83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0444 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0444  Uracil-DNA glycosylase superfamily  100 
 
 		 185 aa  385  1e-106  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2134  hypothetical protein  49.38 
 
 		 173 aa  160  9e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000535646  normal  0.960143 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14820  yjeF-like protein  48.08 
 
 		 447 aa  156  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0790751 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1099  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  47.13 
 
 		 173 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.792997  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0865  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  44.51 
 
 		 184 aa  139  3e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1263  Mug G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  40.26 
 
 		 157 aa  134  9e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0471  hypothetical protein  41.36 
 
 		 160 aa  131  6e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0142072  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1270  hypothetical protein  40.74 
 
 		 160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0254283  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1391  hypothetical protein  40.74 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1935  Mug G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  40.65 
 
 		 168 aa  124  6e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.346025  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0946  hypothetical protein  39.49 
 
 		 171 aa  124  7e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11950  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  41.51 
 
 		 172 aa  122  4e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.969798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0526  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  42.57 
 
 		 194 aa  122  4e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0082  hypothetical protein  37.5 
 
 		 157 aa  118  3.9999999999999996e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0825  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  32.29 
 
 		 204 aa  105  5e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0073415  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4322  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  34.64 
 
 		 160 aa  101  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1247  hypothetical protein  36.47 
 
 		 175 aa  97.8  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.883347  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1868  hypothetical protein  35.06 
 
 		 185 aa  93.2  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2204  hypothetical protein  36.18 
 
 		 162 aa  91.7  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1313  hypothetical protein  34.25 
 
 		 168 aa  88.2  6e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000209173  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1066  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  34.31 
 
 		 162 aa  85.5  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1979  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  32.41 
 
 		 168 aa  84.7  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3959  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  29.41 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.306587 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2433  hypothetical protein  31.76 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00350669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2381  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  29.22 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2261  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  29.22 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.100994  normal  0.792334 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2486  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  32.5 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1017  hypothetical protein  32.26 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.276388 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2366  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  30.77 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1733  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like  30.77 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2345  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like protein  30.77 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0908  G/U mismatch-specific DNA glycosylase, putative  31.69 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0613  Uracil-DNA glycosylase superfamily  30.13 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.115212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2749  hypothetical protein  31.01 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.288888  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3415  hypothetical protein  31.01 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0418768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2110  hypothetical protein  32.17 
 
 		 157 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.17064 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0957  hypothetical protein  31.47 
 
 		 158 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113684  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3242  hypothetical protein  34.67 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3324  hypothetical protein  33.57 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.580749 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1057  hypothetical protein  29.76 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.970747  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0291  hypothetical protein  31.25 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.35138  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1160  hypothetical protein  31.25 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0857  hypothetical protein  31.25 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1007  hypothetical protein  31.25 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511889  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1320  hypothetical protein  31.25 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.890852  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3867  hypothetical protein  29.88 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.674324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5684  G-T/U mismatch-specific DNA glycosylase-like  27.52 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.740759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3884  hypothetical protein  31.41 
 
 		 173 aa  74.7  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.489493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3440  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  30.77 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3522  hypothetical protein  35.42 
 
 		 171 aa  74.3  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2341  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  34.29 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557164  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1169  hypothetical protein  30.56 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1172  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  25.62 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.276296  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0989  hypothetical protein  28.99 
 
 		 160 aa  72  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.208762  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4453  hypothetical protein  28.57 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.497165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3816  hypothetical protein  26.9 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.206129  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1222  hypothetical protein  32.87 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.979198 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0991  hypothetical protein  31.37 
 
 		 166 aa  70.9  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.229474 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1066  hypothetical protein  32.47 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.187825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2312  hypothetical protein  30.43 
 
 		 175 aa  70.1  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4022  hypothetical protein  27.75 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.505375  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3216  hypothetical protein  29.45 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0934  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  31.91 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.242061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5397  hypothetical protein  31.61 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538915  normal  0.547582 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2242  hypothetical protein  28.97 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3964  hypothetical protein  29.2 
 
 		 165 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0376282 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4024  hypothetical protein  29.2 
 
 		 165 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0189613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3950  hypothetical protein  29.2 
 
 		 165 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0737  hypothetical protein  30.5 
 
 		 158 aa  60.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0852  Uracil-DNA glycosylase superfamily  28.47 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0607293  normal  0.83582 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0921  Uracil-DNA glycosylase superfamily  28.26 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.299989  normal  0.705929 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2505  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  30.07 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.635116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0576  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  26.83 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1966  hypothetical protein  25.4 
 
 		 239 aa  44.7  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.73839  hitchhiker  0.000135585 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1718  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  34.67 
 
 		 195 aa  43.9  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.187997  normal  0.135819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6055  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.34 
 
 		 297 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3398  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  30.38 
 
 		 168 aa  41.2  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0915177  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3402  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  30.38 
 
 		 168 aa  41.2  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3466  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  30.38 
 
 		 168 aa  41.2  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000367994 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3474  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  40 
 
 		 168 aa  41.2  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.14265  normal  0.104985 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3472  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  30.38 
 
 		 168 aa  41.2  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.189188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3568  G/U mismatch-specific DNA glycosylase  30.38 
 
 		 168 aa  41.2  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.331488 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1611  hypothetical protein  23.42 
 
 		 217 aa  40.8  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>