.32 
 
 		 184 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.288888  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3867  hypothetical protein  47.02 
 
 		 176 aa  133  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.674324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3415  hypothetical protein  49.68 
 
 		 207 aa  131  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0418768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2312  hypothetical protein  48.32 
 
 		 175 aa  130  7.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1057  hypothetical protein  42.94 
 
 		 171 aa  129  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.970747  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0613  Uracil-DNA glycosylase superfamily  41.14 
 
 		 171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.115212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0737  hypothetical protein  50 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2204  hypothetical protein  42.38 
 
 		 162 aa  124  8.000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0908  G/U mismatch-specific DNA glycosylase, putative  45.45 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3216  hypothetical protein  45.7 
 
 		 180 aa  121  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4022  hypothetical protein  43.48 
 
 		 196 aa  120  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.505375  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3242  hypothetical protein  44.31 
 
 		 165 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3816  hypothetical protein  44.58 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.206129  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5397  hypothetical protein  48.37 
 
 		 181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538915  normal  0.547582 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4322  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  36.42 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3522  hypothetical protein  46 
 
 		 171 aa  116  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3884  hypothetical protein  40.12 
 
 		 173 aa  114  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.489493  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1247  hypothetical protein  43.83 
 
 		 175 aa  108  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.883347  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1979  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  35.98 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1066  hypothetical protein  44.81 
 
 		 196 aa  107  9.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.187825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1066  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  33.55 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4453  hypothetical protein  38.71 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.497165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1868  hypothetical protein  35.26 
 
 		 185 aa  104  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2486  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  39.38 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1017  hypothetical protein  37.42 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.276388 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1313  hypothetical protein  34.38 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000209173  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3950  hypothetical protein  37.58 
 
 		 165 aa  99  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4024  hypothetical protein  37.58 
 
 		 165 aa  99  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0189613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3964  hypothetical protein  37.58 
 
 		 165 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0376282 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0989  hypothetical protein  35.25 
 
 		 160 aa  92.8  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.208762  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1099  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  33.97 
 
 		 173 aa  92  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.792997  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0526  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  35.92 
 
 		 194 aa  85.9  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0946  hypothetical protein  30.43 
 
 		 171 aa  85.5  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2242  hypothetical protein  34.69 
 
 		 155 aa  84.7  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14820  yjeF-like protein  31.71 
 
 		 447 aa  84  9e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0790751 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1935  Mug G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  29.81 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.346025  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11950  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  33.97 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.969798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0865  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  35.76 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2134  hypothetical protein  34.16 
 
 		 173 aa  77.8  0.00000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000535646  normal  0.960143 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0082  hypothetical protein  32.61 
 
 		 157 aa  77  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0825  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  26.13 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0073415  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1263  Mug G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  29.56 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1270  hypothetical protein  31.06 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0254283  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0471  hypothetical protein  29.81 
 
 		 160 aa  70.5  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0142072  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1391  hypothetical protein  27.33 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03098  T/U mismatch-specific DNA glycosylase  41.51 
 
 		 121 aa  67  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0444  Uracil-DNA glycosylase superfamily  28.26 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47529  predicted protein  24.71 
 
 		 466 aa  52.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1611  hypothetical protein  25.22 
 
 		 217 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>